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蛋白質(zhì)組學(xué):常用技術(shù):靶向蛋白組(PRM靶向蛋白/肽段定量),修飾蛋白組學(xué)(定量磷酸化修飾組學(xué)、定量糖基化修飾蛋白組學(xué)、定量乙?;揎椀鞍捉M學(xué)和定量泛素化修飾蛋白組學(xué)),互作蛋白組學(xué)(代謝物與蛋白互作研究)。什么樣本能做蛋白組學(xué)檢測(cè)?大概可以測(cè)到多少的蛋白種類(lèi)?原則上只要能提取到蛋白,就可以做蛋白組檢測(cè)。樣本測(cè)到的蛋白種類(lèi)跟數(shù)據(jù)庫(kù)和樣本本身蛋白濃度有關(guān),一般數(shù)據(jù)庫(kù)越大,可以鑒定到的蛋白質(zhì)數(shù)量越多。也與樣本的類(lèi)型有關(guān),通常,組織細(xì)胞相比于體液樣本,能夠鑒定到更多的蛋白。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存。武漢醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用
蛋白質(zhì)組學(xué):對(duì)人類(lèi)而言,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究終究要服務(wù)于人類(lèi)的健康,主要指促進(jìn)分子醫(yī)學(xué)的發(fā)展。如尋找藥物的靶分子。很多藥物本身就是蛋白質(zhì),而很多藥物的靶分子也是蛋白質(zhì)。藥物也可以干預(yù)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和疾病機(jī)理研究中,了解人不同發(fā)育、生長(zhǎng)期和不同生理、病理?xiàng)l件下及不同細(xì)胞類(lèi)型的基因表達(dá)的特點(diǎn)具有特別重要的意義。這些研究可能找到直接與特定生理或病理狀態(tài)相關(guān)的分子,進(jìn)一步為設(shè)計(jì)作用于特定靶分子的藥物奠定基礎(chǔ)。江蘇DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究定量蛋白質(zhì)組學(xué)通過(guò)對(duì)蛋白質(zhì)的定量分析,以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達(dá)情況。
蛋白質(zhì)組研究?jī)?nèi)容:1.蛋白質(zhì)鑒定:可以利用一維電泳和二維電泳并結(jié)合Western等技術(shù),利用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及免疫共沉淀等技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定研究。2.翻譯后修飾:很多mRNA表達(dá)產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要經(jīng)歷翻譯后修飾如磷酸化,糖基化,酶原刺激等。翻譯后修飾是蛋白質(zhì)調(diào)節(jié)功能的重要方式,因此對(duì)蛋白質(zhì)翻譯后修飾的研究對(duì)闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用?;?受體結(jié)合分析??梢岳没蚯贸头戳x技術(shù)分析基因表達(dá)產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功能。另外對(duì)蛋白質(zhì)表達(dá)出來(lái)后在細(xì)胞內(nèi)的定位研究也在一定程度上有助于蛋白質(zhì)功能的了解。
我國(guó)科學(xué)家已經(jīng)在重大疾病如肝病、維甲酸誘導(dǎo)白血病細(xì)胞凋亡啟動(dòng)模型及維甲酸定向誘導(dǎo)胚胎干細(xì)胞向神經(jīng)系統(tǒng)分化的模型等比較蛋白質(zhì)組研究以及一些重要生理和病理體系的蛋白質(zhì)組成分研究方面獲得了重要成就。蛋白質(zhì)組學(xué)的重要應(yīng)用領(lǐng)域有:在臨床疾病中的應(yīng)用、在微生物蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用、在植物研究中的應(yīng)用、在腎臟病學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用。我們通過(guò)研究蛋白質(zhì)組,可以為患者提供有用的疾病診斷、診療、預(yù)后評(píng)估信息;可以早期更為準(zhǔn)確的診斷出胰腺?。灰部梢詾锳D的診斷、診療藥物的設(shè)計(jì)和篩選奠定基礎(chǔ)。這項(xiàng)研究技術(shù)其實(shí)離我們生活非常近,對(duì)我們生命而言尤為重要。近年來(lái),高通量蛋白質(zhì)分離與鑒定技術(shù),如雙向電泳、生物質(zhì)譜、蛋白質(zhì)芯片、酵母雙雜交系統(tǒng)、生物信息學(xué)等相繼建立并日趨完善,加速了蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展。iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù)。
蛋白質(zhì)組學(xué)的介紹:蛋白組學(xué)主要以全蛋白組(組織、細(xì)胞)、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對(duì)象,通過(guò)對(duì)蛋白組進(jìn)行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析,揭示生物學(xué)功能、作用機(jī)制、疾病診斷的標(biāo)志物以及預(yù)測(cè)蛋白的上、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學(xué)可以克服核酸水平預(yù)測(cè)的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。修飾蛋白組學(xué)(定量磷酸化修飾組學(xué)、定量糖基化修飾蛋白組學(xué)、定量乙?;揎椀鞍捉M學(xué)和定量泛素化修飾蛋白組學(xué))。蛋白質(zhì)組隨著基因組學(xué)研究的不斷深入,蛋白質(zhì)組學(xué)已逐漸成為研究熱點(diǎn)。南京DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)價(jià)格
蛋白質(zhì)組學(xué)對(duì)理解細(xì)胞生長(zhǎng)、分化、代謝、衰老與病變有著重要作用。武漢醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用
iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組技術(shù)優(yōu)勢(shì):1、結(jié)果可靠:基于高靈敏度和高分辨的串聯(lián)質(zhì)譜方法,定性與定量同步進(jìn)行,同時(shí)得出定性和定量結(jié)果,重復(fù)樣品間的蛋白表達(dá)量相關(guān)性高;2、靈敏度高:分級(jí)分離,降低樣品復(fù)雜度,相比凝膠電泳觀測(cè)到的蛋白變化在2倍以上,iTRAQ計(jì)算出的蛋白變化在1.3-1.6倍之間,可檢測(cè)低豐度蛋白;3、分離能力強(qiáng):可分離出酸/堿性蛋白,小于10KDa或大于200KDa的蛋白、難溶性蛋白等;4、自動(dòng)化程度高:液質(zhì)聯(lián)用,自動(dòng)化操作,分析速度快,分離效果好。武漢醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用