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蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué):乙酰化修飾是指在酶或非酶作用下,將乙酰CoA的乙?;鶊F(tuán)轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì)氨基酸的殘基上。蛋白質(zhì)乙酰化也是一種可逆的酶促反應(yīng)過程。乙酰基轉(zhuǎn)移酶可以將乙?;鶊F(tuán)(CH3C=O)從乙酰輔酶A轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì)。同理,去乙?;竸t可以逆轉(zhuǎn)這種反應(yīng)。蛋白質(zhì)上的...
泛素化修飾蛋白組學(xué)研究分析樣品要求:1. 如果您提供的是組織樣品,請您干冰將組織樣品寄給我們;植物組織樣本大于400mg,血液樣品至少2ml(血漿注意用EDTA防凝),血清2ml,尿液10ml,動物組織樣品至少2g,細(xì)胞樣品為1X10^8個細(xì)胞,酵母、微生物等...
常用的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法有以下幾類:非標(biāo)記(labelfree)的定量蛋白組學(xué)技術(shù):Label free定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn),只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較...
轉(zhuǎn)錄組學(xué)的概念:轉(zhuǎn)錄組是指特定組織或細(xì)胞在某一發(fā)育階段或功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的匯合,包括蛋白質(zhì)編碼的信使RNA和非編碼RNA(rRNA、tRNA和其他ncRNAs),高通量測序技術(shù)也被稱為下一代測序(NGS)技術(shù),推進(jìn)了基因組學(xué)的研究進(jìn)展。該項新技術(shù)...
代謝組學(xué)的研究對象與層次有哪些?一般來說,代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對象和目的不同,科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個層次:代謝物靶標(biāo)分析:某一個或幾個特定組分的定性和定量分析,如某一類結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物(氨基酸...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù):Anydeplete技術(shù)首先通過隨機(jī)引物進(jìn)行一鏈合成,一鏈合成引入核苷酸類似物,用于酶切打斷,二鏈合成同樣引入核苷酸類似物用于保證鏈特異性。然后兩端加上接頭,接頭一條鏈也帶有核苷酸類似物,用于酶切降解。當(dāng)形成單鏈文庫后,設(shè)計特異性引物與rR...
代謝組學(xué)究竟是一門什么樣的研究方向?首先定義什么是代謝組學(xué)。簡單的說就是研究生物體對內(nèi)外刺激的整體代謝應(yīng)答規(guī)律。那么為什么代謝組學(xué)是基因組,轉(zhuǎn)錄組,蛋白質(zhì)組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向,的執(zhí)行者蛋白質(zhì)中很多酶參與了體內(nèi)的代...
常用的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法有以下幾類:非標(biāo)記(labelfree)的定量蛋白組學(xué)技術(shù):Label free定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn),只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較...
什么叫轉(zhuǎn)錄組學(xué)?廣義轉(zhuǎn)錄組是指生命單元(通常是一種細(xì)胞)中所有按基因信息單元轉(zhuǎn)錄和加工的RNA分子(包括編碼和非編碼RNA功能單元),或者是一個特定細(xì)胞所有轉(zhuǎn)錄本的總和.它的研究對象就是這些RNA與蛋白質(zhì)分子和它們所組成的基因功能網(wǎng)絡(luò)以及它們與細(xì)胞功能的關(guān)系....
乙酰化修飾蛋白組學(xué)實驗流程:1)組織/細(xì)胞破碎,提取蛋白質(zhì);2)蛋白酶解成多肽片段;3)對多肽片段進(jìn)行 iTRAQ 標(biāo)記;4)高效特異性乙酰化抗體富集乙?;揎楇亩?;5)使用 LC-MS/MS 對富集的乙?;亩芜M(jìn)行序列分析;5)數(shù)據(jù)分析,比對不同樣本中蛋白乙...
蛋白質(zhì)翻譯后修飾的重要性:翻譯后修飾可以發(fā)生在蛋白質(zhì)生命周期的任何階段。例如,許多蛋白質(zhì)在翻譯完成后不久就被修飾,以介導(dǎo)適當(dāng)?shù)牡鞍踪|(zhì)折疊或穩(wěn)定,或?qū)⑿律鞍踪|(zhì)引導(dǎo)到不同的細(xì)胞區(qū)室(例如,細(xì)胞核、膜)。折疊和定位完成后發(fā)生其他修飾,以刺激或滅活催化活性或以其他方...
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)是什么?蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個共價加工過程,即通過1個或幾個氨基酸殘基加上修飾基團(tuán)或通過蛋白質(zhì)水解剪去基團(tuán)而改變蛋白質(zhì)的性質(zhì)。蛋白質(zhì)氨基酸序列的特定位置可以與化學(xué)基團(tuán)或者小分子量的蛋白共價結(jié)合從而發(fā)生蛋白質(zhì)翻譯...
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致...
普通轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序適用于哪些情況?普通轉(zhuǎn)錄組測序主要適用于兩大類:一是不同的生長階段或者發(fā)育過程;二是不同的環(huán)境、藥物、病原菌等逆境脅迫處理。轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序必須做生物學(xué)重復(fù)么?需要幾個重復(fù)?生物學(xué)重復(fù)是生物實驗所必須的,轉(zhuǎn)錄組測序也不例外,至少3次生物學(xué)重復(fù)。準(zhǔn)備...
泛素化修飾PRM定量驗證:原理: 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種...
LC-MS非靶向代謝組學(xué):LC-MS非靶向代謝組學(xué)通過液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化,重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物,進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系,其研究對象大都是分子量1500D...
常用的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法有以下幾類:非標(biāo)記(labelfree)的定量蛋白組學(xué)技術(shù):Label free定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn),只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較...
泛素化修飾蛋白質(zhì)組產(chǎn)品介紹:泛素化修飾(Ubiquitylation)是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,是指一個或多個泛素分子(Ubiquitin,由76個氨基酸組成的多肽)在一系列特殊的酶作用下,將細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)分類,從中選出靶蛋白分子,并對靶蛋白進(jìn)行特異性修飾...
GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測到哪些類別的代謝物?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機(jī)酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準(zhǔn)確度?GC/MS的定性有雙重標(biāo)準(zhǔn),...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù):10×genomics技術(shù):首先在凝膠微珠上種上特定的DNA的片段,DNA的片段由三部分組成:Barcode、UMI、PolyT組成。Barcode是16個堿基的長度。一共有400萬種Barcode,一個微珠是對應(yīng)于一種Barcode,通過...
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)產(chǎn)品:常規(guī)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究往往只關(guān)注不同生理、病理條件下蛋白質(zhì)表達(dá)水平的變化。然而,越來越多的研究發(fā)現(xiàn),許多重要的生命活動、疾病發(fā)生不僅與蛋白質(zhì)的豐度相關(guān),更重要的是被各類蛋白質(zhì)翻譯后修飾所調(diào)控。因此深入研究蛋白質(zhì)翻譯后修飾對揭示生命活動的...
蛋白組學(xué)常見研究模式主要有兩種:1.通過蛋白質(zhì)組學(xué)尋找疾病發(fā)生的發(fā)展的新型標(biāo)志物;2.結(jié)合其它組學(xué)建立疾病或者研究主題的表達(dá)譜和分子機(jī)制。蛋白質(zhì)組學(xué)( proteomics) 是指系統(tǒng)研究某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì),包括組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的氨基酸序列,蛋白質(zhì)...
乙?;揎椀鞍捉M學(xué)簡介:乙?;前岩环N乙酰官能基團(tuán)添加到另一種有機(jī)化合物上,并進(jìn)行結(jié)合的過程。乙酰化也是細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)翻譯后修飾的一種重要形式,其主要發(fā)生在組蛋白賴氨酸上,是由組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶 (HATs) 催化的,其反過程去乙?;山M蛋白去乙酰酶 (Histo...
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有些什么?泛素化可以生產(chǎn)出單泛素化或多泛素化蛋白質(zhì)。后者在當(dāng)7個賴氨酸殘基的泛素與另一個泛素的甘氨酸C端連接形成。這種泛素分子鏈接在生物過程中起到重要的作用。共價結(jié)合泛素的蛋白質(zhì)能被蛋白酶識別并降解,這是細(xì)胞內(nèi)短壽命蛋白質(zhì)和一些異常蛋白降解...
單細(xì)胞RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)工作流程:單細(xì)胞RNA測序等高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)通常從針對不同瘤和組織類型(解離、分選和分離細(xì)胞等)量身定制的實驗工作流程開始,然后產(chǎn)生可以比對的序列,量化、質(zhì)量控制(QC)過濾和以不同方式標(biāo)準(zhǔn)化,以實現(xiàn)許多下游計算分析,例如聚...
轉(zhuǎn)錄組學(xué)含義:轉(zhuǎn)錄組學(xué)是指一門在整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。轉(zhuǎn)錄組學(xué)是從RNA水平研究基因表達(dá)的情況。轉(zhuǎn)錄組即一個活細(xì)胞所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,是研究細(xì)胞表型和功能的一個重要手段。以DNA為模板合成RNA的轉(zhuǎn)錄過程是基因表達(dá)...
蛋白質(zhì)翻譯后修飾的重要性:翻譯后修飾可以發(fā)生在蛋白質(zhì)生命周期的任何階段。例如,許多蛋白質(zhì)在翻譯完成后不久就被修飾,以介導(dǎo)適當(dāng)?shù)牡鞍踪|(zhì)折疊或穩(wěn)定,或?qū)⑿律鞍踪|(zhì)引導(dǎo)到不同的細(xì)胞區(qū)室(例如,細(xì)胞核、膜)。折疊和定位完成后發(fā)生其他修飾,以刺激或滅活催化活性或以其他方...
甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)原理:目前用于甲基化蛋白質(zhì)組分析的甲基化肽段富集抗體分為精氨酸甲基化(Me-R)抗體和賴氨酸甲基化(Me-K)抗體兩大類。根據(jù)氨基酸殘基上所含甲基化修飾基團(tuán)數(shù)量的不同,精氨酸甲基化(Me-R)抗體又包括:單甲基化精氨酸(MMA)抗體、非...
轉(zhuǎn)錄組及轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq):轉(zhuǎn)錄組即特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)主要通過高通量測序研究特定組織或細(xì)胞在某個時期轉(zhuǎn)錄出來的mRNA的表達(dá)量,進(jìn)而對相關(guān)基因和表型的關(guān)系進(jìn)...
代謝組學(xué)的功能:代謝組學(xué)的功能,就有點類似GPS。代謝組學(xué)不做任何假設(shè),針對樣本和參照物分別進(jìn)行代謝物全譜檢測,幫你尋找出與差異代謝物,可能會有好幾十個甚至更多,從它們所在的被上調(diào)或下調(diào)的代謝通路上去找到關(guān)鍵的代謝酶,再找到它們上游的調(diào)控基因,再進(jìn)行后續(xù)的深入...