靶向代謝組學分析成功的關鍵因素是準確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測 (SIM)，或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應離子監(jiān)測 (MRM) 進行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度，...

我們究竟怎么研究蛋白質組學呢？抗體免疫的方法呢，其實就是ELISA，Western及蛋白質芯片。通過合成大量蛋白質特異的抗體，能夠進行定性檢測及相對定量分析，只要你有好用的抗體，那么就可以通過免疫反應讓抗體快速的識別你感興趣的蛋白質，然后用例如HRP發(fā)光等標記...

蛋白磷酸化修飾過程：蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化，將磷酸基團從ATP轉移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸，或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過程是可逆的，去磷酸化反應由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測方法：Western Blot檢測方法：Western...

代謝組學疾病診斷應用： 代謝組學研究人員已經對此進行了研究。新生兒是否缺失酶基因，可以在出生時就檢測出來?？蓹z測出包括涉及合成途徑中的基本成分（如氨基酸）的酶。酶缺失的結果就是相應的代謝產物過少或過多。尿癥（PKU）是一種常見的嬰兒疾病。這種疾病是由于缺失將苯...

蛋白質乙?；揎椂x：蛋白質在細胞中經過翻譯后，到被運輸到相應的細胞器并且發(fā)生特定的生物學作用前會經過很重要的一步加工，那就是蛋白質翻譯后修飾加工。蛋白質翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質的活性、定位或功能。通過蛋白質翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活...

代謝組學發(fā)展至今，代謝組學技術已經遠遠超出了標準臨床化學技術的范圍，能夠精確分析數百至數千種代謝物。代謝組學提供了代謝表型的詳細表征，并可以在許多水平上進行精密醫(yī)學研究，包括表征疾病基礎的代謝紊亂，發(fā)現新的治靶標以及發(fā)現可用于診斷疾病或監(jiān)測藥物的活性。比較常見...

蛋白質乙酰化修飾組學定量分析：1. SILAC細胞標記，組織/細胞破碎，提取、提純目的蛋白質（基于SILAC的乙?；揎椊M學定量）。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 對多肽片段進行iTRAQ標記（基于iTRAQ的乙?；揎椊M學定量）。4. 使用...

轉錄組是特定發(fā)育階段或生理條件下細胞內的完整轉錄信息的匯合，表示了基因表達的中間狀態(tài)。轉錄組測序可以對所有轉錄物進行分類、確定基因的轉錄結構、量化轉錄物的表達水平。蛋白質是生命功能的直接執(zhí)行者，蛋白組是一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。整合轉錄組學和蛋白...

PRM靶向蛋白質組學：是一種基于Orbitrap為表示的高分辨、高精度質譜的離子監(jiān)視技術，首先利用四級桿質量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標肽段的母離子，隨后在collisioncell中對母離子進行碎裂，然后利用Orbitrap分析器在二級質譜中檢測所選擇的...

蛋白質學組翻譯后修飾自下而上分析策略：常用的糖蛋白分離和富集技術有：a. 凝集素親和技術；b. 肼化學富集；c. 親水性相互作用色譜法；d. β-消除/邁克爾加成反應?；谫|譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點測定方法有：a. PNGase F酶法；b. Endo H酶...

質譜分析蛋白翻譯后修飾：相對于蛋白質印跡等技術，質譜技術能更有效的對蛋白質的翻譯后修飾進行分析，且可以對常規(guī)的Western blot 翻譯后修飾蛋白鑒定進行補充。質譜分析蛋白翻譯后修飾一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的質譜方法無法保證可以完全識...

代謝組學疾病診斷應用： 代謝組學研究人員已經對此進行了研究。新生兒是否缺失酶基因，可以在出生時就檢測出來?？蓹z測出包括涉及合成途徑中的基本成分（如氨基酸）的酶。酶缺失的結果就是相應的代謝產物過少或過多。尿癥（PKU）是一種常見的嬰兒疾病。這種疾病是由于缺失將苯...

蛋白質糖基化修飾組學技術：糖基化是在酶的控制下,蛋白質或脂質附加上糖類的過程,發(fā)生于內質網和高爾基體等部位。在糖基轉移酶作用下將糖轉移至蛋白質,和蛋白質上的氨基酸殘基共價結合。蛋白質經過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對蛋白的重要的修飾作用,有調節(jié)蛋白質功能作...

翻譯后修飾蛋白的檢測方法：翻譯后修飾蛋白的檢測技術包括有免疫沉淀、western blot、質譜技術、體外生化分析等。其中，免疫沉淀是大多數翻譯后修飾檢測中的關鍵步驟，它利用蛋白特異性抗體或某種翻譯后修飾的特異性抗體來富集目標蛋白，之后再用western bl...

單細胞RNA-seq轉錄組學工作流程：單細胞RNA測序等高通量單細胞轉錄組學技術通常從針對不同瘤和組織類型（解離、分選和分離細胞等）量身定制的實驗工作流程開始，然后產生可以比對的序列，量化、質量控制(QC)過濾和以不同方式標準化，以實現許多下游計算分析，例如聚...

翻譯后修飾蛋白的檢測方法：翻譯后修飾蛋白的檢測技術包括有免疫沉淀、western blot、質譜技術、體外生化分析等。其中，免疫沉淀是大多數翻譯后修飾檢測中的關鍵步驟，它利用蛋白特異性抗體或某種翻譯后修飾的特異性抗體來富集目標蛋白，之后再用western bl...

蛋白質組(Proteome)的概念指由一個基因組(genome)，或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(Protein).蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別，它隨著組織、甚至環(huán)境狀態(tài)的不同而改變.在轉錄時，一個基因可以多種mRNA形式剪接，并且，同一蛋白可能以...

乙?；揎椀鞍踪|組學分析：乙?；揎椀鞍踪|組學分析是指從蛋白質組學的水平分析蛋白質乙?；揎?，包括乙?；鞍踪|的鑒定和定量。提供基于質譜的乙?；鞍捉M研究服務。蛋白質乙?；ńM蛋白乙?；头墙M蛋白乙酰化。組蛋白乙?；饕琴嚢彼嵋阴；?，已在基因轉錄調控作用方...

蛋白質-蛋白質相互作用是蛋白質發(fā)揮功能的主要機制之一,在DNA損傷修復,自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導致疾病的發(fā)生.在蛋白質的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙?；?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這...

翻譯后修飾蛋白組學分析：蛋白質組學的研究的工作不只聚焦于細胞不同生長時期或是疾病條件下的蛋白質表達水平變化，許多至關重要的生命進程不只由蛋白質相對豐度控制，更重要的是被時空特異分布的、可逆的翻譯后修飾所調控，因而揭示翻譯后修飾發(fā)生規(guī)律是解析蛋白質復雜多樣的生物...

轉錄組學應用于胃腸瘤轉移機制研究：circRNA是一種非編碼RNA，可以多種方式參與生物學功能，如細胞增殖、細胞周期、侵襲和轉移等。近年來研究發(fā)現，環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結合蛋白參與轉錄后調控，從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復、凋亡、增殖...

單細胞轉錄組關鍵步驟：單細胞的分離和捕獲：溫和分離，稀有細胞。轉錄本的捕獲和擴增：RNA測序需要0.1-1.0ugtotalRNA，捕獲效率10%（5-**NA測序需要1ngDNA，極限稀釋加移液分離單細胞；顯微操作分選單細胞；流式分選帶有表面Mark...

代謝組學概念：基因與蛋白質的表達緊密相連，而代謝物則更多地反映了細胞所處的環(huán)境，這又與細胞的營養(yǎng)狀態(tài)，藥物和環(huán)境污染物的作用，以及其它外界因素的影響密切相關。因此有人認為，“基因組學和蛋白質組學告訴你什么可能會發(fā)生，而代謝組學則告訴你什么確實發(fā)生了。”代謝組學...

蛋白組學研究怎么做？PRM:平行反應監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質譜的離子監(jiān)視技術，能夠對目標蛋白質、目標肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，從而實現對目標蛋白質/肽段進行一定定量，因此也被稱之...

代謝組學介紹：通過液質聯(lián)用（LC-MS）方法檢測生物體受外界刺激前后體內大多數小分子代謝物的動態(tài)變化，重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物，進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關關系，其研究對象大多是分子量1500Da以內的小分子物質。技術優(yōu)勢：較高的...

蛋白質組學發(fā)展趨勢：技術發(fā)展方面：蛋白質組學的研究方法將出現多種技術并存，各有優(yōu)勢和的特點，而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外，更強調各種方法間的整合和互補，以適應不同蛋白質的不同特征。另外，蛋白質組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要...

蛋白質翻譯后修飾組學：蛋白質翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質進行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團，可以改變蛋白質的物理、化學性質，進而影響蛋白質的空間構象和活性狀...

轉錄組學應用于胃腸瘤轉移機制研究：circRNA是一種非編碼RNA，可以多種方式參與生物學功能，如細胞增殖、細胞周期、侵襲和轉移等。近年來研究發(fā)現，環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結合蛋白參與轉錄后調控，從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復、凋亡、增殖...

PRM靶向蛋白組學：PRM技術是一種根據已知實測信息或質譜檢測規(guī)律的假定信息對樣品中的蛋白質進行靶向定量的技術。該技術主要應用儀器為QExactive系列質譜儀，首先以四極桿作為質量過濾器，特異性地選擇與預先設定質荷比相同的肽段離子（母離子）通過，隨后在高能碰...

代謝組學發(fā)展至今，代謝組學技術已經遠遠超出了標準臨床化學技術的范圍，能夠精確分析數百至數千種代謝物。代謝組學提供了代謝表型的詳細表征，并可以在許多水平上進行精密醫(yī)學研究，包括表征疾病基礎的代謝紊亂，發(fā)現新的治靶標以及發(fā)現可用于診斷疾病或監(jiān)測藥物的活性。比較常見...