南京PRM靶向定量蛋白質組學領域

我國科學家已經(jīng)在重大疾病如肝病、維甲酸誘導白血病細胞凋亡啟動模型及維甲酸定向誘導胚胎干細胞向神經(jīng)系統(tǒng)分化的模型等比較蛋白質組研究以及一些重要生理和病理體系的蛋白質組成分研究方面獲得了重要成就。蛋白質組學的重要應用領域有：在臨床疾病中的應用、在微生物蛋白質組學中的應用、在植物研究中的應用、在腎臟病學領域的應用。我們通過研究蛋白質組，可以為患者提供有用的疾病診斷、診療、預后評估信息；可以早期更為準確的診斷出胰腺病；也可以為AD的診斷、診療藥物的設計和篩選奠定基礎。這項研究技術其實離我們生活非常近，對我們生命而言尤為重要。近年來，高通量蛋白質分離與鑒定技術，如雙向電泳、生物質譜、蛋白質芯片、酵母雙雜交系統(tǒng)、生物信息學等相繼建立并日趨完善，加速了蛋白質組學的發(fā)展。蛋白質組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。南京PRM靶向定量蛋白質組學領域

蛋白質組學主要以全蛋白組（組織、細胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象，通過對蛋白組進行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學功能、作用機制、疾病診斷的標志物以及預測蛋白的上、下游變化關系。蛋白質組學可以克服核酸水平預測的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。常用技術：非靶向蛋白組學：蛋白質定性（膠條鑒定和溶液鑒定），高通量定量蛋白組（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽組學。南京修飾蛋白組學領域對人類而言，蛋白質組學的研究終究要服務于人類的健康。

蛋白質組學：常用技術：靶向蛋白組（PRM靶向蛋白/肽段定量），修飾蛋白組學（定量磷酸化修飾組學、定量糖基化修飾蛋白組學、定量乙?；揎椀鞍捉M學和定量泛素化修飾蛋白組學），互作蛋白組學（代謝物與蛋白互作研究）。什么樣本能做蛋白組學檢測？大概可以測到多少的蛋白種類？原則上只要能提取到蛋白，就可以做蛋白組檢測。樣本測到的蛋白種類跟數(shù)據(jù)庫和樣本本身蛋白濃度有關，一般數(shù)據(jù)庫越大，可以鑒定到的蛋白質數(shù)量越多。也與樣本的類型有關，通常，組織細胞相比于體液樣本，能夠鑒定到更多的蛋白。

蛋白質組學：質譜分析蛋白質組學的基本原理主要是通過測定被測樣品離子的理化性質來進行分析，根據(jù)樣品的質量譜圖和相關信息從而得到定性和定量結果。目前，蛋白質組學質譜分析一般是根據(jù)保留時間（retentiontime）、質荷比（m/z）、離子強度（intensity）這三個維度對肽蛋白質進行鑒定和定量，即3D蛋白質組學。4D蛋白質組學在3D蛋白質組學的基礎之上增加了第四維度，離子淌度（mobility），主要根據(jù)離子的形狀和截面對離子進行分離，能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段，使低豐度蛋白信號能夠被區(qū)分和識別出來。4D蛋白質組學基于timsTOFPro質譜儀，結合PASEF（ParallelAccumulationSerialFragmentation，同步累積連續(xù)碎裂）與TIMS（TrappedIonMobilitySpectrometry，離子遷移譜），可重復測量所有檢測離子的碰撞截面（CCS），能更快、更靈敏的進行蛋白質組定性和定量。蛋白質組學相關技術目前在一小部分]應用中具有獨特優(yōu)勢。

蛋白質組學在醫(yī)療和健康方面有什么應用？基于質譜的蛋白質組學是目前比較主流的高通量蛋白質研究手段，當前在醫(yī)療健康方面的應用主要集中于基礎研究和轉化醫(yī)學。隨著質譜、系統(tǒng)生物學、生物信息學等相關學科的發(fā)展，我認為今后我們會更多地在現(xiàn)實生活中見到蛋白質組學相關的應用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變（鐮刀形紅細胞癥）、糖化血紅蛋白比例測定等。從測試體量估計，應該遠小于1%的ELISA測試量。由于成本和通量等原因，蛋白質組學技術并不如ELISA適合大量的日常分析。但對于一些分析有問題的項目，采用基于質譜（或二維膠等手段）的蛋白質組學有獨特的技術優(yōu)勢。另外，蛋白質組學方法開發(fā)和驗證周期短，在中高級特殊應用（如極少使用的特殊蛋白指標臨床檢測、未知疾病研究和控制）中也有其獨特優(yōu)勢。蛋白質組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要。貴陽高通量蛋白質組學報價

蛋白質組的概念指由一個基因組，或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。南京PRM靶向定量蛋白質組學領域

蛋白質組學研究這樣做：蛋白質組與基因組相對應，也是一個整體的概念，隨著基因組學研究的不斷深入，蛋白質組學已逐漸成為研究熱點，對蛋白組學的研究可以使我們更容易接近生命的機理本質，但探究成千上萬的蛋白質特性也是一個重大的技術挑戰(zhàn)。蛋白質組（Proteome）指的是某一時刻或某一狀態(tài)基因組表達的所有相應的蛋白，即細胞、組織或機體全部蛋白質的存在及活動形式，其是一個動態(tài)概念，它是在組織、細胞的整體蛋白質水平上，探索蛋白質作用模式、功能機理、調節(jié)控制以及蛋白質群體內的相互關系、從而獲得生命活動調控網(wǎng)絡的全方面而深入的認識，以揭示生命活動的基本規(guī)律。南京PRM靶向定量蛋白質組學領域

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