普通轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序適用于哪些情況？普通轉(zhuǎn)錄組測序主要適用于兩大類：一是不同的生長階段或者發(fā)育過程；二是不同的環(huán)境、藥物、病原菌等逆境脅迫處理。轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序必須做生物學(xué)重復(fù)么？需要幾個重復(fù)？生物學(xué)重復(fù)是生物實驗所必須的，轉(zhuǎn)錄組測序也不例外，至少3次生物學(xué)重復(fù)。準(zhǔn)備...

轉(zhuǎn)錄組分析是目前應(yīng)用比較廣的高通量測序分析技術(shù)之一。常見設(shè)計是不同樣品之間比較，尋找差異基因、標(biāo)志基因、協(xié)同變化基因、差異剪接和新轉(zhuǎn)錄本，并進行結(jié)果可視化、功能注釋和網(wǎng)絡(luò)分析等。轉(zhuǎn)錄組的測序分析也相對成熟，從RNA提取、構(gòu)建文庫、上機測序再到結(jié)果解析既可以自己...

蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)：乙?；揎検求w內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對細胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。此外，還存在大量的非組蛋白乙?；揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。乙酰化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?；b定的影...

GC-MS非靶向與代謝組學(xué)的關(guān)系？代謝組學(xué)是運用多種技術(shù)手段，研究生物體系中小分子代謝物（包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質(zhì)等）的種類、數(shù)量及變化規(guī)律的科學(xué)，是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學(xué)是對生物體內(nèi)源性代謝物進行系統(tǒng)全方面的分析平...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾的檢測方法：質(zhì)譜是蛋白質(zhì)翻譯后修飾檢測的常用技術(shù)之一，可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。蛋白質(zhì)翻譯后修飾（post-translational modifications，PTMs），如磷酸化、乙酰化、泛素化、SUMO化、糖基化等，大幅度的增...

靶向代謝組學(xué)：靶向代謝組學(xué)（Targeted Metabolomics）是代謝組學(xué)研究的重要組成部分，也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言，靶向代謝組分析具有特異性強，檢測靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個特點。通過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)和基因組學(xué)目前有實用價值嗎?二者實用價值非常大，尤其是對有瘤的患者的醫(yī)治，簡直顛覆了傳統(tǒng)醫(yī)治的模式。轉(zhuǎn)錄組和基因組月在生物學(xué)研究中有著重要價值。例如研究某個基因功能的時候，可以構(gòu)建該基因的敲除或者過表達生物，然后對比野生型進行轉(zhuǎn)錄組分析看看該基因涉及什...

蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)：乙?；揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對細胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。此外，還存在的非組蛋白乙?；揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?；b定的影響，再結(jié)合免疫共沉淀通過抗體富集乙...

代謝組學(xué)研究方法： 對于代謝產(chǎn)物來說，不只只有質(zhì)譜峰這個特征。更進一步說，質(zhì)譜（MS）并不能檢測出所有的代謝產(chǎn)物，并不是因為質(zhì)譜的靈敏度不夠，而是由于質(zhì)譜只能檢測離子化的物質(zhì)，但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振（NMR）的方法，可以彌補色譜的不...

翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析：在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中，蛋白會首先被酶切成肽段，然后進入質(zhì)譜進行分析。通過質(zhì)譜分析，得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息。對于某一個特定肽段而言，在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下，其序列信息和分子量是確定的。當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修...

靶向代謝組學(xué)：靶向代謝組學(xué)（Targeted Metabolomics）是代謝組學(xué)研究的重要組成部分，也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言，靶向代謝組分析具有特異性強，檢測靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個特點。通過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特...

蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的類型：翻譯后修飾的類型包括N端fMet或Met的去除、二硫鍵的形成、化學(xué)修飾和肽鍵的裂解，其中磷酸化是比較常見的。蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾反應(yīng)是在維持蛋白質(zhì)的完整性和功能性的基礎(chǔ)上，通過基于其氨基酸殘基的化學(xué)反應(yīng)獲得新的生物結(jié)合物。翻譯后修飾在哪...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)：蛋白質(zhì)翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團，可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì)，進而影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和活性狀...

代謝組學(xué)的研究對象與層次有哪些？一般來說，代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對象和目的不同，科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個層次：代謝物靶標(biāo)分析：某一個或幾個特定組分的定性和定量分析，如某一類結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物（氨基酸...

定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)主要分為標(biāo)記（label）和非標(biāo)記（labelfree）定量策略，標(biāo)記策略又分為體內(nèi)標(biāo)記和體外標(biāo)記兩種。細胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進程中，常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達異常...

PRM靶向蛋白組學(xué)：PRM技術(shù)是一種根據(jù)已知實測信息或質(zhì)譜檢測規(guī)律的假定信息對樣品中的蛋白質(zhì)進行靶向定量的技術(shù)。該技術(shù)主要應(yīng)用儀器為QExactive系列質(zhì)譜儀，首先以四極桿作為質(zhì)量過濾器，特異性地選擇與預(yù)先設(shè)定質(zhì)荷比相同的肽段離子（母離子）通過，隨后在高能碰...

代謝組學(xué)樣本收集植物組織：葉片、莖、花：1）取整片葉片/一段莖/一朵花，放入離心管或錫箔紙中并標(biāo)記，迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中（每組一袋），在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。3）迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足...

轉(zhuǎn)錄組分析是目前應(yīng)用比較廣的高通量測序分析技術(shù)之一。常見設(shè)計是不同樣品之間比較，尋找差異基因、標(biāo)志基因、協(xié)同變化基因、差異剪接和新轉(zhuǎn)錄本，并進行結(jié)果可視化、功能注釋和網(wǎng)絡(luò)分析等。轉(zhuǎn)錄組的測序分析也相對成熟，從RNA提取、構(gòu)建文庫、上機測序再到結(jié)果解析既可以自己...

單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)基本概念：普通轉(zhuǎn)錄組的思路也可以應(yīng)用到單細胞轉(zhuǎn)錄組。普通轉(zhuǎn)錄組相當(dāng)于把一群細胞混合到一起去提取RNA，獲得的是每個細胞中RNA表達量的平均值。單細胞是把每個細胞單獨分出來去提取RNA，然后建庫測序，獲得是是單個細胞的表達值。在每個細胞里面基因的表...

單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)：單細胞轉(zhuǎn)錄組目前主要有三種方法：SMART擴增技術(shù)、10×genomics技術(shù)及Andeplete技術(shù)。SMART擴增技術(shù)比較關(guān)鍵的技術(shù)，就是設(shè)計了2個特殊的引物。再配合用MMLV逆轉(zhuǎn)錄酶進行逆轉(zhuǎn)錄。特殊引物1由中間PolyT序列加上一段通...

蛋白磷酸化修飾過程：蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化，將磷酸基團從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸，或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過程是可逆的，去磷酸化反應(yīng)由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測方法：Western Blot檢測方法：Western...

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)：蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性，以及磷酸基團的供體ATP的易得性，使得磷酸化修飾被真核細胞所選擇接受成為一種比較普遍的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程，幾乎調(diào)...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)：隨著越來越多的基因組序列相繼被測定,生命科學(xué)的研究進入了后基因組時代,各類組學(xué)技術(shù)得到迅速地發(fā)展與普遍地應(yīng)用包括以基因為研究對象的基因組學(xué)(Genomics)、以轉(zhuǎn)錄過程為研究對象的轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Transcriptomics)。意義：1．轉(zhuǎn)錄組譜可以提...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)：翻譯后修飾自下而上分析策略：自下而上蛋白質(zhì)組學(xué)是一種基于肽段分析的技術(shù)。對于不同類型的翻譯后修飾，具體的分析策略存在差異。蛋白質(zhì)的糖基化具有異質(zhì)性。不同的糖鏈可以連接到同一位點上，不同位點可以連接到同一蛋白質(zhì)上的不同糖鏈上。糖基化的異質(zhì)性...

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些？1、疾病機制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細胞代謝組學(xué)研究。7、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少？不同檢測平臺的靈敏度不一樣，靈敏度比較高，可達...

蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)：乙?；揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對細胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。此外，還存在的非組蛋白乙酰化修飾參與了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?；b定的影響，再結(jié)合免疫共沉淀通過抗體富集乙...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)（Transcriptome）廣義上指某一生理條件下，細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的匯合，包括信使RNA(mRNA)、核糖體RNA(rRNA)、轉(zhuǎn)運RNA(tRNA)及非編碼RNA(ncRNA)；狹義上指所有mRNA的匯合。轉(zhuǎn)錄組具有很強的時間和空間特性，是基因...

我國科學(xué)家已經(jīng)在重大疾病如肝病、維甲酸誘導(dǎo)白血病細胞凋亡啟動模型及維甲酸定向誘導(dǎo)胚胎干細胞向神經(jīng)系統(tǒng)分化的模型等比較蛋白質(zhì)組研究以及一些重要生理和病理體系的蛋白質(zhì)組成分研究方面獲得了重要成就。蛋白質(zhì)組學(xué)的重要應(yīng)用領(lǐng)域有：在臨床疾病中的應(yīng)用、在微生物蛋白質(zhì)組學(xué)中...

circRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)生物學(xué)功能：circRNA主要存在于細胞質(zhì)或外泌體中，具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。近幾年，大量的研究表明circRNA在生物的生長發(fā)育、脅迫應(yīng)答、疾病發(fā)生和發(fā)展等方面密切相關(guān)，并預(yù)測其在疾病診斷標(biāo)記物等方面的應(yīng)...

PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)：產(chǎn)品分類：a.相對定量(目的同WB)。b.一定定量(目的同Elisa)。技術(shù)優(yōu)勢：（1）無需抗體，可直接對樣本中目標(biāo)蛋白質(zhì)進行定量分析。（2）高特異性、準(zhǔn)確度和靈敏度，靶向檢測目標(biāo)蛋白對應(yīng)的多個unique肽段。（3）通量高，可以同時實現(xiàn)...