代謝組學(xué)是研究關(guān)于生物體被擾動后（如基因的改變或環(huán)境變化后）其代謝產(chǎn)物（內(nèi)源性代謝物質(zhì)）種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)的概念：轉(zhuǎn)錄組是指特定組織或細胞在某一發(fā)育階段或功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的匯合，包括蛋白質(zhì)編碼的信使RNA和非編碼RNA（rRNA、tRNA和其他ncRNAs），高通量測序技術(shù)也被稱為下一代測序（NGS）技術(shù)，推進了基因組學(xué)的研究進展。該項新技術(shù)...

單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)：10×genomics技術(shù)：首先在凝膠微珠上種上特定的DNA的片段，DNA的片段由三部分組成：Barcode、UMI、PolyT組成。Barcode是16個堿基的長度。一共有400萬種Barcode，一個微珠是對應(yīng)于一種Barcode，通過...

轉(zhuǎn)錄組及轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-seq）：轉(zhuǎn)錄組即特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA。轉(zhuǎn)錄組測序（RNA-seq）主要通過高通量測序研究特定組織或細胞在某個時期轉(zhuǎn)錄出來的mRNA的表達量，進而對相關(guān)基因和表型的關(guān)系進...

轉(zhuǎn)錄組是干什么用的，和表達譜有什么區(qū)別？轉(zhuǎn)錄組，指細胞某一時期所有基因的轉(zhuǎn)錄水平。轉(zhuǎn)錄組學(xué)，是一門在整體水平上研究細胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。簡而言之，轉(zhuǎn)錄組學(xué)是從RNA水平研究基因表達的情況。對RNA的分析。分析應(yīng)該是分幾個維度的DNA到RNA...

蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用是蛋白質(zhì)發(fā)揮功能的主要機制之一,在DNA損傷修復(fù),自噬和代謝等過程中都扮演著非常重要的角色,蛋白相互作用異常便會導(dǎo)致疾病的發(fā)生.在蛋白質(zhì)的賴氨酸,絲氨酸和蘇氨酸等氨基酸殘基上,可發(fā)生甲基化,乙?；?磷酸化和泛素化等200多種翻譯后修飾,這...

單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)：單細胞轉(zhuǎn)錄組目前主要有三種方法：SMART擴增技術(shù)、10×genomics技術(shù)及Andeplete技術(shù)。SMART擴增技術(shù)比較關(guān)鍵的技術(shù)，就是設(shè)計了2個特殊的引物。再配合用MMLV逆轉(zhuǎn)錄酶進行逆轉(zhuǎn)錄。特殊引物1由中間PolyT序列加上一段通...

宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)也稱為環(huán)境轉(zhuǎn)錄組學(xué)，指從整體水平上研究某一特定環(huán)境、特定時期菌群群體全部基因轉(zhuǎn)錄情況以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律，以揭示微生物在不同環(huán)境壓力下的適應(yīng)機制，探索環(huán)境與微生物之間的相互作用機理。其適用范圍包括人體微生態(tài)、環(huán)境、工業(yè)、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。宏轉(zhuǎn)錄組學(xué)以生態(tài)環(huán)境中...

RNA-seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)優(yōu)勢有：1、可以直接測定每個轉(zhuǎn)錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度;2、靈敏度高，可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本;3、可以對任意物種進行全基因組分析，能夠檢測未知基因，發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本，并準確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR...

蛋白質(zhì)組學(xué)主要以全蛋白組（組織、細胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象，通過對蛋白組進行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學(xué)功能、作用機制、疾病診斷的標志物以及預(yù)測蛋白的上、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學(xué)可以克服核酸水...

PRM靶向蛋白組學(xué)：PRM技術(shù)是一種根據(jù)已知實測信息或質(zhì)譜檢測規(guī)律的假定信息對樣品中的蛋白質(zhì)進行靶向定量的技術(shù)。該技術(shù)主要應(yīng)用儀器為QExactive系列質(zhì)譜儀，首先以四極桿作為質(zhì)量過濾器，特異性地選擇與預(yù)先設(shè)定質(zhì)荷比相同的肽段離子（母離子）通過，隨后在高能碰...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)：隨著越來越多的基因組序列相繼被測定,生命科學(xué)的研究進入了后基因組時代,各類組學(xué)技術(shù)得到迅速地發(fā)展與普遍地應(yīng)用包括以基因為研究對象的基因組學(xué)(Genomics)、以轉(zhuǎn)錄過程為研究對象的轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Transcriptomics)。意義：1．轉(zhuǎn)錄組譜可以提...

蛋白質(zhì)修飾位點分析：基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質(zhì)或多肽分子質(zhì)量這一特性，從而檢測蛋白質(zhì)或者多肽上位點發(fā)生何種修飾?？蓹z測修飾類型如下： 磷酸化、糖基化、乙?；?、泛素化、丙酰化、丁?；?、丙二?；⑽於；?、琥珀?；渭谆?、二甲基化、三甲基化。1...

蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法：免疫印跡技術(shù)：技術(shù)優(yōu)勢特點。1、 檢測特異性高。2、能夠特異鑒定單個磷酸化位點。同位素標記（Isotope Labeled）結(jié)合免疫印跡法：此方法的原理是當?shù)鞍装l(fā)生磷酸化時，放射性32P的摻入和分子質(zhì)量變化引起的凝膠遷移（gelshi...

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：生物質(zhì)譜：生物質(zhì)譜技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中比較重要的鑒定技術(shù)，其基本原理是樣品分子離子化后，根據(jù)不同離子之間的荷質(zhì)比（M/E）的差異來分離并確定分子量。對于經(jīng)過雙向電泳分離的目標蛋白質(zhì)用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵）成肽段，...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Transcriptomics)，是一門在真整體水平上研究細胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科，從RNA水平研究基因的表達情況。轉(zhuǎn)錄組測序是通過二代測序平臺快速全方面地獲得某一物種特定細胞或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有的轉(zhuǎn)錄本及基因序列，可以用來研...

代謝組學(xué)研究方法： 對于代謝產(chǎn)物來說，不只只有質(zhì)譜峰這個特征。更進一步說，質(zhì)譜（MS）并不能檢測出所有的代謝產(chǎn)物，并不是因為質(zhì)譜的靈敏度不夠，而是由于質(zhì)譜只能檢測離子化的物質(zhì)，但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振（NMR）的方法，可以彌補色譜的不...

蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)：乙?；揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對細胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。此外，還存在的非組蛋白乙?；揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙酰化鑒定的影響，再結(jié)合免疫共沉淀通過抗體富集乙...

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：生物質(zhì)譜：生物質(zhì)譜技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中比較重要的鑒定技術(shù)，其基本原理是樣品分子離子化后，根據(jù)不同離子之間的荷質(zhì)比（M/E）的差異來分離并確定分子量。對于經(jīng)過雙向電泳分離的目標蛋白質(zhì)用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵）成肽段，...

蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展趨勢：技術(shù)發(fā)展方面：蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存，各有優(yōu)勢和的特點，而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外，更強調(diào)各種方法間的整合和互補，以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外，蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)(transcriptomics)是功能基因組學(xué)(FunctionalGenomics)研究的重要組成部分，是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科。隨著人類基因組計劃HGP(HumanGenomeProject)的完成，科學(xué)家也逐...

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)技術(shù)優(yōu)點：1、全方面性：磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)以整個細胞蛋白為研究對象，研究內(nèi)容包括了細胞內(nèi)具有生命功能的蛋白，如細胞增生、細胞分裂和細胞分化等相關(guān)蛋白，因而研究更為全方面。2、可靠性：傳統(tǒng)的生物學(xué)研究蛋白質(zhì)磷酸化往往針對特定條件，以兩個蛋白或更...

蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法：免疫印跡技術(shù)：技術(shù)優(yōu)勢特點。1、 檢測特異性高。2、能夠特異鑒定單個磷酸化位點。同位素標記（Isotope Labeled）結(jié)合免疫印跡法：此方法的原理是當?shù)鞍装l(fā)生磷酸化時，放射性32P的摻入和分子質(zhì)量變化引起的凝膠遷移（gelshi...

轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序比其他研究方法有哪些優(yōu)勢?轉(zhuǎn)錄組學(xué)測序具有以下優(yōu)勢：（1）可以直接測定每個轉(zhuǎn)錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準確度，同時不存在傳統(tǒng)微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應(yīng)和背景噪音問題；（2）靈敏度高，可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本；（3）可以...

翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析：在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中，蛋白會首先被酶切成肽段，然后進入質(zhì)譜進行分析。通過質(zhì)譜分析，得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息。對于某一個特定肽段而言，在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下，其序列信息和分子量是確定的。當它發(fā)生了某種翻譯后修...

什么是蛋白質(zhì)的翻譯后修飾？蛋白質(zhì)的翻譯后修飾（post-translational-modification-analysis.html）是指蛋白質(zhì)在翻譯后的化學(xué)修飾。對于大部分的蛋白質(zhì)來說，這是蛋白質(zhì)生物合成的較后步驟。PTM是細胞信號傳導(dǎo)中的重要組成部分。...

蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展趨勢：技術(shù)發(fā)展方面：蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存，各有優(yōu)勢和的特點，而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外，更強調(diào)各種方法間的整合和互補，以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外，蛋白質(zhì)組學(xué)與其它學(xué)科的交叉也將日益明顯和重要...

蛋白磷酸化修飾過程：蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化，將磷酸基團從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸，或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過程是可逆的，去磷酸化反應(yīng)由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測方法：Western Blot檢測方法：Western...

蛋白質(zhì)組(Proteome)的概念指由一個基因組(genome)，或一個細胞、組織表達的所有蛋白質(zhì)(Protein).蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別，它隨著組織、甚至環(huán)境狀態(tài)的不同而改變.在轉(zhuǎn)錄時，一個基因可以多種mRNA形式剪接，并且，同一蛋白可能以...

非標定量法(Label-free)是通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強度，分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化，認為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關(guān)，因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度，通過適當?shù)臄?shù)學(xué)公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)...