江蘇靶向代謝組學(xué)鑒定

來源: 發(fā)布時間:2022-05-09

代謝組學(xué)概念:基因與蛋白質(zhì)的表達(dá)緊密相連,而代謝物則更多地反映了細(xì)胞所處的環(huán)境,這又與細(xì)胞的營養(yǎng)狀態(tài),藥物和環(huán)境污染物的作用,以及其它外界因素的影響密切相關(guān)。因此有人認(rèn)為,“基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)告訴你什么可能會發(fā)生,而代謝組學(xué)則告訴你什么確實發(fā)生了?!贝x組學(xué)的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細(xì)胞在一特定生理時期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物,代謝組學(xué)則是對某一生物或細(xì)胞在一特定生理時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時進(jìn)行定性和定量分析的一門新學(xué)科。它是以組群指標(biāo)分析為基礎(chǔ),以高通量檢測和數(shù)據(jù)處理為手段,以信息建模與系統(tǒng)整合為目標(biāo)的系統(tǒng)生物學(xué)的一個分支。代謝組學(xué)是在基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來的一門學(xué)科。江蘇靶向代謝組學(xué)鑒定

靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)分析主要是以標(biāo)準(zhǔn)品為參照,對特定的代謝物群進(jìn)行有針對性地、特異性地檢測與分析。通常采用的技術(shù)方案包括常規(guī)的液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)分析技術(shù)和選擇性反應(yīng)/多反應(yīng)監(jiān)測技術(shù)(MRM/ SRM)。常規(guī)分析法首先利用LC-MS的方法對待分析樣本進(jìn)行大規(guī)模代謝組分析,然后通過與相同分析條件下標(biāo)準(zhǔn)品的分析結(jié)果進(jìn)行比對,實現(xiàn)對樣本內(nèi)目標(biāo)代謝群的定性和定量分析。MRM/SRM技術(shù)是基于已知或假定的反應(yīng)離子信息,有針對性地選擇數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)譜信號采集,對符合規(guī)則的離子對進(jìn)行信號記錄,去除不符合規(guī)則離子信號的干擾。定量過程中,該技術(shù)首先篩選到目標(biāo)代謝物特異性的母離子,然后選擇性地對這些母離子進(jìn)行碰撞誘導(dǎo),去除其他離子的干擾,只對選定的特異MS/MS2離子進(jìn)行質(zhì)譜信號的采集,從而實現(xiàn)對目標(biāo)代謝分子更為特異、靈敏、準(zhǔn)確的分析。四川動物靶向代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)后出現(xiàn)的新興“組學(xué)”。

靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)(Targeted Metabolomics)是代謝組學(xué)研究的重要組成部分,也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對于全代謝組分析而言,靶向代謝組分析具有特異性強,檢測靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個特點。通過對血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析,一方面可以結(jié)合其它實驗數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機制,另一方面,也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開發(fā)利用提供有力支持。靶向代謝組學(xué)可以用于:驗證有非靶向代謝組學(xué)實驗提出的假說;進(jìn)行基于假說的探索性實驗,針對特定代謝物,研究代謝模型。

GC-MS非靶向與代謝組學(xué)的關(guān)系?代謝組學(xué)是運用多種技術(shù)手段,研究生物體系中小分子代謝物(包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質(zhì)等)的種類、數(shù)量及變化規(guī)律的科學(xué),是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學(xué)是對生物體內(nèi)源性代謝物進(jìn)行系統(tǒng)全方面的分析平臺。氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)技術(shù)因為其較為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現(xiàn)性好,擁有大量標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜圖數(shù)據(jù)庫的特點,被大量地運用在植物、動物、微生物的研究中。隨著信息科學(xué)和分析技術(shù)的發(fā)展,運用GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究疾病機制和發(fā)現(xiàn)藥物靶點的方法日趨成熟,其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學(xué)也在代謝性疾病等藥物靶點、疾病機制研究和藥物靶點發(fā)現(xiàn)中提供重要參考和啟示。代謝組學(xué)技術(shù)得到了迅速發(fā)展。

代謝產(chǎn)物是基因表達(dá)的產(chǎn)物,在代謝酶的作用下生成。雖然與基因或蛋白質(zhì)相比,代謝產(chǎn)物較小,但是不能形成代謝產(chǎn)物的細(xì)胞是死細(xì)胞,因此不能小看代謝產(chǎn)物的重要性。研究人員通過對機體代謝產(chǎn)物的深入研究,可以判斷機體是否處于正常狀態(tài),而對基因和蛋白質(zhì)的研究都無法得出這樣的結(jié)論。事實上,代謝組學(xué)研究已經(jīng)能診斷出一些代謝類疾病,如糖尿病、肥胖癥,代謝綜合癥。目前,已經(jīng)研究清楚的普通代謝途徑包括三羧酸循環(huán)(TCA),糖酵解,花生四烯酸 (AA)/炎癥途徑。代謝組學(xué)的代謝產(chǎn)物是基因表達(dá)的產(chǎn)物。江蘇靶向代謝組學(xué)鑒定

代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于病因病機研究。江蘇靶向代謝組學(xué)鑒定

靶向代謝組學(xué)的一般分析流程為:1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標(biāo)準(zhǔn)品。如果無法從市場上買到,就必須定制合成。然后通過優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號,再通過測定三重串聯(lián)四極桿測定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來用定量分析軟件對 MRM 數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,得到報告。3. 統(tǒng)計分析和解釋 將定量報告輸入統(tǒng)計分析軟件包,用統(tǒng)計工具,如ANOVA,對數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。靶向分析:在基于質(zhì)譜的代謝組學(xué)分析中,要意識到離子強度和色譜保留時間都會隨著時間的推移而產(chǎn)生漂移,所以在實驗中,要按隨機順序?qū)颖具M(jìn)行檢測,且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進(jìn)行采集,以減少誤差。江蘇靶向代謝組學(xué)鑒定