RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢：相比基因芯片和標(biāo)記的堿基序列的測序方法，RNA-seq具有一定的優(yōu)越性。與基因芯片相比，RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用來測量基因的表達(dá)水平情況，還可以揭示未知的轉(zhuǎn)錄組和拼接亞型，并為選擇性拼接亞型提供定量分析。相對于傳...

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用？作為主要研究策略的蛋白質(zhì)組學(xué):這與題目中的描述更相關(guān)些，蛋白質(zhì)組學(xué)是研究中的關(guān)鍵方法(甚至是唯1方法)。具體而言，蛋白質(zhì)組學(xué)在此類應(yīng)用中，更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質(zhì)組學(xué):事實(shí)上，在當(dāng)前的生...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序流程：1、樣品RNA準(zhǔn)備。2、測序文庫構(gòu)建。3、DNA成簇(Cluster)擴(kuò)增。4、高通量測序(Illumina)。5、數(shù)據(jù)分析。轉(zhuǎn)錄組的分析大致有以下幾種情況：1、同一物種在發(fā)育過程中的各時(shí)間節(jié)點(diǎn)的基因表達(dá)特點(diǎn)及存在的差異；2、不同品系之間存在...

我國科學(xué)家已經(jīng)在重大疾病如肝病、維甲酸誘導(dǎo)白血病細(xì)胞凋亡啟動(dòng)模型及維甲酸定向誘導(dǎo)胚胎干細(xì)胞向神經(jīng)系統(tǒng)分化的模型等比較蛋白質(zhì)組研究以及一些重要生理和病理體系的蛋白質(zhì)組成分研究方面獲得了重要成就。蛋白質(zhì)組學(xué)的重要應(yīng)用領(lǐng)域有：在臨床疾病中的應(yīng)用、在微生物蛋白質(zhì)組學(xué)中...

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法介紹：蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法：生物質(zhì)譜：生物質(zhì)譜技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中比較重要的鑒定技術(shù)，其基本原理是樣品分子離子化后，根據(jù)不同離子之間的荷質(zhì)比（M/E）的差異來分離并確定分子量。對于經(jīng)過雙向電泳分離的目標(biāo)蛋白質(zhì)用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)技術(shù)原理：首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物，然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進(jìn)行組分分離以降低樣本復(fù)雜程度，然后通過高質(zhì)量的修飾類抗體和生物材料對修飾肽段進(jìn)行富集，之后上樣至液相色譜 - 串聯(lián)質(zhì)譜中進(jìn)行分析，通過相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫檢索匹配，一次...

代謝組學(xué)技術(shù)介紹：代謝組學(xué)技術(shù)(Metabolomics) 是基因時(shí)代發(fā)展起來的系統(tǒng)生物學(xué)新技術(shù)，以生物體內(nèi)所有代謝產(chǎn)物為研究對象，其主要目標(biāo)是定性定量研究代謝物與機(jī)體生理病理變化之間的關(guān)系。代謝物的變化與細(xì)胞所處內(nèi)外環(huán)境密切相關(guān)。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比，...

翻譯后修飾蛋白組分析：蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個(gè)細(xì)胞過程的重要方式，幾乎在每個(gè)細(xì)胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計(jì)量和豐度存在，這限制了在分析全...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)，基因組學(xué)，蛋白質(zhì)組學(xué)的區(qū)別：蛋白組學(xué)針對的是全體蛋白，組要以2D-Gel和質(zhì)譜為主，分為top-down和bottom-up分析方法。理念和基因組類似，將蛋白用特定的物料化學(xué)手段分解成小肽段，在通過質(zhì)量反推蛋白序列，之后進(jìn)行搜索，標(biāo)識已知未知的蛋白序...

蛋白質(zhì)組學(xué)主要以全蛋白組（組織、細(xì)胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象，通過對蛋白組進(jìn)行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學(xué)功能、作用機(jī)制、疾病診斷的標(biāo)志物以及預(yù)測蛋白的上、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學(xué)可以克服核酸水...

根據(jù)不同的作用位點(diǎn)，蛋白質(zhì)乙?；揎椃譃椋喊l(fā)生在蛋白N端的乙?；揎棥l(fā)生在蛋白賴氨酸上的乙?；揎?。前者發(fā)生在90%以上的真核生物新生蛋白上，對于新生蛋白的成熟和細(xì)胞定位非常重要，由N乙酰轉(zhuǎn)移酶（NATs）負(fù)責(zé)；而后者是一個(gè)可逆的過程，主要由賴氨酸乙酰化酶（...

定量N-糖基化蛋白質(zhì)組學(xué)：蛋白質(zhì)的N-糖基化位點(diǎn)修飾是重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾之一，主要在復(fù)雜的多細(xì)胞或組織形成過程中起關(guān)鍵作用。蛋白質(zhì)的N-糖基化修飾位點(diǎn)具有保守的氨基酸序列NX（S/T）（其中X為除脯氨酸以外的其它氨基酸）凝集素親和法是目前糖蛋白質(zhì)組學(xué)中應(yīng)用...

蛋白質(zhì)組研究：蛋白質(zhì)組研究是指系統(tǒng)研究在某一特定時(shí)間、特定條件下，某一種特定組織中的所有蛋白質(zhì)。對蛋白質(zhì)的研究也不只是局限于蛋白質(zhì)的氨基酸序列，而是包括了蛋白質(zhì)的表達(dá)量，蛋白質(zhì)活性，被修飾的狀況以及和其他蛋白質(zhì)或分子的相互作用情況、亞細(xì)胞定位和三維結(jié)構(gòu)。這些信...

單細(xì)胞RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)工作流程：單細(xì)胞RNA測序等高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)通常從針對不同瘤和組織類型（解離、分選和分離細(xì)胞等）量身定制的實(shí)驗(yàn)工作流程開始，然后產(chǎn)生可以比對的序列，量化、質(zhì)量控制(QC)過濾和以不同方式標(biāo)準(zhǔn)化，以實(shí)現(xiàn)許多下游計(jì)算分析，例如聚...

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)原理：盡管質(zhì)譜儀器的分析能力近年來有了長足的發(fā)展，但是由于蛋白翻譯后修飾化學(xué)計(jì)量值低、復(fù)雜性大，直接將蛋白組(如全細(xì)胞裂解產(chǎn)物，組織勻漿產(chǎn)物或全血清蛋白)的酶解肽段送入質(zhì)譜鑒定和定量PTM是非常困難的。因此，很多翻譯后修飾的富集方法會(huì)被...

定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析（QuantitativeProteomics）是對一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行精確鑒定和定量?？捎糜诤Y選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達(dá)蛋白，結(jié)合生物信息學(xué)揭示細(xì)胞生理病理等功能，同時(shí)也可對某些關(guān)鍵蛋白...

代謝組學(xué)樣本收集指南：1.血漿樣本收集：（1）從合適的靜脈采集血液（典型10mL）到標(biāo)記的肝素鋰血漿收集管中（肝素鋰用作抗凝劑）。（2）立即于4 °C離心（3000g）20min，上清液即為血漿。（3）離心完畢，取出血漿收集管，取上清液（血漿），分等份（0.5...

代謝組學(xué)樣本收集植物組織：葉片、莖、花：1）取整片葉片/一段莖/一朵花，放入離心管或錫箔紙中并標(biāo)記，迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中（每組一袋），在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。3）迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足...

定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：定量蛋白質(zhì)組學(xué)是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容，通過對基因表達(dá)產(chǎn)物——蛋白質(zhì)的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達(dá)情況。近年來，隨著非凝膠技術(shù)的發(fā)展，蛋白質(zhì)組學(xué)（“Shotgun”proteomics）技術(shù)，特別是多維蛋白質(zhì)鑒定...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾加入的官能團(tuán)反應(yīng)有：1、乙酰化——通常于蛋白質(zhì)的N末端加入乙酰。2、烷基化——加入如甲基或乙基等烷基。3、甲基化——烷基化中常見的一種，在賴氨酸、精氨酸等的側(cè)鏈氨基上加入甲基。4、生物素化——用生物素附加物令保存的賴氨酸?；?、谷氨酸化——在...

代謝組學(xué)（英語：metabolomics）是對細(xì)胞，生物流體，組織或生物體內(nèi)的小分子（通常稱為代謝物，metabolites）的大規(guī)模研究。 這些小分子及其在生物系統(tǒng)中的相互作用統(tǒng)稱為代謝組。能夠?qū)ι飿颖局械拇x物進(jìn)行全方面分析的一項(xiàng)新興技術(shù)，被定義為代謝組...

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)樣品要求：1、動(dòng)物組織的樣品量濕重不少于200mg。2、植物細(xì)菌、噬菌體等微生物類樣品量濕重不少于2g。3、富含雜質(zhì)或蛋白質(zhì)含量低的樣品量濕重不少于5g；如植物的根，木質(zhì)部、韌皮部組織等。4、體液類（唾液、羊水、腦脊液等）10mL以上，要保...

代謝組學(xué)究竟是一門什么樣的研究方向？首先定義什么是代謝組學(xué)。簡單的說就是研究生物體對內(nèi)外刺激的整體代謝應(yīng)答規(guī)律。那么為什么代謝組學(xué)是基因組，轉(zhuǎn)錄組，蛋白質(zhì)組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向，的執(zhí)行者蛋白質(zhì)中很多酶參與了體內(nèi)的代...

泛素化修飾蛋白質(zhì)組技術(shù)原理：首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物，然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進(jìn)行組分分離以降低樣本復(fù)雜程度，然后通過高質(zhì)量的泛素化修飾類抗體和生物材料對修飾肽段進(jìn)行富集，之后上樣至液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜中進(jìn)行分析定量。技術(shù)優(yōu)勢：1、高特異性的修...

蛋白質(zhì)組研究內(nèi)容：1.蛋白質(zhì)鑒定：可以利用一維電泳和二維電泳并結(jié)合Western等技術(shù)，利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術(shù)對蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定研究。2.翻譯后修飾：很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)...

代謝組學(xué)概念：基因與蛋白質(zhì)的表達(dá)緊密相連，而代謝物則更多地反映了細(xì)胞所處的環(huán)境，這又與細(xì)胞的營養(yǎng)狀態(tài)，藥物和環(huán)境污染物的作用，以及其它外界因素的影響密切相關(guān)。因此有人認(rèn)為，“基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)告訴你什么可能會(huì)發(fā)生，而代謝組學(xué)則告訴你什么確實(shí)發(fā)生了?！贝x組學(xué)...

翻譯后修飾蛋白組分析：蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個(gè)細(xì)胞過程的重要方式，幾乎在每個(gè)細(xì)胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計(jì)量和豐度存在，這限制了在分析全...

蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)技術(shù)原理：首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物，然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進(jìn)行組分分離以降低樣本復(fù)雜程度，然后通過高質(zhì)量的修飾類抗體和生物材料對修飾肽段進(jìn)行富集，之后上樣至液相色譜 - 串聯(lián)質(zhì)譜中進(jìn)行分析，通過相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫檢索匹配，一次...

轉(zhuǎn)錄組分析是目前應(yīng)用比較廣的高通量測序分析技術(shù)之一。常見設(shè)計(jì)是不同樣品之間比較，尋找差異基因、標(biāo)志基因、協(xié)同變化基因、差異剪接和新轉(zhuǎn)錄本，并進(jìn)行結(jié)果可視化、功能注釋和網(wǎng)絡(luò)分析等。轉(zhuǎn)錄組的測序分析也相對成熟，從RNA提取、構(gòu)建文庫、上機(jī)測序再到結(jié)果解析既可以自己...

蛋白質(zhì)組學(xué)樣品寄樣要求：動(dòng)物組織的樣本蛋白量相對較高，送樣量的要求也相對比較寬松，一般提供50~100mg的量即可。此外，組織上有血跡、脂肪、結(jié)締組織的還需要用PBS和組織剪將其清理干凈。送樣前將樣品用液氮速凍5min，放置在-80℃保存，送樣時(shí)需要置于干冰環(huán)...