蛋白質(zhì)翻譯后修飾的重要性：翻譯后修飾可以發(fā)生在蛋白質(zhì)生命周期的任何階段。例如，許多蛋白質(zhì)在翻譯完成后不久就被修飾，以介導(dǎo)適當(dāng)?shù)牡鞍踪|(zhì)折疊或穩(wěn)定，或?qū)⑿律鞍踪|(zhì)引導(dǎo)到不同的細胞區(qū)室（例如，細胞核、膜）。折疊和定位完成后發(fā)生其他修飾，以刺激或滅活催化活性或以其他方...

蛋白質(zhì)組學(xué)：常用技術(shù)：靶向蛋白組（PRM靶向蛋白/肽段定量），修飾蛋白組學(xué)（定量磷酸化修飾組學(xué)、定量糖基化修飾蛋白組學(xué)、定量乙酰化修飾蛋白組學(xué)和定量泛素化修飾蛋白組學(xué)），互作蛋白組學(xué)（代謝物與蛋白互作研究）。什么樣本能做蛋白組學(xué)檢測？大概可以測到多少的蛋白種類...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)：翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團，可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì)，進而影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和活性狀態(tài)、亞...

甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域：基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷：生物標(biāo)志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治理等；生物醫(yī)藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發(fā)等；農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機制，生長發(fā)育機制，育種保護研究等；畜牧業(yè)：肉類及乳品質(zhì)研究，致病機理研究等；微生物領(lǐng)域：致...

磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：在有機體內(nèi)，磷酸化是蛋白翻譯后修飾中比較普遍的共價修飾形式，同時也是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式。磷酸化對蛋白質(zhì)功能的正常發(fā)揮起著重要的調(diào)節(jié)作用，該過程是由蛋白質(zhì)激酶（Kinase）催化的把ATP或GTP的γ位磷酸基轉(zhuǎn)移到底...

代謝組學(xué)有哪些特點？(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學(xué)的末端，更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實情況，因此，在多數(shù)生物表型研究上更加適用。(2) 常規(guī)代謝組學(xué)只關(guān)注內(nèi)源性化合物，也有使用代謝組學(xué)技術(shù)測定外源性化合物的。內(nèi)源性化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病、毒性、基因修飾...

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用：蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué)，包括對蛋白質(zhì)表達模式和蛋白質(zhì)組功能模式的研究。蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展對尋找疾病的診斷標(biāo)志、篩選藥物靶點、毒理學(xué)研究等有重要意義，也因...

翻譯后修飾蛋白組分析：蛋白質(zhì)翻譯后修飾（PTMs）是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后的化學(xué)修飾過程。蛋白質(zhì)翻譯后修飾（PTMs）通過給蛋白質(zhì)添加磷酸酯、乙酸酯、酰胺基或甲基等官能團增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性，并影響正常細胞生物學(xué)和發(fā)病機理的幾乎所有方面。蛋白質(zhì)翻譯后修飾...

定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法學(xué)背景和意義：從生命活動的直接執(zhí)行者——蛋白質(zhì)的角度研究生命現(xiàn)象和規(guī)律（特別是疾病防治和病理研究）已成為研究生命科學(xué)的主要手段。而這些研究往往離不開對細胞、組織中含有蛋白質(zhì)種類和表達量的研究。對處不同時期、不同條件下蛋白質(zhì)表達水平變化的研究...

代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合，樣本采集需要注意什么？絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見的樣本主要有：臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液；細胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液；植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發(fā)生變化，我們需...

蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)服務(wù)：乙酰化修飾是體內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對細胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。此外，還存在大量的非組蛋白乙酰化修飾參與了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)服務(wù)采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?；b定...

常用的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法有以下幾類：非標(biāo)記（labelfree）的定量蛋白組學(xué)技術(shù)：Label free定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析，無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，比較...

甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域：基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷：生物標(biāo)志物，疾病機理機制，疾病分型，個性化治理等；生物醫(yī)藥：藥物作用機理，藥效評價，藥物開發(fā)等；農(nóng)林領(lǐng)域：抗逆脅迫機制，生長發(fā)育機制，育種保護研究等；畜牧業(yè)：肉類及乳品質(zhì)研究，致病機理研究等；微生物領(lǐng)域：致...

RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)的應(yīng)用：RNA-Seq即對轉(zhuǎn)錄組進行測序和分析。一般來說在研究所會委托公司測序得到數(shù)據(jù)自己進行后續(xù)的生信分析（質(zhì)控，mapping，差異基因表達分析，SNV分析等）。RNA-Seq有著巨大的應(yīng)用前景。在不同背景下比較mRNA水平同一物種，...

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽，在真核生物中高度保守，可通過異肽鍵與目標(biāo)蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標(biāo)記，泛素用親和標(biāo)簽（通常為6xHis）進行標(biāo)記，并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為A...

泛素化修飾PRM定量驗證：原理： 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外，泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位，調(diào)控包括細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種...

定量磷酸化蛋白質(zhì)翻譯修飾組學(xué)：蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化是重要的翻譯后修飾，它與信號傳導(dǎo)、細胞周期、生長發(fā)育機理等諸多生物學(xué)問題有密切關(guān)系。研究蛋白質(zhì)磷酸化對闡明蛋白質(zhì)功能具有重要意義。將磷酸化肽段TiO2富集技術(shù)和iTRAQ/TMT/Lable free技術(shù)相結(jié)合，實...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾：蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (Protein translational modifications，PTMs) 通過功能基團或蛋白質(zhì)的共價添加、調(diào)節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個蛋白質(zhì)的降解來增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞...

宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)也稱為環(huán)境轉(zhuǎn)錄組學(xué)，指從整體水平上研究某一特定環(huán)境、特定時期菌群群體全部基因轉(zhuǎn)錄情況以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律，以揭示微生物在不同環(huán)境壓力下的適應(yīng)機制，探索環(huán)境與微生物之間的相互作用機理。其適用范圍包括人體微生態(tài)、環(huán)境、工業(yè)、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)以生態(tài)環(huán)境中...

糖基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：蛋白質(zhì)的糖基化具有異質(zhì)性。不同的糖鏈可以連接到同一位點上，不同位點可以連接到同一蛋白質(zhì)上的不同糖鏈上。糖基化的異質(zhì)性嚴(yán)重阻礙了糖蛋白的分離和分析。不同糖類型的相同蛋白質(zhì)，在電泳上會出現(xiàn)分散的條帶，導(dǎo)致信號分散。此外，對低豐度蛋白質(zhì)的識別性...

翻譯后修飾蛋白組分析：蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個細胞過程的重要方式，幾乎在每個細胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計量和豐度存在，這限制了在分析全...

代謝組學(xué)適用范圍：1、體液：血清、血漿、尿液、唾液、膝蓋滑液、腦脊液、卵泡液、牛奶、痰液、舌苔液、膽汁等。2、組織：各種動物組織和植物組織。3、細胞：細胞及細胞培養(yǎng)液等。3、微生物：大腸桿菌、鏈球菌等。4、其他：糞便、食糜、腸道內(nèi)容物等。應(yīng)用領(lǐng)域：1、非靶向代...

蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展趨勢：技術(shù)發(fā)展方面：蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存，各有優(yōu)勢和的特點，而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外，更強調(diào)各種方法間的整合和互補，以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外，蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要...

代謝組學(xué)的概念：代謝組學(xué)的概念來源于代謝組，代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物，代謝組學(xué)則是對某一生物或細胞在一特定生理時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時進行定性和定量分析的一門新學(xué)科。它是以組群指標(biāo)分析為基礎(chǔ)，以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點分析時應(yīng)該注意些什么問題？覆蓋率：覆蓋率越高，檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率：被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低，則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高（> 30％），則有助于識別修飾位點。棕櫚酰化蛋白...

iTRAQ定量蛋白組學(xué)技術(shù)：iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)多肽體外標(biāo)記定量技術(shù)。這種技術(shù)同TMT定量蛋白組學(xué)技術(shù)相似，可研究不同病理條件下或者不同發(fā)育階段的組織樣品...

單細胞RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)工作流程：單細胞RNA測序等高通量單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)通常從針對不同瘤和組織類型（解離、分選和分離細胞等）量身定制的實驗工作流程開始，然后產(chǎn)生可以比對的序列，量化、質(zhì)量控制(QC)過濾和以不同方式標(biāo)準(zhǔn)化，以實現(xiàn)許多下游計算分析，例如聚...

蛋白質(zhì)組學(xué)研究內(nèi)容：1.蛋白質(zhì)鑒定：可以利用一維電泳和二維電泳并結(jié)合相關(guān)技術(shù)，利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術(shù)對蛋白質(zhì)進行鑒定研究。2.翻譯后修飾：很多mRNA表達產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)功能的...

轉(zhuǎn)錄組測序推薦的測序數(shù)據(jù)量？轉(zhuǎn)錄組測序所需數(shù)據(jù)量與所研究物種的基因組大小有關(guān)，基因組越大，則所需數(shù)據(jù)量越大。按照我們的經(jīng)驗來說：常規(guī)物種一般建議6G數(shù)據(jù)即可；基因組較大的物種推薦8G以上數(shù)據(jù)，比如：小麥建議10G數(shù)據(jù)起，甘蔗、甘薯建議至少8G數(shù)據(jù)。轉(zhuǎn)錄組測序必...

非靶向代謝組學(xué)：非靶向代謝組學(xué)可用于檢測生物體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化，通過數(shù)據(jù)處理，多維統(tǒng)計和數(shù)學(xué)建模來分析生物擾動下的代謝指紋圖譜。尋找兩組間發(fā)生明顯變化的差異代謝物，富集差異代謝通路， 獲得整個生物體的代謝輪廓。 技術(shù)優(yōu)勢： 1、代謝組學(xué)能放大基因...