蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展趨勢：技術(shù)發(fā)展方面：蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存，各有優(yōu)勢和的特點，而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外，更強調(diào)各種方法間的整合和互補，以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外，蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要，這種交叉是新技術(shù)新方法的活水之源，特別是，蛋白質(zhì)組學(xué)與其它大規(guī)?？茖W(xué)如基因組學(xué)，生物信息學(xué)等領(lǐng)域的交叉，構(gòu)成組學(xué)（omics）生物技術(shù)研究方法，所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(xué)（SystemBiology）研究模式，將成為未來生命科學(xué)比較令人激動的新前沿。蛋白質(zhì)組的復(fù)雜性也遠遠高于基因組，這是因為一個基因≠一個轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物≠一個蛋白質(zhì)。杭州新型修飾蛋白組學(xué)領(lǐng)域
蛋白組學(xué)樣本寄送前是否需要精確計數(shù)或是稱量？不同樣本寄送會有不同的送樣要求，按照收集方法提供可以保證實驗用量充足。不需要精確計數(shù)或是稱量，項目開展前會進行蛋白濃度的測定，后續(xù)也是不同樣本等蛋白量處理、上機檢測，但是要保證每個樣本的寄樣量達到實驗要求。常規(guī)定量蛋白組實驗的主要步驟有哪些，數(shù)據(jù)分析內(nèi)容包含哪些？實驗步驟：首先獲得生物學(xué)樣本，然后進行蛋白提取，定量，SDS-PAGE跑膠質(zhì)控，還原烷基化，酶解，獲得肽段，（標記+分組分），上機檢測，搜庫軟件搜庫，數(shù)據(jù)分析；數(shù)據(jù)分析：主要分為基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析、?級數(shù)據(jù)分析和個性化數(shù)據(jù)分析三個部分。基礎(chǔ)分析主要包括差異表達蛋白篩選、層次聚類分析分析、COG注釋分析、亞細胞定位分析、GO注釋富集分析、KEGG注釋分析、PPI分析等。山東醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)主要技術(shù)蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存，各有優(yōu)勢和局限的特點。
4D定量蛋白質(zhì)組學(xué) ：目前，蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時間（retention time）、質(zhì)荷比（m/z）、離子強度（intensity）這三個維度對肽蛋白質(zhì)進行鑒定和定量，即3D蛋白質(zhì)組學(xué)。4D蛋白質(zhì)組學(xué)在3D蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)之上增加了第四維度，離子淌度（mobility），主要根據(jù)離子的形狀和截面對離子進行分離，能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段，使低豐度蛋白信號能夠被區(qū)分和識別出來。蛋白質(zhì)組學(xué)分析策略：蛋白質(zhì)組學(xué)分析包括分析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能、翻譯后修飾情況、蛋白質(zhì)定位、蛋白質(zhì)表達情況以及蛋白質(zhì)間的相互作用等等?；诓煌姆治鰞?nèi)容可以采用不同的蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)和分析策略。
蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用？基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段，當(dāng)前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。隨著質(zhì)譜、系統(tǒng)生物學(xué)、生物信息學(xué)等相關(guān)學(xué)科的發(fā)展，我認為今后我們會更多地在現(xiàn)實生活中見到蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)的應(yīng)用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變（鐮刀形紅細胞癥）、糖化血紅蛋白比例測定等。從測試體量估計，應(yīng)該遠小于1%的ELISA測試量。由于成本和通量等原因，蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)并不如ELISA適合大量的日常分析。但對于一些分析有問題的項目，采用基于質(zhì)譜（或二維膠等手段）的蛋白質(zhì)組學(xué)有獨特的技術(shù)優(yōu)勢。另外，蛋白質(zhì)組學(xué)方法開發(fā)和驗證周期短，在中高級特殊應(yīng)用（如極少使用的特殊蛋白指標臨床檢測、未知疾病研究和控制）中也有其獨特優(yōu)勢。蛋白質(zhì)組學(xué)研究策略有什么？
蛋白質(zhì)組學(xué)研究這樣做：蛋白質(zhì)組與基因組相對應(yīng)，也是一個整體的概念，隨著基因組學(xué)研究的不斷深入，蛋白質(zhì)組學(xué)已逐漸成為研究熱點，對蛋白組學(xué)的研究可以使我們更容易接近生命的機理本質(zhì)，但探究成千上萬的蛋白質(zhì)特性也是一個重大的技術(shù)挑戰(zhàn)。蛋白質(zhì)組（Proteome）指的是某一時刻或某一狀態(tài)基因組表達的所有相應(yīng)的蛋白，即細胞、組織或機體全部蛋白質(zhì)的存在及活動形式，其是一個動態(tài)概念，它是在組織、細胞的整體蛋白質(zhì)水平上，探索蛋白質(zhì)作用模式、功能機理、調(diào)節(jié)控制以及蛋白質(zhì)群體內(nèi)的相互關(guān)系、從而獲得生命活動調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的全方面而深入的認識，以揭示生命活動的基本規(guī)律。蛋白質(zhì)組具有很高的細胞和組織特異性，不同的細胞組織表達不同的蛋白質(zhì)組。浙江修飾蛋白組學(xué)領(lǐng)域
DIA 定量蛋白質(zhì)組學(xué)可以采集所有離子及碎片圖譜，重現(xiàn)性好。杭州新型修飾蛋白組學(xué)領(lǐng)域
蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用？具體而言，蛋白質(zhì)組學(xué)在此類應(yīng)用中，更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質(zhì)組學(xué)：事實上，在當(dāng)前的生物醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷中，蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)有非常多的應(yīng)用。因為蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)（從分析化學(xué)角度來看），就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析。生物醫(yī)學(xué)和臨床診斷中，需要大量表征一種或多種蛋白質(zhì)的含量、氨基酸序列、翻譯后修飾等信息。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨特優(yōu)勢。有很多蛋白質(zhì)組學(xué)的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進行相關(guān)研究和日常工作。很容易發(fā)現(xiàn)，當(dāng)前蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床應(yīng)用更多地集中在第二類。第1類的應(yīng)用更接近于生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究，目前還沒有和大部分人的現(xiàn)實生活產(chǎn)生關(guān)系。杭州新型修飾蛋白組學(xué)領(lǐng)域