貴州靶向代謝組學應用

LC-MS非靶向代謝組學：LCMS非靶向是通過液質聯(lián)用（LC–MS）方法檢測生物體受擾動或刺激前后大量代謝產(chǎn)物的動態(tài)變化，從中找出表達差異的代謝物，進而闡明生物體代謝相關過程的代謝組學技術。LCMS非靶向代謝組學適用于分析難揮發(fā)或熱穩(wěn)定性差的代謝產(chǎn)物，具有高通量、高分辨率、高靈敏度的特點。超高壓液相色譜或超高效液相色譜（UPLC）通過采用更小粒徑的色譜填料配合更高的壓力，實現(xiàn)了更好的分離，具體包括更高的分離能力、更快的分離速度以及更好的靈敏度；串聯(lián)質譜儀在MS掃描模式下，可實現(xiàn)高低碰撞能量快速切換，同時采集代謝物的一二級質譜信息，結合代謝組學數(shù)據(jù)處理軟件對質譜信息的解析，在單次分析中可檢測和鑒定幾百至幾千種代謝物。與基因組學和蛋白質組學相比，代謝組學與生理學的聯(lián)系更加緊密。貴州靶向代謝組學應用

代謝組學介紹：通過液質聯(lián)用（LC-MS）方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化，重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物，進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關關系，其研究對象大多是分子量1500Da以內(nèi)的小分子物質。技術優(yōu)勢：較高的靈敏度、分辨率；較寬的動態(tài)范圍；適合對標本中未知代謝物的探索研究；適合于生物樣本中復雜代謝產(chǎn)物的檢測和潛在標志物的鑒定。代謝組學應用方向： 土壤代謝組學。研究土壤中有機質及土壤微生物代謝含量變化及相互作用，了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力，為探索調(diào)節(jié)、控制和改善土壤環(huán)境質量提供重要的參考。湖北非靶向代謝組學研究方法什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學？

代謝組學需要多少的生物學重復？生物學重復指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數(shù)量（如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本）。相較于基因和蛋白，代謝物處于生命活動的下游，收到環(huán)境和遺傳背景等因素影響較大，生物學重復少可能會放大組內(nèi)差異對于整體差異的影響，進而影響結果（如準確和足夠多的找出生物標志物）。因此根據(jù)不同的生物類型，需要不同的生物學重復來增加數(shù)據(jù)的可靠性和說服力。代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似。

代謝組學的研究對象與層次有哪些？一般來說，代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對象和目的不同，科學家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個層次：代謝物靶標分析：某一個或幾個特定組分的定性和定量分析，如某一類結構、性質相關的化合物（氨基酸、有機酸、順二醇類）或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標志性組分。代謝物指紋分析：同時對多個代謝物進行分析，不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析：限定條件下對生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析。代謝組分析：對生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析，并研究該代謝物組在外界干預或病理生理條件下的動態(tài)變化規(guī)律。代謝組學可以檢測的樣品種類有哪些？

代謝組學細胞樣本收集：懸浮細胞：1）連同培養(yǎng)基轉移到1.5 mL的進口離心管中。2）低速離心5 min（低于3000 rpm），使細胞沉淀于離心管的底部（1*107個細胞為宜）。3）倒掉培養(yǎng)基（盡量倒干凈），用預冷的PBS反復沖洗2 ~ 3次，低速離心5 min，棄上清。4）標記離心管，將離心管的尖的一端插入液氮中，淬滅細胞沉淀1 min，-80 ℃凍存，干冰寄送。注意事項：1. 培養(yǎng)基傾倒時盡量倒干凈，可使用濾紙將殘留培養(yǎng)液吸凈；2. 甲醇/水請使用色譜純及以上規(guī)格；3. 液氮淬滅細胞時，請小心避免離心管破碎導致樣本受損;4. 建議細胞樣本在進行培養(yǎng)時多準備樣本，以備后續(xù)使用。較低的費用，是促使代謝組學在臨床上易于接受的另一個原因。湖北非靶向代謝組學研究方法

代謝組學可與生物表型變化建立直接相關性。貴州靶向代謝組學應用

代謝組學的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標分子。傳統(tǒng)代謝組學研究利用的是GC-MS，因為代謝物大多數(shù)都不是高沸點的，而且GC-MS有龐大的數(shù)據(jù)庫檢索。然后發(fā)展的LC-MS差不多，就是克服了一些高沸點物質難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學不是很多，一方面是NMR這個東西入行起點有點高，另一方面是樣品太復雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單，無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質結構的指認要比MS更精確（比如異構體）因此對定性非常有用，成為非靶向代謝組學的重要方法。貴州靶向代謝組學應用

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