常用的定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)方法有以下幾類:非標記(labelfree)的定量蛋白組學技術(shù):Label free定量蛋白組學技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析,無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內(nèi)部標準,只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù),比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號強度,從而對肽段對應(yīng)的蛋白質(zhì)進行相對定量。TMT定量蛋白組學技術(shù):這種技術(shù)采用多個(2-10)穩(wěn)定同位素標簽,特異性標記多肽的氨基基團進行串聯(lián)質(zhì)譜分析,能夠同時比較多達10種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對含量,可用于研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達水平的差異。蛋白質(zhì)組學可以通過系統(tǒng)性地研究蛋白質(zhì)表達和翻譯后修飾變化對疾病的影響。湖北蛋白質(zhì)組學檢測價格
蛋白質(zhì)組結(jié)果一般需要做哪些方面的生物信息學分析?目前一般文獻中的分析主要為維恩圖分析、熱圖分析、火山圖分析、層次聚類分析、蛋白質(zhì)功能分析(GO分類為主)、蛋白質(zhì)所屬代謝通路富集分析(基于KEGG的pathway)、差異蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建、轉(zhuǎn)錄因子預測等方面。其它一些比較特異的高級分析包括多組數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶預測分析、互作網(wǎng)絡(luò)及生物調(diào)控模型構(gòu)建分析。定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)主要分為標記(label)和非標記(labelfree)定量策略,標記策略又分為體內(nèi)標記和體外標記兩種。細胞內(nèi)蛋白質(zhì)組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進程中,常常伴隨著某些蛋白質(zhì)的表達異常。定量蛋白質(zhì)組學就是把一個基因組表達的全部蛋白質(zhì)或一個復雜的混合體系中所有的蛋白質(zhì)進行精確的定量和鑒定。貴州定量乙?;鞍踪|(zhì)組學目前國際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進行蛋白質(zhì)組學方面的應(yīng)用性研究。
iTRAQ定量蛋白組學技術(shù):iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)多肽體外標記定量技術(shù)。這種技術(shù)同TMT定量蛋白組學技術(shù)相似,可研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品中蛋白質(zhì)表達水平的差異。Label-free:Label-free定量,即非標記的定量蛋白質(zhì)組學,不需要對比較樣本做特定標記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。
蛋白質(zhì)組學的重要應(yīng)用領(lǐng)域有:在臨床疾病中的應(yīng)用、在微生物蛋白質(zhì)組學中的應(yīng)用、在植物研究中的應(yīng)用、在腎臟病學領(lǐng)域的應(yīng)用。我們通過研究蛋白質(zhì)組,可以為患者提供有用的疾病診斷、預后評估信息;可以早期更為準確的診斷出胰腺?。灰部梢詾锳D的診斷、治理藥物的設(shè)計和篩選奠定基礎(chǔ)。這項研究技術(shù)其實離我們生活非常近,對我們生命而言尤為重要。近年來,高通量蛋白質(zhì)分離與鑒定技術(shù),如雙向電泳、生物質(zhì)譜、蛋白質(zhì)芯片、酵母雙雜交系統(tǒng)、生物信息學等相繼建立并日趨完善,加速了蛋白質(zhì)組學的發(fā)展。蛋白質(zhì)組學技術(shù)有飛行時間質(zhì)譜。
蛋白質(zhì)組學研究應(yīng)用:近年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學領(lǐng)域,覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍,涉及到各種重要的生物學現(xiàn)象,如信號轉(zhuǎn)導、細胞分化、蛋白質(zhì)折疊等。生物信息學的發(fā)展已給蛋白質(zhì)組研究提供了更方便、有效的計算機分析軟件,隨著基因組學的迅速推進,會給蛋白質(zhì)組研究提供更多更全的數(shù)據(jù)庫。另外,蛋白質(zhì)組學與其它學科的交叉也將推動新技術(shù)、新方法的發(fā)展。特別是蛋白質(zhì)組學與其它大規(guī)??茖W如基因組學,生物信息學領(lǐng)域的交叉,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學研究模式,將成為未來的生命科學新前沿。近兩年來蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學領(lǐng)域。貴州定量乙酰化蛋白質(zhì)組學
蛋白質(zhì)組的概念指由一個基因組,或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(zhì)。湖北蛋白質(zhì)組學檢測價格
蛋白質(zhì)組學技術(shù)方法:等電聚焦:等電聚焦(isoelectric focusing,IEF)是一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點不同的蛋白質(zhì)的電泳技術(shù)。等電聚焦凝膠電泳依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點進行分離,等電聚焦中,蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質(zhì)是脂肪族多氨基多羧酸,在電場中形成正極為酸性,負極為堿性的連續(xù)的pH梯度。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場中移動;當?shù)鞍踪|(zhì)遷移至其等電點位置時,其靜電荷數(shù)為零,在電場中不再移動,據(jù)此將蛋白質(zhì)分離。湖北蛋白質(zhì)組學檢測價格