代謝組學(xué)樣本收集指南：1.血漿樣本收集：（1）從合適的靜脈采集血液（典型10mL）到標(biāo)記的肝素鋰血漿收集管中（肝素鋰用作抗凝劑）。（2）立即于4 °C離心（3000g）20min，上清液即為血漿。（3）離心完畢，取出血漿收集管，取上清液（血漿），分等份（0.5mL或0.1mL），轉(zhuǎn)移到凍存管中（冰上），旋蓋。（4）保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集：（1）從合適的靜脈采集血液（典型10mL）到血清收集管中。（2）將血清收集管冰水?。?℃）凝集至少1h（2h以內(nèi)），記錄凝集時(shí)間。（3）將血清收集管放到冷凍離心機(jī)中低溫（4℃）離心15min（2500 g）。（4）離心完畢，取出血...

代謝組學(xué)樣本收集注意事項(xiàng)：（1）血液離開動(dòng)物或人體后，應(yīng)盡快開展血清、血漿的分離，并嚴(yán)格按照操作說(shuō)明進(jìn)行。（2）采集到的血清為黃色透明液體、血漿為淡黃色半透明液體，如果發(fā)現(xiàn)樣本中是紅色，說(shuō)明在已經(jīng)發(fā)生了了溶血現(xiàn)象，樣本需重新制備。（3）血清與血漿的主要區(qū)別在于血清中不含纖維蛋白原。血清和血漿中脂質(zhì)，氨基酸，核苷酸等代謝譜存在差別。糞便樣本收集：1.人糞便：（1）用無(wú)菌勺挖取新鮮的，排泄中后部的內(nèi)側(cè)糞便（避免尿液及其他壁對(duì)樣本污染）；（2）分裝樣本20mg/管。（3）迅速放入液氮中冷凍處理至少15min.（4）-80℃冰箱凍存。寄樣需足量干冰。靶向代謝組學(xué)（Trgeted metabolomic...

GC-MS非靶向與代謝組學(xué)的關(guān)系？代謝組學(xué)是運(yùn)用多種技術(shù)手段，研究生物體系中小分子代謝物（包括氨基酸、糖和磷酸糖、生物胺和脂質(zhì)等）的種類、數(shù)量及變化規(guī)律的科學(xué)，是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分。其中GC-MS非靶向代謝組學(xué)是對(duì)生物體內(nèi)源性代謝物進(jìn)行系統(tǒng)全方面的分析平臺(tái)。氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)技術(shù)因?yàn)槠漭^為成熟、分辨率高、靈敏度高、重現(xiàn)性好，擁有大量標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)譜圖數(shù)據(jù)庫(kù)的特點(diǎn)，被大量地運(yùn)用在植物、動(dòng)物、微生物的研究中。隨著信息科學(xué)和分析技術(shù)的發(fā)展，運(yùn)用GC-MS非靶向代謝組學(xué)研究疾病機(jī)制和發(fā)現(xiàn)藥物靶點(diǎn)的方法日趨成熟，其重要性也日益凸顯。GC-MS非靶向代謝組學(xué)也在代謝性疾病等藥物靶點(diǎn)、疾病機(jī)制研...

靶向代謝組學(xué)：靶向代謝組學(xué)（Targeted Metabolomics）是代謝組學(xué)研究的重要組成部分，也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對(duì)于全代謝組分析而言，靶向代謝組分析具有特異性強(qiáng)，檢測(cè)靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個(gè)特點(diǎn)。通過(guò)對(duì)血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析，一方面可以結(jié)合其它實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機(jī)制，另一方面，也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開發(fā)利用提供有力支持。靶向代謝組學(xué)可以用于：驗(yàn)證有非靶向代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)提出的假說(shuō)；進(jìn)行基于假說(shuō)的探索性實(shí)驗(yàn)，針對(duì)特定代謝物，研究代謝模型。代謝組學(xué)是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分。武漢非靶向代謝組學(xué)技術(shù)服務(wù)代謝組...

靶向代謝組學(xué)的一般分析流程為：1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標(biāo)準(zhǔn)品。如果無(wú)法從市場(chǎng)上買到，就必須定制合成。然后通過(guò)優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號(hào)，再通過(guò)測(cè)定三重串聯(lián)四極桿測(cè)定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來(lái)用定量分析軟件對(duì) MRM 數(shù)據(jù)進(jìn)行處理，得到報(bào)告。3. 統(tǒng)計(jì)分析和解釋 將定量報(bào)告輸入統(tǒng)計(jì)分析軟件包，用統(tǒng)計(jì)工具，如ANOVA，對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。靶向分析：在基于質(zhì)譜的代謝組學(xué)分析中，要意識(shí)到離子強(qiáng)度和色譜保留時(shí)間都會(huì)隨著時(shí)間的推移而產(chǎn)生漂移，所以在實(shí)驗(yàn)中，要按隨機(jī)順序?qū)颖具M(jìn)行檢測(cè)，且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進(jìn)行采集，以減少誤差。非靶向代謝組學(xué)（Untargeted metabol...

靶向代謝組學(xué)：靶向代謝組學(xué)（Targeted Metabolomics）是代謝組學(xué)研究的重要組成部分，也是全代謝組研究的延伸與拓展。相對(duì)于全代謝組分析而言，靶向代謝組分析具有特異性強(qiáng)，檢測(cè)靈敏度高和定量準(zhǔn)確等幾個(gè)特點(diǎn)。通過(guò)對(duì)血液、尿液或其他體液以及組織中某一特定的代謝物的富集與準(zhǔn)確定量定性分析，一方面可以結(jié)合其它實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)揭示相關(guān)的分子生物學(xué)作用機(jī)制，另一方面，也可以為后續(xù)代謝分子標(biāo)志物的深入研究和開發(fā)利用提供有力支持。靶向代謝組學(xué)可以用于：驗(yàn)證有非靶向代謝組學(xué)實(shí)驗(yàn)提出的假說(shuō)；進(jìn)行基于假說(shuō)的探索性實(shí)驗(yàn)，針對(duì)特定代謝物，研究代謝模型。在食品安全領(lǐng)域，利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動(dòng)植物體內(nèi)的相關(guān)生...

代謝組學(xué)研究方法： 對(duì)于代謝產(chǎn)物來(lái)說(shuō)，不只只有質(zhì)譜峰這個(gè)特征。更進(jìn)一步說(shuō)，質(zhì)譜（MS）并不能檢測(cè)出所有的代謝產(chǎn)物，并不是因?yàn)橘|(zhì)譜的靈敏度不夠，而是由于質(zhì)譜只能檢測(cè)離子化的物質(zhì)，但有些代謝產(chǎn)物在質(zhì)譜儀中不能被離子化。采用核磁共振（NMR）的方法，可以彌補(bǔ)色譜的不足。過(guò)去，只有毒理學(xué)方面的研究使用核磁共振，而質(zhì)譜只在植物代謝研究中采用。如今，這兩種方法在代謝組學(xué)研究中已經(jīng)普遍使用。為在不同樣品間進(jìn)行有意義的比較，研究人員必須結(jié)合使用這兩種方法獲得的大量數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。此外，還需要結(jié)合基因組學(xué)研究獲得的數(shù)據(jù)。代謝組學(xué)主要研究的是產(chǎn)物的小分子代謝物（MW

如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)？實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)先不談，在儀器分析階段，若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)，有以下幾個(gè)方面需要注意。1）前處理方法的一致性。不同實(shí)驗(yàn)人員操作方式不盡相同。因此，一個(gè)項(xiàng)目應(yīng)當(dāng)只由一個(gè)人負(fù)責(zé)前處理。推薦使用自動(dòng)衍生設(shè)備，以減少人為的誤差。2）檢測(cè)之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能，可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài)，推薦使用一組混標(biāo)作為儀器質(zhì)控。在每一個(gè)項(xiàng)目開始之前，先進(jìn)行質(zhì)控樣檢測(cè)，確認(rèn)氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng)。3）后期數(shù)據(jù)矯正，特別是對(duì)于大樣本項(xiàng)目。我們可以在檢測(cè)序列中加入隨行質(zhì)控樣本（每個(gè)樣品取少量后混合），在后期數(shù)...

代謝組學(xué)樣本收集植物組織：葉片、莖、花：1）取整片葉片/一段莖/一朵花，放入離心管或錫箔紙中并標(biāo)記，迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中（每組一袋），在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。3）迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意：（1）采集葉片樣本時(shí)，在中午光照好的時(shí)間收集。（2）采集樣本時(shí)保持樣本一致性，尤其是同一組樣本（顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等）。根：1）取整株植物的根部，迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營(yíng)養(yǎng)液等；2）吸水紙吸干水分后，分裝為500 mg/管；3）標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min...

代謝組學(xué)的研究對(duì)象與層次有哪些？一般來(lái)說(shuō)，代謝組學(xué)關(guān)注的對(duì)象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對(duì)象和目的不同，科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個(gè)層次：代謝物靶標(biāo)分析：某一個(gè)或幾個(gè)特定組分的定性和定量分析，如某一類結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物（氨基酸、有機(jī)酸、順二醇類）或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標(biāo)志性組分。代謝物指紋分析：同時(shí)對(duì)多個(gè)代謝物進(jìn)行分析，不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析：限定條件下對(duì)生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析。代謝組分析：對(duì)生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析，并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理?xiàng)l件下的動(dòng)態(tài)變...

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些？1、疾病機(jī)制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機(jī)制的研究。5、藥物毒性評(píng)價(jià)。6、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究。7、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組能夠檢測(cè)到的代謝物含量是多少？不同檢測(cè)平臺(tái)的靈敏度不一樣，靈敏度比較高，可達(dá)到fM級(jí)。另外，相同含量的不同物質(zhì)，由于自身化學(xué)性質(zhì)不同，質(zhì)譜的離子化效率、信號(hào)響應(yīng)強(qiáng)度會(huì)差異很大。物質(zhì)的檢測(cè)靈敏度跟自身的化學(xué)性質(zhì)有關(guān)，化學(xué)性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面。因此，相同含量的不同物質(zhì)，可能一個(gè)能檢測(cè)出來(lái)，另一個(gè)檢測(cè)不出來(lái)。代謝組學(xué)的代謝物的種類要遠(yuǎn)小于基因和蛋白的數(shù)目。山東農(nóng)學(xué)靶向代謝組學(xué)費(fèi)用代謝組學(xué)尿...

代謝組學(xué)介紹：通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用（LC-MS）方法檢測(cè)生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化，重點(diǎn)尋找在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中有明顯變化的代謝物，進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系，其研究對(duì)象大多是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質(zhì)。技術(shù)優(yōu)勢(shì)：較高的靈敏度、分辨率；較寬的動(dòng)態(tài)范圍；適合對(duì)標(biāo)本中未知代謝物的探索研究；適合于生物樣本中復(fù)雜代謝產(chǎn)物的檢測(cè)和潛在標(biāo)志物的鑒定。代謝組學(xué)應(yīng)用方向： 土壤代謝組學(xué)。研究土壤中有機(jī)質(zhì)及土壤微生物代謝含量變化及相互作用，了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力，為探索調(diào)節(jié)、控制和改善土壤環(huán)境質(zhì)量提供重要的參考。代謝組學(xué)技術(shù)可應(yīng)用于病因病機(jī)研究。四川非靶向代謝...

LC-MS非靶向代謝組學(xué)：LCMS非靶向是通過(guò)液質(zhì)聯(lián)用（LC–MS）方法檢測(cè)生物體受擾動(dòng)或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動(dòng)態(tài)變化，從中找出表達(dá)差異的代謝物，進(jìn)而闡明生物體代謝相關(guān)過(guò)程的代謝組學(xué)技術(shù)。LCMS非靶向代謝組學(xué)適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物，具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點(diǎn)。超高壓液相色譜或超高效液相色譜（UPLC）通過(guò)采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力，實(shí)現(xiàn)了更好的分離，具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度；串聯(lián)質(zhì)譜儀在MS掃描模式下，可實(shí)現(xiàn)高低碰撞能量快速切換，同時(shí)采集代謝物的一二級(jí)質(zhì)譜信息，結(jié)合代謝組學(xué)數(shù)據(jù)處理軟件對(duì)質(zhì)譜信息的解析，在單次分析中可檢測(cè)和鑒...

代謝組學(xué)可以檢測(cè)的樣品種類有哪些？代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（分子量

代謝組學(xué)樣本收集植物組織：果實(shí)、種子：1）對(duì)于含水量高、體積較大的果實(shí)（番茄、西瓜、蘋果等）需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中，標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）對(duì)于細(xì)小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等)，可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中，標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3）對(duì)于要求對(duì)整個(gè)果實(shí)進(jìn)行提取的（整粒葡萄等），需要把果實(shí)裝在50 mL離心管/自封袋中，標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min，-80 ℃凍存，干冰寄送。代謝組學(xué)的發(fā)展很迅速。廣州脂質(zhì)代謝組學(xué)多費(fèi)用什么是代...

代謝組學(xué)概念：代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（MW

代謝組學(xué)如何控制臨床樣本的質(zhì)量？對(duì)于臨床的樣本建議每組比較低的25個(gè)生物學(xué)重復(fù)，達(dá)到30例以上比較好。因?yàn)榕R床樣本受外界環(huán)境和遺傳背景影響較大，需要很多生物學(xué)重復(fù)來(lái)消除這些外在影響。此外，在樣本收集過(guò)程中，應(yīng)保持收養(yǎng)的時(shí)間段和操作程序盡可能一致。代謝組學(xué)樣本收集取樣基本原則：表示性和一致性：驗(yàn)組與對(duì)照組樣本在取材部位、時(shí)間處理等方面盡可能保持一致，從而保證實(shí)驗(yàn)的可信度；迅速性：操作過(guò)程迅速，很大限度縮短樣本采集到實(shí)驗(yàn)的時(shí)間；低溫原則：所有樣本離體后，分離步驟應(yīng)在4℃或冰上進(jìn)行，分離好的樣本立即存于-80℃，以免樣本產(chǎn)生進(jìn)一步代謝活動(dòng)。在食品安全領(lǐng)域，利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動(dòng)植物體內(nèi)的相...

代謝組學(xué)概念：基因與蛋白質(zhì)的表達(dá)緊密相連，而代謝物則更多地反映了細(xì)胞所處的環(huán)境，這又與細(xì)胞的營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)，藥物和環(huán)境污染物的作用，以及其它外界因素的影響密切相關(guān)。因此有人認(rèn)為，“基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)告訴你什么可能會(huì)發(fā)生，而代謝組學(xué)則告訴你什么確實(shí)發(fā)生了?！贝x組學(xué)的概念來(lái)源于代謝組，代謝組是指某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物，代謝組學(xué)則是對(duì)某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時(shí)進(jìn)行定性和定量分析的一門新學(xué)科。它是以組群指標(biāo)分析為基礎(chǔ)，以高通量檢測(cè)和數(shù)據(jù)處理為手段，以信息建模與系統(tǒng)整合為目標(biāo)的系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)分支。代謝組學(xué)的研究介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間...

代謝組學(xué)需要多少的生物學(xué)重復(fù)？生物學(xué)重復(fù)指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量（如相同劑量給藥后2小時(shí)的小鼠采集并且相同儲(chǔ)存條件和處理方法血清樣本）。相較于基因和蛋白，代謝物處于生命活動(dòng)的下游，收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大，生物學(xué)重復(fù)少可能會(huì)放大組內(nèi)差異對(duì)于整體差異的影響，進(jìn)而影響結(jié)果（如準(zhǔn)確和足夠多的找出生物標(biāo)志物）。因此根據(jù)不同的生物類型，需要不同的生物學(xué)重復(fù)來(lái)增加數(shù)據(jù)的可靠性和說(shuō)服力。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。在食品安全領(lǐng)域，利用代謝組學(xué)工具發(fā)現(xiàn)農(nóng)獸藥等在動(dòng)植物體內(nèi)的相關(guān)生物標(biāo)志物也是一個(gè)熱點(diǎn)領(lǐng)域。廣東LC-MS／MS非靶向脂質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析代謝組學(xué)樣本收集注意事項(xiàng)：...

代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些？1、疾病機(jī)制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發(fā)。4、藥物作用機(jī)制的研究。5、藥物毒性評(píng)價(jià)。6、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究。7、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組能夠檢測(cè)到的代謝物含量是多少？不同檢測(cè)平臺(tái)的靈敏度不一樣，靈敏度比較高，可達(dá)到fM級(jí)。另外，相同含量的不同物質(zhì)，由于自身化學(xué)性質(zhì)不同，質(zhì)譜的離子化效率、信號(hào)響應(yīng)強(qiáng)度會(huì)差異很大。物質(zhì)的檢測(cè)靈敏度跟自身的化學(xué)性質(zhì)有關(guān)，化學(xué)性質(zhì)的影響主要表現(xiàn)在離子化效率和質(zhì)譜碎裂行為兩方面。因此，相同含量的不同物質(zhì)，可能一個(gè)能檢測(cè)出來(lái)，另一個(gè)檢測(cè)不出來(lái)。代謝組學(xué)在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。四川植物靶向代謝組學(xué)定量分析代謝組學(xué)...

代謝組學(xué)研究方法：代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產(chǎn)物以確定其中所有的代謝產(chǎn)物。從本質(zhì)上來(lái)說(shuō)，代謝指紋分析涉及比較不同個(gè)體中代謝產(chǎn)物的質(zhì)譜峰，然后了解不同化合物的結(jié)構(gòu)，建立一套完備的識(shí)別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析（metabolomic profiling）,研究人員假定了一條特定的代謝途徑，并對(duì)此進(jìn)行更深入的研究。代謝組學(xué)作為系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)重要的分支，與其他組學(xué)相比有著其特有的優(yōu)勢(shì)。常...

代謝組學(xué)樣品收集方法及所需樣本量是什么？(1) 血清樣品： 避免反復(fù)凍融。血液收集在離心管中靜置30分鐘進(jìn)行凝血。8000rpm離心10分鐘，取上清分裝到凍存管中，放置液氮中或-80度凍存；單個(gè)樣本要求體積為50μL。(2) 尿液樣品：臨床樣本請(qǐng)全部取清晨第1次尿液。尿液直接分裝到離心管中，8000rpm離心10分鐘，取上清分裝到凍存管中，放置液氮中或-80度凍存，-80度凍存；單個(gè)樣本要求體積為100μL。(3) 其他樣本收集辦法請(qǐng)咨詢譜領(lǐng)工作人員。代謝組學(xué)效仿了基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想。南京動(dòng)物靶向代謝組學(xué)定量分析靶向代謝組學(xué)：靶向代謝組學(xué)（Targeted Metabolomics...

靶向代謝組學(xué)的一般分析流程為：1. 數(shù)據(jù)采集 第1步是得到標(biāo)準(zhǔn)品。如果無(wú)法從市場(chǎng)上買到，就必須定制合成。然后通過(guò)優(yōu)化產(chǎn)物離子碰撞能量以得到的信號(hào)，再通過(guò)測(cè)定三重串聯(lián)四極桿測(cè)定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來(lái)用定量分析軟件對(duì) MRM 數(shù)據(jù)進(jìn)行處理，得到報(bào)告。3. 統(tǒng)計(jì)分析和解釋 將定量報(bào)告輸入統(tǒng)計(jì)分析軟件包，用統(tǒng)計(jì)工具，如ANOVA，對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。靶向分析：在基于質(zhì)譜的代謝組學(xué)分析中，要意識(shí)到離子強(qiáng)度和色譜保留時(shí)間都會(huì)隨著時(shí)間的推移而產(chǎn)生漂移，所以在實(shí)驗(yàn)中，要按隨機(jī)順序?qū)颖具M(jìn)行檢測(cè)，且數(shù)據(jù)需要在同天同一批次進(jìn)行采集，以減少誤差。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。廣州非靶向...

選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢(shì)有哪些？代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游，介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間，在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達(dá)的下游產(chǎn)物，生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接，更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。代謝物的種類少，大約在103個(gè)數(shù)量級(jí)，要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù)，物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡(jiǎn)單得多，分析起來(lái)更簡(jiǎn)單明了。代謝組學(xué)的代謝物信息庫(kù)簡(jiǎn)單，它遠(yuǎn)沒(méi)有全基因組測(cè)序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫(kù)那么復(fù)雜?；蚝偷鞍踪|(zhì)表達(dá)的有效微小變化會(huì)在代謝物上得到放大，從而使檢測(cè)更容易。代謝產(chǎn)物在各個(gè)生物體系中都是類似的，所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個(gè)...

代謝組學(xué)概念：代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物（MW

代謝組學(xué)的研究分為靶向和非靶向。通俗說(shuō)就是你有沒(méi)有目標(biāo)分子。傳統(tǒng)代謝組學(xué)研究利用的是GC-MS，因?yàn)榇x物大多數(shù)都不是高沸點(diǎn)的，而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫(kù)檢索。然后發(fā)展的LC-MS差不多，就是克服了一些高沸點(diǎn)物質(zhì)難以檢測(cè)的弊端。NMR用于代謝組學(xué)不是很多，一方面是NMR這個(gè)東西入行起點(diǎn)有點(diǎn)高，另一方面是樣品太復(fù)雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡(jiǎn)單，無(wú)損。不需要各種衍生化。而且NMR對(duì)于物質(zhì)結(jié)構(gòu)的指認(rèn)要比MS更精確（比如異構(gòu)體）因此對(duì)定性非常有用，成為非靶向代謝組學(xué)的重要方法。代謝組學(xué)研究對(duì)象大都是相對(duì)分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。哈爾濱代謝組學(xué)質(zhì)譜鑒定代謝組學(xué)尿液樣本收集：1）取空腹...

代謝組學(xué)樣本收集植物組織：葉片、莖、花：1）取整片葉片/一段莖/一朵花，放入離心管或錫箔紙中并標(biāo)記，迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2）將裝有樣本的離心管迅速放入自封袋中（每組一袋），在自封袋中放入標(biāo)簽紙注明樣本信息。3）迅速放入-80 ℃冰箱凍存。足量干冰寄送。注意：（1）采集葉片樣本時(shí)，在中午光照好的時(shí)間收集。（2）采集樣本時(shí)保持樣本一致性，尤其是同一組樣本（顏色、衰老程度、葉脈占比、光照、位置等）。根：1）取整株植物的根部，迅速用PBS緩沖液或者超純水漂洗掉根上的泥土、培養(yǎng)基或營(yíng)養(yǎng)液等；2）吸水紙吸干水分后，分裝為500 mg/管；3）標(biāo)號(hào)后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min...

代謝組學(xué)需要多少的生物學(xué)重復(fù)？生物學(xué)重復(fù)指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量（如相同劑量給藥后2小時(shí)的小鼠采集并且相同儲(chǔ)存條件和處理方法血清樣本）。相較于基因和蛋白，代謝物處于生命活動(dòng)的下游，收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大，生物學(xué)重復(fù)少可能會(huì)放大組內(nèi)差異對(duì)于整體差異的影響，進(jìn)而影響結(jié)果（如準(zhǔn)確和足夠多的找出生物標(biāo)志物）。因此根據(jù)不同的生物類型，需要不同的生物學(xué)重復(fù)來(lái)增加數(shù)據(jù)的可靠性和說(shuō)服力。代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比，代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。河南靶向代謝組學(xué)研究?jī)?nèi)容代謝組學(xué)：代謝組學(xué) （metabolomics）的出現(xiàn)是生命科學(xué)研究的必然...

代謝組學(xué)概念：基因與蛋白質(zhì)的表達(dá)緊密相連，而代謝物則更多地反映了細(xì)胞所處的環(huán)境，這又與細(xì)胞的營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)，藥物和環(huán)境污染物的作用，以及其它外界因素的影響密切相關(guān)。因此有人認(rèn)為，“基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)告訴你什么可能會(huì)發(fā)生，而代謝組學(xué)則告訴你什么確實(shí)發(fā)生了?！贝x組學(xué)的概念來(lái)源于代謝組，代謝組是指某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物，代謝組學(xué)則是對(duì)某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物同時(shí)進(jìn)行定性和定量分析的一門新學(xué)科。它是以組群指標(biāo)分析為基礎(chǔ)，以高通量檢測(cè)和數(shù)據(jù)處理為手段，以信息建模與系統(tǒng)整合為目標(biāo)的系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)分支。什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)？廣州代謝組...

如何獲得高質(zhì)量GC/MS代謝組學(xué)數(shù)據(jù)？實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)先不談，在儀器分析階段，若想獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)，有以下幾個(gè)方面需要注意。1）前處理方法的一致性。不同實(shí)驗(yàn)人員操作方式不盡相同。因此，一個(gè)項(xiàng)目應(yīng)當(dāng)只由一個(gè)人負(fù)責(zé)前處理。推薦使用自動(dòng)衍生設(shè)備，以減少人為的誤差。2）檢測(cè)之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能，可以快速便捷地核查質(zhì)譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài)，推薦使用一組混標(biāo)作為儀器質(zhì)控。在每一個(gè)項(xiàng)目開始之前，先進(jìn)行質(zhì)控樣檢測(cè)，確認(rèn)氣相色譜的分離度和質(zhì)譜的整體響應(yīng)。3）后期數(shù)據(jù)矯正，特別是對(duì)于大樣本項(xiàng)目。我們可以在檢測(cè)序列中加入隨行質(zhì)控樣本（每個(gè)樣品取少量后混合），在后期數(shù)...