浙江蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)鑒定

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-05-29

蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué):乙酰化修飾是指在酶或非酶作用下,將乙酰CoA的乙?;鶊F(tuán)轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì)氨基酸的殘基上。蛋白質(zhì)乙?;彩且环N可逆的酶促反應(yīng)過程。乙?;D(zhuǎn)移酶可以將乙?;鶊F(tuán)(CH3C=O)從乙酰輔酶A轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì)。同理,去乙?;竸t可以逆轉(zhuǎn)這種反應(yīng)。蛋白質(zhì)上的賴氨酸乙酰化是細(xì)胞內(nèi)一種重要的PTMs過程。不僅發(fā)生在細(xì)胞核內(nèi)組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等上,在細(xì)胞質(zhì)和線粒體中也存在著諸多蛋白的乙?;揎?。在植物研究領(lǐng)域內(nèi),乙?;揎椫饕獏⑴c植物光合作用、生長發(fā)育、脅迫響應(yīng)等過程。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,乙?;揎椏烧{(diào)節(jié)人體內(nèi)某種代謝酶,控制糖尿病,這一發(fā)現(xiàn)為糖尿病干預(yù)與療理帶來新的希望。蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)比較重要的共價(jià)修飾方式之一。浙江蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)鑒定

泛素化修飾蛋白質(zhì)組產(chǎn)品介紹:泛素化修飾(Ubiquitylation)是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,是指一個(gè)或多個(gè)泛素分子(Ubiquitin,由76個(gè)氨基酸組成的多肽)在一系列特殊的酶作用下,將細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)分類,從中選出靶蛋白分子,并對(duì)靶蛋白進(jìn)行特異性修飾的過程。 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾,泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物80%~85%的蛋白質(zhì)降解。除參與蛋白質(zhì)降解之外,泛素化修飾還參與了細(xì)胞周期、增殖、細(xì)胞凋亡、分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號(hào)傳遞、損傷修復(fù)、炎癥免疫等幾乎一切生命活動(dòng)的調(diào)控。泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此,作為近年來生物化學(xué)研究的一個(gè)重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點(diǎn)。廣東泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定在技術(shù)上,研究翻譯后修飾蛋白的主要挑戰(zhàn)是開發(fā)特異性的檢測(cè)和純化方法。

翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個(gè)細(xì)胞過程的重要方式,幾乎在每個(gè)細(xì)胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對(duì)揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計(jì)量和豐度存在,這限制了在分析全細(xì)胞裂解液時(shí)對(duì)其的檢測(cè)。蛋白質(zhì)是各種細(xì)胞功能比較重要的執(zhí)行者,其功能正常與否決定著生命活動(dòng)能否有序、高效的進(jìn)行,而其中翻譯后修飾起著至關(guān)重要的作用。翻譯后修飾改變了蛋白質(zhì)中不同氨基酸殘基上的生物化學(xué)官能團(tuán),進(jìn)而改變其化學(xué)性質(zhì)或結(jié)構(gòu),使得蛋白質(zhì)具有更為復(fù)雜的結(jié)構(gòu)和更為完善的功能,實(shí)現(xiàn)更為精細(xì)的調(diào)節(jié)。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾過程極其復(fù)雜,已知的翻譯后修飾種類有20多種。但其中較為常見的主要是磷酸化、泛素化、SUMO化、酰(含乙酰)化、甲基化以及糖基化。

蛋白質(zhì)翻譯后修飾:蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (Protein translational modifications,PTMs) 通過功能基團(tuán)或蛋白質(zhì)的共價(jià)添加、調(diào)節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個(gè)蛋白質(zhì)的降解來增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙?;⒅|(zhì)化和蛋白水解,幾乎影響正常細(xì)胞生物學(xué)和發(fā)病機(jī)制的所有方面。因此,識(shí)別和理解 PTM 在細(xì)胞生物學(xué)和疾病療理和預(yù)防的研究中至關(guān)重要。蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTMs) 進(jìn)一步促進(jìn)了從基因組水平到蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的增加。PTMs 是一種化學(xué)修飾,在功能蛋白質(zhì)組中發(fā)揮關(guān)鍵作用,因?yàn)樗鼈冋{(diào)節(jié)活性、定位以及與其他細(xì)胞分子(如蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)和輔助因子)的相互作用。磷酸化修飾蛋白質(zhì)組的研究主要集中于真核生物中普遍存在的絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的磷酸化。

甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)原理:目前用于甲基化蛋白質(zhì)組分析的甲基化肽段富集抗體分為精氨酸甲基化(Me-R)抗體和賴氨酸甲基化(Me-K)抗體兩大類。根據(jù)氨基酸殘基上所含甲基化修飾基團(tuán)數(shù)量的不同,精氨酸甲基化(Me-R)抗體又包括:單甲基化精氨酸(MMA)抗體、非對(duì)稱二甲基化精氨酸(ADMA)抗體和對(duì)稱二甲基化精氨酸(SDMA)抗體;賴氨酸甲基化(Me-K)抗體又包括:賴氨酸單甲基化(K-Me)抗體、賴氨酸二甲基化(K-2Me)抗體和賴氨酸三甲基化(K-3Me)抗體。其中,Me-R的各類抗體需要單獨(dú)使用,而Me-K抗體可以混合使用。研究蛋白質(zhì)磷酸化對(duì)闡明蛋白質(zhì)功能具有重要意義。蛋白質(zhì)甲基化修飾組學(xué)類型

蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTMs)是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后的化學(xué)修飾過程。浙江蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)鑒定

琥珀酰化修飾蛋白質(zhì)組技術(shù)特點(diǎn):采用主流抗體親和富集方法,特異性高,富集效率好;通過高分辨率、高掃描速度的質(zhì)譜,對(duì)富集的琥珀?;亩芜M(jìn)行大規(guī)模鑒定;結(jié)合常用的定量技術(shù)可對(duì)不同樣品間的琥珀?;讲町愡M(jìn)行定量比較。適用范圍:藥物作用靶點(diǎn)研究;疾病標(biāo)志物篩選;植物脅迫/抗逆研究;作用機(jī)制研究;要求物種具有蛋白質(zhì)參考數(shù)據(jù)庫、EST序列(轉(zhuǎn)錄組)或基因組注釋信息。應(yīng)用方向:線粒體代謝、生物合成與代謝、中心代謝途徑、炎癥與疾病。浙江蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)鑒定