濟(jì)南棕櫚?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)有哪些

翻譯后修飾蛋白組分析：蛋白質(zhì)翻譯后修飾是影響蛋白質(zhì)功能并調(diào)節(jié)整個(gè)細(xì)胞過程的重要方式，幾乎在每個(gè)細(xì)胞過程中都是不可或缺的。分析和鑒定翻譯后修飾蛋白質(zhì)對(duì)揭示蛋白質(zhì)的功能和深入了解各種生理現(xiàn)象具有重要意義。大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計(jì)量和豐度存在，這限制了在分析全細(xì)胞裂解液時(shí)對(duì)其的檢測(cè)。蛋白質(zhì)是各種細(xì)胞功能比較重要的執(zhí)行者，其功能正常與否決定著生命活動(dòng)能否有序、高效的進(jìn)行，而其中翻譯后修飾起著至關(guān)重要的作用。翻譯后修飾改變了蛋白質(zhì)中不同氨基酸殘基上的生物化學(xué)官能團(tuán)，進(jìn)而改變其化學(xué)性質(zhì)或結(jié)構(gòu)，使得蛋白質(zhì)具有更為復(fù)雜的結(jié)構(gòu)和更為完善的功能，實(shí)現(xiàn)更為精細(xì)的調(diào)節(jié)。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾過程極其復(fù)雜，已知的翻譯后修飾種類有20多種。但其中較為常見的主要是磷酸化、泛素化、SUMO化、酰(含乙酰)化、甲基化以及糖基化。蛋白磷酸化修飾過程是通過蛋白激酶催化，將磷酸基團(tuán)從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸、或酪氨酸殘基上。濟(jì)南棕櫚?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)有哪些

蛋白質(zhì)翻譯后修飾自中而下分析策略：自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同，直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后，用GluC進(jìn)行消化。然后用弱陽(yáng)離子交換/親水相互作用色譜（WCX-HILIC）與配備電子轉(zhuǎn)移解離（ETD）的高分辨率質(zhì)譜聯(lián)機(jī)聯(lián)用，對(duì)樣品進(jìn)行理想的分離。譜識(shí)別可以用傳統(tǒng)的軟件進(jìn)行，但是由于估計(jì)適當(dāng)?shù)腻e(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率的問題，需要對(duì)結(jié)果進(jìn)行過濾。自上而下分析策略：自上而下的技術(shù)可以直接引入完整的蛋白質(zhì)并在串聯(lián)質(zhì)譜儀上對(duì)其進(jìn)行片段化，不需要蛋白質(zhì)水解消化。目前，有兩種完全分離蛋白質(zhì)的方法：離線和在線。前者用四維分離法，后者用WCX-HILIC。上海乙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有探索性。

琥珀?；揎椀鞍踪|(zhì)組鑒定：蛋白質(zhì)琥珀?；揎検切陆l(fā)現(xiàn)的一種蛋白質(zhì)翻譯后修飾，是在琥珀酰輔酶 A 的介導(dǎo)下將一個(gè)負(fù)電荷四碳琥珀?；D(zhuǎn)移到賴氨酸殘基的伯胺上的過程。賴氨酸琥珀?；谡婧思?xì)胞及原核細(xì)胞中普遍存在，參與調(diào)控包括三羧酸循環(huán)，氨基酸代謝以及脂肪酸代謝在內(nèi)的多個(gè)代謝信號(hào)通路。琥珀?；鞍踪|(zhì)組以組織、細(xì)胞等較為復(fù)雜樣本為研究對(duì)象，目的在于鑒定樣品中發(fā)生琥珀酰化修飾的蛋白質(zhì)以及相應(yīng)的琥珀?；揎椢稽c(diǎn)。琥珀?；揎椀鞍踪|(zhì)組技術(shù)特點(diǎn)：采用主流抗體親和富集方法，特異性高，富集效率好。

磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)：在有機(jī)體內(nèi)，磷酸化是蛋白翻譯后修飾中比較普遍的共價(jià)修飾形式，同時(shí)也是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式。磷酸化對(duì)蛋白質(zhì)功能的正常發(fā)揮起著重要的調(diào)節(jié)作用，該過程是由蛋白質(zhì)激酶（Kinase）催化的把ATP或GTP的γ位磷酸基轉(zhuǎn)移到底物蛋白質(zhì)的氨基酸殘基，如絲氨酸（Serine，Ser，S）、蘇氨酸（Threonine，Thr，T）和酪氨酸（Tyrosine，Tyr，Y）等上的過程，而其逆向過程則是由蛋白質(zhì)磷酸酶去除相應(yīng)的磷酸基團(tuán)。正是這兩種酶的相反作用及其中所涉及到的能量消耗與生成使磷酸化成為體內(nèi)很多生理活動(dòng)調(diào)控的首先選擇方式。蛋白質(zhì)糖基化是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)樣品要求：1、動(dòng)物組織的樣品量濕重不少于200mg。2、植物細(xì)菌、噬菌體等微生物類樣品量濕重不少于2g。3、富含雜質(zhì)或蛋白質(zhì)含量低的樣品量濕重不少于5g；如植物的根，木質(zhì)部、韌皮部組織等。4、體液類（唾液、羊水、腦脊液等）10mL以上，要保證不能溶血；血清要求500μl以上；尿液要求50mL以上。5、如直接提供蛋白質(zhì)提取物，濃度不少于2 mg/mL，總量不少于1 mg。為保證實(shí)驗(yàn)效果，請(qǐng)盡量告知緩沖液成分，如是否有硫脲、SDS、強(qiáng)離子鹽等等。另樣品中應(yīng)不含核酸、脂類、多糖等影響分離效果的成分。6、在細(xì)胞器蛋白質(zhì)組學(xué)方面，提取細(xì)胞器或亞細(xì)胞器后，蛋白沉淀量在1 mg以上。蛋白質(zhì)乙?；揎?，顧名思義指的就是在蛋白質(zhì)原有基礎(chǔ)上面嫁接上乙酰化基團(tuán)。河南蛋白質(zhì)丙二酰化修飾組學(xué)研究

在細(xì)胞中，乙?；揎椀姆磻?yīng)由乙?；D(zhuǎn)移酶所催化，將乙酰輔酶A的乙?；D(zhuǎn)移并添加在蛋白質(zhì)賴氨酸殘基上。濟(jì)南棕櫚酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有哪些

泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有些什么？泛素化可以生產(chǎn)出單泛素化或多泛素化蛋白質(zhì)。后者在當(dāng)7個(gè)賴氨酸殘基的泛素與另一個(gè)泛素的甘氨酸C端連接形成。這種泛素分子鏈接在生物過程中起到重要的作用。共價(jià)結(jié)合泛素的蛋白質(zhì)能被蛋白酶識(shí)別并降解，這是細(xì)胞內(nèi)短壽命蛋白質(zhì)和一些異常蛋白降解的普遍途徑。泛素化及類泛素化蛋白在細(xì)胞分裂，自噬，DNA修復(fù)，免疫應(yīng)答，細(xì)胞消亡等方面同樣起到關(guān)鍵作用。與消化道內(nèi)進(jìn)行的蛋白質(zhì)水解不同，從泛素與蛋白的結(jié)合到將蛋白水解成小的肽段，整個(gè)水解過程需要能量參與。人們開始意識(shí)到泛素-蛋白酶系統(tǒng)是一個(gè)對(duì)于真核細(xì)胞非常重要的調(diào)節(jié)系統(tǒng)。濟(jì)南棕櫚?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)有哪些