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翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTMs)是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后的化學(xué)修飾過(guò)程。蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTMs)通過(guò)給蛋白質(zhì)添加磷酸酯、乙酸酯、酰胺基或甲基等官能團(tuán)增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性,并影響正常細(xì)胞生物學(xué)和發(fā)病機(jī)理的幾乎所有方面。蛋白質(zhì)翻譯后修飾在許多細(xì)胞過(guò)程中起著關(guān)鍵作用,如細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)降解、信號(hào)傳導(dǎo)和調(diào)節(jié)過(guò)程、基因表達(dá)調(diào)節(jié)以及蛋白質(zhì)相互作用。蛋白質(zhì)翻譯后修飾PTMs通常包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙?;⒅|(zhì)化和蛋白水解。因此,PTM的特征(包括修飾類(lèi)別和修飾位點(diǎn))在細(xì)胞生物學(xué)以及疾病診斷和預(yù)防研究中至關(guān)重要。乙酰化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù)采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對(duì)蛋白乙?;b定的影響。貴州蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學(xué)質(zhì)譜鑒定
琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組:蛋白質(zhì)琥珀酰化(succinylation)修飾是指琥珀?;鶊F(tuán)供體(如琥珀酰輔酶A)通過(guò)酶學(xué)或者非酶學(xué)的方式將琥珀?;鶊F(tuán)共價(jià)結(jié)合到底物蛋白質(zhì)的賴(lài)氨酸殘基的過(guò)程。琥珀?;揎椯x予賴(lài)氨酸基團(tuán)2個(gè)負(fù)電荷,能夠引發(fā)更多蛋白質(zhì)特性的改變,且琥珀?;鶊F(tuán)空間結(jié)構(gòu)較大,對(duì)于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的影響更為明顯。在真核和原核生物中,琥珀?;且环N保守的修飾類(lèi)型。琥珀酰化和乙酰化具有非常強(qiáng)的相關(guān)性,在已有的研究中,大量發(fā)生琥珀酰化的位點(diǎn)同時(shí)也能檢測(cè)到乙?;揎?。琥珀酰化參與了很多關(guān)鍵能量代謝途徑(包括三羧酸循環(huán)、糖代謝等),影響線粒體中的代謝過(guò)程,對(duì)線粒體失調(diào)相關(guān)的疾病的研究具有重要價(jià)值。江蘇蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)質(zhì)譜分析研究蛋白質(zhì)磷酸化對(duì)闡明蛋白質(zhì)功能具有重要意義。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾:蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (Protein translational modifications,PTMs) 通過(guò)功能基團(tuán)或蛋白質(zhì)的共價(jià)添加、調(diào)節(jié)亞基的蛋白水解切割或整個(gè)蛋白質(zhì)的降解來(lái)增加蛋白質(zhì)組的功能多樣性。這些修飾包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙?;⒅|(zhì)化和蛋白水解,幾乎影響正常細(xì)胞生物學(xué)和發(fā)病機(jī)制的所有方面。因此,識(shí)別和理解 PTM 在細(xì)胞生物學(xué)和疾病療理和預(yù)防的研究中至關(guān)重要。蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTMs) 進(jìn)一步促進(jìn)了從基因組水平到蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的增加。PTMs 是一種化學(xué)修飾,在功能蛋白質(zhì)組中發(fā)揮關(guān)鍵作用,因?yàn)樗鼈冋{(diào)節(jié)活性、定位以及與其他細(xì)胞分子(如蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)和輔助因子)的相互作用。
乙酰化修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用方向:1、乙?;揎椗c細(xì)胞基因表達(dá)調(diào)控、表觀調(diào)控、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性等生理過(guò)程研究。2、乙?;鸬拇x疾病、代謝紊亂發(fā)生等疾病機(jī)理研究。乙?;飳W(xué)意義:1、調(diào)節(jié)DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用;2、與其他PTMs發(fā)生crosstalk;3、調(diào)節(jié)酶活性;4、調(diào)控蛋白亞細(xì)胞定位。生物領(lǐng)域各個(gè)研究方面,如:1、農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機(jī)制,生長(zhǎng)發(fā)育機(jī)制,育種保護(hù)研究等;2、 畜牧業(yè):肉類(lèi)及乳品質(zhì)研究,致病機(jī)理研究等。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有全方面性。
泛素化修飾PRM定量驗(yàn)證:原理: 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動(dòng)。首先對(duì)泛素化的蛋白進(jìn)行胰酶消化,在賴(lài)氨酸的修飾位點(diǎn)上會(huì)產(chǎn)生兩個(gè)甘氨酸的殘基(K-GG),利用對(duì)泛素化賴(lài)氨酸(K-GG)具有高親和力的基序抗體,特異性富集復(fù)雜樣本中的泛素化肽段,結(jié)合LC-MS/MS蛋白質(zhì)定量方法,實(shí)現(xiàn)大規(guī)模泛素化蛋白質(zhì)定性定量分析。在細(xì)胞中,乙?;揎椀姆磻?yīng)由乙?;D(zhuǎn)移酶所催化,將乙酰輔酶A的乙?;D(zhuǎn)移并添加在蛋白質(zhì)賴(lài)氨酸殘基上。貴州蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學(xué)質(zhì)譜鑒定
蛋白磷酸化修飾過(guò)程是通過(guò)蛋白激酶催化,將磷酸基團(tuán)從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸、或酪氨酸殘基上。貴州蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾組學(xué)質(zhì)譜鑒定
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)的作用:泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此,作為近年來(lái)生物化學(xué)研究的一個(gè)重大成果,它已然成為研究、開(kāi)發(fā)新藥物的新靶點(diǎn)。技術(shù)原理是首先將蛋白樣本酶解成肽段混合物,然后使用液相色譜對(duì)酶解后的肽段混合物進(jìn)行組分分離以降低樣本復(fù)雜程度,然后通過(guò)高質(zhì)量的泛素化修飾抗體和生物材料對(duì)修飾肽段進(jìn)行富集,之后上樣至液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜中進(jìn)行分析定量。技術(shù)優(yōu)勢(shì):高特異性的修飾抗體;高分辨率、高靈敏度質(zhì)譜儀;鑒定通量高;可與代謝組學(xué)等進(jìn)行多組學(xué)聯(lián)合分析。貴州蛋白質(zhì)琥珀?;揎椊M學(xué)質(zhì)譜鑒定