甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域:基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型,個性化治理等;生物醫(yī)藥:藥物作用機(jī)理,藥效評價,藥物開發(fā)等;農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,生長發(fā)育機(jī)制,育種保護(hù)研究等;畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機(jī)理研究等;微生物領(lǐng)域:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等;海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等。技術(shù)優(yōu)勢:采用抗體,特異性高;鑒定通量高, 一次可檢測高可達(dá)上千個甲基化修飾位點。在眾多乙?;揎椀牡鞍踪|(zhì)中,研究較多的要數(shù)細(xì)胞核中包圍DNA的組蛋白了。廣東琥珀酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析
蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點分析時應(yīng)該注意些什么問題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測和鑒定含有修飾基團(tuán)的肽幾率就越大。修飾位點的占有率:被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低,則檢測到修飾肽的機(jī)會會隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識別修飾位點。棕櫚酰化蛋白修飾質(zhì)譜鑒定方法:S-棕櫚?;闹饕δ苁谴龠M(jìn)蛋白質(zhì)與細(xì)胞膜的結(jié)合。蛋白質(zhì)可以由一個棕櫚?;M成,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質(zhì),如豆蔻酰基。由于對S-棕櫚?;鞍追治鋈匀痪哂刑魬?zhàn)性,由于S-棕櫚酰化修飾蛋白亞水平以及疏水性和潛在不穩(wěn)定的硫代質(zhì)鏈的S-脂?;摹,F(xiàn)在常用的幾種方法可以捕獲S-脂?;鞍滓约皩δ繕?biāo)修飾蛋白進(jìn)行捕獲。江蘇蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)質(zhì)譜可以用于已知和未知的翻譯后修飾檢測。
蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué):是植物體內(nèi)比較常見的PTM修飾手段。它是指通過蛋白激酶和磷酸酶的作用在特定絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的羥基上添加或去除一個或多個磷酸基團(tuán),進(jìn)而有效地改變底物蛋白的結(jié)構(gòu)和活性。在植物體內(nèi)主要參與植物溫度脅迫、鹽脅迫、干旱脅迫、養(yǎng)分脅迫調(diào)控等大多數(shù)代謝和生理途徑。蛋白質(zhì)磷酸化對于許多生物現(xiàn)象的引發(fā)是很必要的,包括細(xì)胞生長、增殖、泛素(ubiquitin)介導(dǎo)的蛋白降解等過程。特別是酪氨酸磷酸化,作為細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和酶活性調(diào)控的一種主要方式,通常通過引發(fā)蛋白質(zhì)之間的相互作用,進(jìn)而介導(dǎo)生長因子和細(xì)胞因子等對細(xì)胞膜上受體的信號調(diào)控。
泛素化修飾蛋白質(zhì)組技術(shù)原理:首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物,然后使用液相色譜對酶解后的肽段混合物進(jìn)行組分分離以降低樣本復(fù)雜程度,然后通過高質(zhì)量的泛素化修飾類抗體和生物材料對修飾肽段進(jìn)行富集,之后上樣至液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜中進(jìn)行分析定量。技術(shù)優(yōu)勢:1、高特異性的修飾類泛抗體;2、高分辨率、高靈敏度質(zhì)譜儀;應(yīng)用領(lǐng)域:泛素化修飾還參與了細(xì)胞周期、增殖、細(xì)胞凋亡、分化、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、基因表達(dá)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號傳遞、損傷修復(fù)、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調(diào)控。泛素化心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此,作為近年來生物化學(xué)研究的一個重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有可逆的特性。
磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù):蛋白質(zhì)的磷酸化修飾是生物體內(nèi)重要的共價修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性,以及磷酸基團(tuán)的供體ATP的易得性,使得磷酸化修飾被真核細(xì)胞所選擇接受成為一種比較普遍的調(diào)控手段。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程,幾乎調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞的增殖、發(fā)育、分化、細(xì)胞骨架調(diào)控、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動、肌肉收縮、新陳代謝發(fā)生等生命活動的所有過程,并且可逆的蛋白質(zhì)磷酸化是目前所知道的比較主要的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)方式。目前已經(jīng)知道有許多人類疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導(dǎo)致的后果。蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析。山東蛋白質(zhì)棕櫚酰化修飾組學(xué)價格
樣品中翻譯后修飾蛋白質(zhì)含量低、動態(tài)范圍廣給相關(guān)研究帶來了很大的挑戰(zhàn)。廣東琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析
琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組鑒定:蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾是新近發(fā)現(xiàn)的一種蛋白質(zhì)翻譯后修飾,是在琥珀酰輔酶 A 的介導(dǎo)下將一個負(fù)電荷四碳琥珀酰基轉(zhuǎn)移到賴氨酸殘基的伯胺上的過程。賴氨酸琥珀?;谡婧思?xì)胞及原核細(xì)胞中普遍存在,參與調(diào)控包括三羧酸循環(huán),氨基酸代謝以及脂肪酸代謝在內(nèi)的多個代謝信號通路。琥珀?;鞍踪|(zhì)組以組織、細(xì)胞等較為復(fù)雜樣本為研究對象,目的在于鑒定樣品中發(fā)生琥珀?;揎椀牡鞍踪|(zhì)以及相應(yīng)的琥珀酰化修飾位點。琥珀酰化修飾蛋白質(zhì)組技術(shù)特點:采用主流抗體親和富集方法,特異性高,富集效率好。廣東琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析