貴陽(yáng)個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-02-17

代謝組學(xué)介紹:通過液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)方法檢測(cè)生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化,重點(diǎn)尋找在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中有明顯變化的代謝物,進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系,其研究對(duì)象大多是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。技術(shù)優(yōu)勢(shì):較高的靈敏度、分辨率;較寬的動(dòng)態(tài)范圍;適合對(duì)標(biāo)本中未知代謝物的探索研究;適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測(cè)和潛在標(biāo)志物的鑒定。代謝組學(xué)應(yīng)用方向: 土壤代謝組學(xué)。研究土壤中有機(jī)質(zhì)及土壤微生物代謝含量變化及相互作用,了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力,為探索調(diào)節(jié)、控制和改善土壤環(huán)境質(zhì)量提供重要的參考。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分,在臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有普遍的應(yīng)用前景。貴陽(yáng)個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

GC-MS非靶向代謝組學(xué)能檢測(cè)到哪些類別的代謝物?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測(cè)分析范圍。GC/MS能檢測(cè)到有機(jī)酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準(zhǔn)確度?GC/MS的定性有雙重標(biāo)準(zhǔn),一是保留指數(shù),二是質(zhì)譜信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的軟電離源,GC/MS使用的EI源屬于硬電離,能量較強(qiáng)且穩(wěn)定,在將代謝物分子電離后,分子離子峰進(jìn)一步碎裂產(chǎn)生豐富的碎片離子。因此,我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”,將儀器得到的實(shí)際指紋圖譜和質(zhì)譜庫(kù)(如NIST庫(kù))進(jìn)行比對(duì)后,我們將會(huì)得到一個(gè)叫相似度的指標(biāo)。保留指數(shù)和相似度都必須滿足設(shè)定的閾值,軟件才會(huì)給出色譜峰的定性結(jié)果。然后采用標(biāo)準(zhǔn)品質(zhì)譜信息進(jìn)行完全比對(duì)定性,也就是說(shuō)只有經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)品比對(duì),代謝物才是被100%定性。浙江LC-MS/MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)代謝組學(xué)主要研究的是各種代謝路徑的底物。

代謝組學(xué)的研究對(duì)象與層次有哪些?一般來(lái)說(shuō),代謝組學(xué)關(guān)注的對(duì)象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對(duì)象和目的不同,科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個(gè)層次:代謝物靶標(biāo)分析:某一個(gè)或幾個(gè)特定組分的定性和定量分析,如某一類結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物(氨基酸、有機(jī)酸、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標(biāo)志性組分。代謝物指紋分析:同時(shí)對(duì)多個(gè)代謝物進(jìn)行分析,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對(duì)生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析。代謝組分析:對(duì)生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理?xiàng)l件下的動(dòng)態(tài)變化規(guī)律。

代謝組學(xué)有哪些特點(diǎn)?(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學(xué)的末端,更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實(shí)情況,因此,在多數(shù)生物表型研究上更加適用。(2) 常規(guī)代謝組學(xué)只關(guān)注內(nèi)源性化合物,也有使用代謝組學(xué)技術(shù)測(cè)定外源性化合物的。內(nèi)源性化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病、毒性、基因修飾或環(huán)境因子的影響。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 內(nèi)源性化合物的結(jié)果可以作為疾病的診斷、藥物篩選或者其他分型評(píng)估等潛在生物標(biāo)志物。謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來(lái)反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于功能基因組學(xué)。

代謝組學(xué)需要多少的生物學(xué)重復(fù)?生物學(xué)重復(fù)指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量(如相同劑量給藥后2小時(shí)的小鼠采集并且相同儲(chǔ)存條件和處理方法血清樣本)。相較于基因和蛋白,代謝物處于生命活動(dòng)的下游,收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大,生物學(xué)重復(fù)少可能會(huì)放大組內(nèi)差異對(duì)于整體差異的影響,進(jìn)而影響結(jié)果(如準(zhǔn)確和足夠多的找出生物標(biāo)志物)。因此根據(jù)不同的生物類型,需要不同的生物學(xué)重復(fù)來(lái)增加數(shù)據(jù)的可靠性和說(shuō)服力。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。湖北植物靶向代謝組學(xué)檢測(cè)多少錢

代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是核磁共振。貴陽(yáng)個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅(jiān)信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對(duì)某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,并與 正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。貴陽(yáng)個(gè)性化定制靶向代謝組學(xué)研究方法

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