Label Free 非標記定量蛋白質(zhì)組學技術優(yōu)點：無需標記，比較大程度的保留樣本的真實性；可以區(qū)分“有”、“無”蛋白；不受標簽數(shù)量的限制，多個樣本可以同時進行蛋白定量分析；不同物種和不同的樣本類型可以同時開展蛋白定量分析；處理步驟簡單，成本低。 DIA 定量...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學技術原理：首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物，然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進行組分分離以降低樣本復雜程度，然后通過高質(zhì)量的修飾類抗體和生物材料對修飾肽段進行富集，之后上樣至液相色譜 - 串聯(lián)質(zhì)譜中進行分析，通過相應的數(shù)據(jù)庫檢索匹配，一次...

全長轉(zhuǎn)錄組學測序：由于在轉(zhuǎn)錄組研究中通常所使用的第二代測序技術具有測序讀長的限制，因此在進行測序之前，需要先將樣本的mRNA打碎為小片段，之后再通過與參考基因組比對或拼接的方式識別轉(zhuǎn)錄本，這就會造成一定的錯誤比例，同時在也很難區(qū)分單堿基水平的差異。全長轉(zhuǎn)錄組測...

代謝組學的研究領域有哪些？1、疾病機制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細胞代謝組學研究。7、微生物代謝組學研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少？不同檢測平臺的靈敏度不一樣，靈敏度比較高，可達...

蛋白質(zhì)組學研究應用：近年來蛋白質(zhì)組研究技術已被應用到各種生命科學領域，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍，涉及到各種重要的生物學現(xiàn)象，如信號轉(zhuǎn)導、細胞分化、蛋白質(zhì)折疊等。生物信息學的發(fā)展已給蛋白質(zhì)組研究提供了更方便、有效的計算機分析軟件，隨著基因組...

蛋白質(zhì)組學主要以全蛋白組（組織、細胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象，通過對蛋白組進行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學功能、作用機制、疾病診斷的標志物以及預測蛋白的上、下游變化關系。蛋白質(zhì)組學可以克服核酸水...

蛋白質(zhì)組學的分析介紹：蛋白質(zhì)組學的分析主要指蛋白的生信分析，依賴于數(shù)據(jù)庫的建立?，F(xiàn)在常用的蛋白質(zhì)組學生信分析有GO功能分析和KEGG通路分析。GO（gene ontology）是基因本體聯(lián)合會（Gene Onotology Consortium）所建立的數(shù)據(jù)庫...

蛋白質(zhì)組學樣品寄樣要求：動物組織的樣本蛋白量相對較高，送樣量的要求也相對比較寬松，一般提供50~100mg的量即可。此外，組織上有血跡、脂肪、結(jié)締組織的還需要用PBS和組織剪將其清理干凈。送樣前將樣品用液氮速凍5min，放置在-80℃保存，送樣時需要置于干冰環(huán)...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾加入的官能團反應有：1、乙酰化——通常于蛋白質(zhì)的N末端加入乙酰。2、烷基化——加入如甲基或乙基等烷基。3、甲基化——烷基化中常見的一種，在賴氨酸、精氨酸等的側(cè)鏈氨基上加入甲基。4、生物素化——用生物素附加物令保存的賴氨酸?；?、谷氨酸化——在...

轉(zhuǎn)錄組測序推薦的測序數(shù)據(jù)量？轉(zhuǎn)錄組測序所需數(shù)據(jù)量與所研究物種的基因組大小有關，基因組越大，則所需數(shù)據(jù)量越大。按照我們的經(jīng)驗來說：常規(guī)物種一般建議6G數(shù)據(jù)即可；基因組較大的物種推薦8G以上數(shù)據(jù)，比如：小麥建議10G數(shù)據(jù)起，甘蔗、甘薯建議至少8G數(shù)據(jù)。轉(zhuǎn)錄組測序必...

宏轉(zhuǎn)錄組分析：從以G為單位的高通量測序數(shù)據(jù)中獲取研究所需的微生物種類、基因、通路等信息是進行宏轉(zhuǎn)錄組研究必須經(jīng)歷的一步?，F(xiàn)在網(wǎng)絡上分析組學數(shù)據(jù)的工具五花八門。能否從眾多組學工具中選擇出適合分析宏轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的軟件，能否搭建一套完整、快速、高效、靈敏、高精確的宏轉(zhuǎn)...

蛋白組究竟研究原因：首先，由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在，RNA的表達量與實際對應蛋白質(zhì)的含量相關性并不高，就簡單地測試了酵母中mRNA和對應蛋白質(zhì)的定量相關性，結(jié)果是，低豐度蛋白與mRNA的相關性尤其低，而高豐度蛋白和其mRNA的相關性則高，經(jīng)過平均后r值只...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點分析時應該注意些什么問題？覆蓋率：覆蓋率越高，檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率：被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低，則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高（> 30％），則有助于識別修飾位點。棕櫚?；鞍?..

蛋白質(zhì)組學植物篇樣品寄樣要求：植物相較于動物，蛋白占比不高，所以送樣在量上面的要求會多一些，推薦送500mg以上的量可以確保實驗能夠提取到充足的蛋白。如果是種仁、豆類等蛋白含量比較高的，200mg足以完成抽提。處理樣本需要用PBS將樣本表面的泥土等雜質(zhì)沖洗干凈...

轉(zhuǎn)錄組學應用領域：海洋水產(chǎn)：生長發(fā)育機制，漁業(yè)資源，漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等；微生物：致病機理，耐藥機制，病原體-宿主相互作用研究等；生物醫(yī)藥：生物標志物，疾病機理機制，疾病分型，藥物開發(fā)，個性化醫(yī)治等；環(huán)境科學：發(fā)酵過程優(yōu)化，生物燃料生產(chǎn)，環(huán)境危害風險評估研究...

蛋白質(zhì)組學技術方法：等電聚焦：等電聚焦（isoelectric focusing，IEF）是一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點不同的蛋白質(zhì)的電泳技術。等電聚焦凝膠電泳依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點進行分離，等電聚焦中，蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個連...

蛋白質(zhì)組學是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學。蛋白質(zhì)組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益，是生命科學進入后基因時代的特征。蛋白質(zhì)是生命存在和運動的物質(zhì)基礎，是細胞增殖、分化、衰老和凋亡等...

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學技術原理：盡管質(zhì)譜儀器的分析能力近年來有了長足的發(fā)展，但是由于蛋白翻譯后修飾化學計量值低、復雜性大，直接將蛋白組(如全細胞裂解產(chǎn)物，組織勻漿產(chǎn)物或全血清蛋白)的酶解肽段送入質(zhì)譜鑒定和定量PTM是非常困難的。因此，很多翻譯后修飾的富集方法會被...

乙?；揎椀鞍捉M學簡介：乙?；前岩环N乙酰官能基團添加到另一種有機化合物上，并進行結(jié)合的過程。乙?；彩羌毎麅?nèi)蛋白質(zhì)翻譯后修飾的一種重要形式，其主要發(fā)生在組蛋白賴氨酸上，是由組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶 (HATs) 催化的，其反過程去乙?；山M蛋白去乙酰酶 (Histo...

4D定量蛋白質(zhì)組學 ：目前，蛋白質(zhì)組學質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時間（retention time）、質(zhì)荷比（m/z）、離子強度（intensity）這三個維度對肽蛋白質(zhì)進行鑒定和定量，即3D蛋白質(zhì)組學。4D蛋白質(zhì)組學在3D蛋白質(zhì)組學的基礎之上增加了第四維度，離子...

翻譯后修飾蛋白組分析：蛋白質(zhì)翻譯后修飾（PTMs）是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后的化學修飾過程。蛋白質(zhì)翻譯后修飾（PTMs）通過給蛋白質(zhì)添加磷酸酯、乙酸酯、酰胺基或甲基等官能團增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性，并影響正常細胞生物學和發(fā)病機理的幾乎所有方面。蛋白質(zhì)翻譯后修飾...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析策略：早期蛋白質(zhì)組研究的大部分工作集中在細胞生長的不同時期，或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質(zhì)表達水平的變化。然而，許多生命過程不僅受蛋白質(zhì)的相對豐度控制，還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制。因此，揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質(zhì)復雜性和多樣的...

什么是轉(zhuǎn)錄組測序？轉(zhuǎn)錄組廣義上指在某一生理條件下，細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)物的組合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狹義上指所有mRNA的組合。轉(zhuǎn)錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，主要包括mRNA和ncRNA。轉(zhuǎn)錄組...

轉(zhuǎn)錄組學研究的方法：轉(zhuǎn)錄組學是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學科。在早期，由于測序價格昂貴、基因序列數(shù)目有限，轉(zhuǎn)錄組學研究者只能進行極少數(shù)特定基因的結(jié)構功能分析和表達研究。近十幾年，分子生物學技術的快速發(fā)展使高通量分析成為可能，這為真正...

什么叫轉(zhuǎn)錄組？廣義轉(zhuǎn)錄組是指生命單元(通常是一種細胞)中所有按基因信息單元轉(zhuǎn)錄和加工的RNA分子(包括編碼和非編碼RNA功能單元),或者是一個特定細胞所有轉(zhuǎn)錄本的總和.它的研究對象就是這些RNA與蛋白質(zhì)分子和它們所組成的基因功能網(wǎng)絡以及它們與細胞功能的關系.而...

蛋白翻譯后修飾位點鑒定：蛋白質(zhì)翻譯后修飾（Post-Translational Modifications, PTMs）幾乎參與了細胞所有正常生命活動的過程，并發(fā)揮十分重要的調(diào)控作用。蛋白質(zhì)修飾位點能夠影響蛋白的多種屬性，包括蛋白質(zhì)折疊、活性以及之后的功能，對...

circRNA轉(zhuǎn)錄組學生物學功能：circRNA主要存在于細胞質(zhì)或外泌體中，具有組織特異性、疾病特異性、時序特異性及高穩(wěn)定性等特征。近幾年，大量的研究表明circRNA在生物的生長發(fā)育、脅迫應答、疾病發(fā)生和發(fā)展等方面密切相關，并預測其在疾病診斷標記物等方面的應...

蛋白質(zhì)組學介紹：蛋白質(zhì)組學，指對某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)及其特征進行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究，以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復雜的生命活動的分子網(wǎng)絡。研究的內(nèi)容主要包括：組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細胞定位和三維...

蛋白質(zhì)組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用？作為主要研究策略的蛋白質(zhì)組學:這與題目中的描述更相關些，蛋白質(zhì)組學是研究中的關鍵方法(甚至是唯1方法)。具體而言，蛋白質(zhì)組學在此類應用中，更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質(zhì)組學:事實上，在當前的生...

單細胞 RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學的工作流程：單細胞 RNA 測序等高通量單細胞轉(zhuǎn)錄組學技術通常從針對不同瘤和組織類型（解離、分選和分離細胞等）量身定制的實驗工作流程開始，然后產(chǎn)生可以比對的序列，量化、質(zhì)量控制 (QC) 過濾和以不同方式標準化，以實現(xiàn)許多下游計算...