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蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)技術(shù)服務(wù):乙酰化修飾是體內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾,對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。此外,還存在大量的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。乙?;揎椊M學(xué)技術(shù)服務(wù)采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對(duì)蛋白乙酰化鑒定的影響,再結(jié)合免疫共沉淀通過高效的抗體富集乙?;碾亩?,從而實(shí)現(xiàn)大規(guī)模乙酰化的鑒定及定量。蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù):泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動(dòng)。蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指對(duì)翻譯后的蛋白質(zhì)進(jìn)行共價(jià)加工的過程。貴州泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)主要方式
泛素化修飾蛋白質(zhì)組技術(shù)原理:首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物,然后使用液相色譜對(duì)酶解后的肽段混合物進(jìn)行組分分離以降低樣本復(fù)雜程度,然后通過高質(zhì)量的泛素化修飾類抗體和生物材料對(duì)修飾肽段進(jìn)行富集,之后上樣至液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜中進(jìn)行分析定量。技術(shù)優(yōu)勢:1、高特異性的修飾類泛抗體;2、高分辨率、高靈敏度質(zhì)譜儀;應(yīng)用領(lǐng)域:泛素化修飾還參與了細(xì)胞周期、增殖、細(xì)胞凋亡、分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號(hào)傳遞、損傷修復(fù)、炎癥免疫等幾乎一切生命活動(dòng)的調(diào)控。泛素化心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此,作為近年來生物化學(xué)研究的一個(gè)重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點(diǎn)。江蘇蛋白質(zhì)棕櫚酰化修飾組學(xué)方法蛋白質(zhì)翻譯后修飾PTMs通常包括磷酸化,糖基化,泛素化,亞硝基化,甲基化,乙?;?,脂質(zhì)化和蛋白水解。
乙酰化修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用方向:1、乙?;揎椗c細(xì)胞基因表達(dá)調(diào)控、表觀調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性等生理過程研究。2、乙?;鸬拇x疾病、代謝紊亂發(fā)生等疾病機(jī)理研究。乙酰化生物學(xué)意義:1、調(diào)節(jié)DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用;2、與其他PTMs發(fā)生crosstalk;3、調(diào)節(jié)酶活性;4、調(diào)控蛋白亞細(xì)胞定位。生物領(lǐng)域各個(gè)研究方面,如:1、農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,生長發(fā)育機(jī)制,育種保護(hù)研究等;2、 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機(jī)理研究等。
乙?;揎椀鞍捉M學(xué)實(shí)驗(yàn)流程:1)組織/細(xì)胞破碎,提取蛋白質(zhì);2)蛋白酶解成多肽片段;3)對(duì)多肽片段進(jìn)行 iTRAQ 標(biāo)記;4)高效特異性乙?;贵w富集乙?;揎楇亩危?)使用 LC-MS/MS 對(duì)富集的乙?;亩芜M(jìn)行序列分析;5)數(shù)據(jù)分析,比對(duì)不同樣本中蛋白乙酰化修飾水平差異,并對(duì)產(chǎn)生變化的生物學(xué)意義進(jìn)行解釋。乙?;且粋€(gè)普遍而重要的蛋白質(zhì)翻譯后修飾,不僅集中在對(duì)細(xì)胞染色體結(jié)構(gòu)的影響以及對(duì)核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子方面,而且還影響參與細(xì)胞周期和新陳代謝、肌動(dòng)蛋白聚合控制及多聚谷氨酰胺疾病等方方面面。乙?;粌H存在于真核細(xì)胞中,而且越來越多的證據(jù)也表明乙酰化同樣影響許多原核細(xì)胞的生理生化過程。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的定位。
甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域:基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型,個(gè)性化治理等;生物醫(yī)藥:藥物作用機(jī)理,藥效評(píng)價(jià),藥物開發(fā)等;農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,生長發(fā)育機(jī)制,育種保護(hù)研究等;畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機(jī)理研究等;微生物領(lǐng)域:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等;海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等。技術(shù)優(yōu)勢:采用抗體,特異性高;鑒定通量高, 一次可檢測高可達(dá)上千個(gè)甲基化修飾位點(diǎn)。已知的蛋白質(zhì)翻譯后修飾種類有20多種。貴州蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)一般流程
蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個(gè)共價(jià)加工過程。貴州泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)主要方式
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)樣品要求:1、動(dòng)物組織的樣品量濕重不少于200mg。2、植物細(xì)菌、噬菌體等微生物類樣品量濕重不少于2g。3、富含雜質(zhì)或蛋白質(zhì)含量低的樣品量濕重不少于5g;如植物的根,木質(zhì)部、韌皮部組織等。4、體液類(唾液、羊水、腦脊液等)10mL以上,要保證不能溶血;血清要求500μl以上;尿液要求50mL以上。5、如直接提供蛋白質(zhì)提取物,濃度不少于2 mg/mL,總量不少于1 mg。為保證實(shí)驗(yàn)效果,請盡量告知緩沖液成分,如是否有硫脲、SDS、強(qiáng)離子鹽等等。另樣品中應(yīng)不含核酸、脂類、多糖等影響分離效果的成分。6、在細(xì)胞器蛋白質(zhì)組學(xué)方面,提取細(xì)胞器或亞細(xì)胞器后,蛋白沉淀量在1 mg以上。貴州泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)主要方式