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蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù):糖基化是在酶的控制下,蛋白質(zhì)或脂質(zhì)附加上糖類的過程,發(fā)生于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和高爾基體等部位。在糖基轉(zhuǎn)移酶作用下將糖轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì),和蛋白質(zhì)上的氨基酸殘基共價(jià)結(jié)合。蛋白質(zhì)經(jīng)過糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是對(duì)蛋白的重要的修飾作用,有調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)功能作用。凝素親和法是目前糖蛋白質(zhì)組學(xué)中應(yīng)用比較普遍的分離富集方法。凝集素(lectin)是一類糖結(jié)合蛋白質(zhì),能專一識(shí)別某一特殊結(jié)構(gòu)的單糖或聚糖中特定的糖基序列而與之結(jié)合,它們與糖鏈可逆非共價(jià)結(jié)合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕獲之后,通常用特定的單糖通過競爭結(jié)合凝集素將糖蛋白或糖肽洗脫下來。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化。上海泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)類型
根據(jù)不同的作用位點(diǎn),蛋白質(zhì)乙酰化修飾分為:發(fā)生在蛋白N端的乙?;揎?、發(fā)生在蛋白賴氨酸上的乙酰化修飾。前者發(fā)生在90%以上的真核生物新生蛋白上,對(duì)于新生蛋白的成熟和細(xì)胞定位非常重要,由N乙酰轉(zhuǎn)移酶(NATs)負(fù)責(zé);而后者是一個(gè)可逆的過程,主要由賴氨酸乙?;福↘ATs)和賴氨酸去乙?;福↘DACs),賴氨酸的乙?;揎検俏覀兡壳把芯康闹攸c(diǎn)。蛋白質(zhì)磷酸化修飾應(yīng)用領(lǐng)域:應(yīng)用在食品工業(yè)方面,通過人工翻譯磷酸化修飾的蛋白可以普遍用于各種食用蛋白質(zhì)的改性,以改善蛋白質(zhì)品質(zhì)。如,花生蛋白、大豆蛋白、小麥面筋蛋白等。在人工磷酸化修飾的方法下,也可以研究各種蛋白質(zhì)的功能和相關(guān)代謝途徑的調(diào)控。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,蛋白質(zhì)的磷酸化紊亂,會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞周期調(diào)控異常,因此,病理的形成與蛋白質(zhì)的磷酸化異常也有很大相關(guān)性。其分子機(jī)制問題對(duì)于病癥等重大疾病的研究具有相當(dāng)?shù)闹笇?dǎo)意義,這也是指當(dāng)之無愧地成為生物學(xué)研究領(lǐng)域中的熱點(diǎn)。江蘇蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式。
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有些什么?泛素化可以生產(chǎn)出單泛素化或多泛素化蛋白質(zhì)。后者在當(dāng)7個(gè)賴氨酸殘基的泛素與另一個(gè)泛素的甘氨酸C端連接形成。這種泛素分子鏈接在生物過程中起到重要的作用。共價(jià)結(jié)合泛素的蛋白質(zhì)能被蛋白酶識(shí)別并降解,這是細(xì)胞內(nèi)短壽命蛋白質(zhì)和一些異常蛋白降解的普遍途徑。泛素化及類泛素化蛋白在細(xì)胞分裂,自噬,DNA修復(fù),免疫應(yīng)答,細(xì)胞消亡等方面同樣起到關(guān)鍵作用。與消化道內(nèi)進(jìn)行的蛋白質(zhì)水解不同,從泛素與蛋白的結(jié)合到將蛋白水解成小的肽段,整個(gè)水解過程需要能量參與。人們開始意識(shí)到泛素-蛋白酶系統(tǒng)是一個(gè)對(duì)于真核細(xì)胞非常重要的調(diào)節(jié)系統(tǒng)。
乙酰化修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用方向有什么?1、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標(biāo)志物,疾病機(jī)理機(jī)制,疾病分型,個(gè)性化治理等;2、生物醫(yī)藥:藥物作用機(jī)理,藥效評(píng)價(jià),藥物開發(fā)等;3、微生物領(lǐng)域:致病機(jī)理,耐藥機(jī)制,病原體-宿主相互作用研究等;4、海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;5、生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危定風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估研究等;6、食品營養(yǎng):食品儲(chǔ)藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測等。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾是一個(gè)復(fù)雜的過程。
蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué):是植物體內(nèi)比較常見的PTM修飾手段。它是指通過蛋白激酶和磷酸酶的作用在特定絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的羥基上添加或去除一個(gè)或多個(gè)磷酸基團(tuán),進(jìn)而有效地改變底物蛋白的結(jié)構(gòu)和活性。在植物體內(nèi)主要參與植物溫度脅迫、鹽脅迫、干旱脅迫、養(yǎng)分脅迫調(diào)控等大多數(shù)代謝和生理途徑。蛋白質(zhì)磷酸化對(duì)于許多生物現(xiàn)象的引發(fā)是很必要的,包括細(xì)胞生長、增殖、泛素(ubiquitin)介導(dǎo)的蛋白降解等過程。特別是酪氨酸磷酸化,作為細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和酶活性調(diào)控的一種主要方式,通常通過引發(fā)蛋白質(zhì)之間的相互作用,進(jìn)而介導(dǎo)生長因子和細(xì)胞因子等對(duì)細(xì)胞膜上受體的信號(hào)調(diào)控。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)對(duì)于蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)及研究對(duì)闡明蛋白質(zhì)的功能具有重要作用。濟(jì)南蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)類型
在早期的研究中,乙酰化修飾一直被認(rèn)為是真核細(xì)胞所特有的一種翻譯后修飾。上海泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)類型
琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組技術(shù)特點(diǎn):采用主流抗體親和富集方法,特異性高,富集效率好;通過高分辨率、高掃描速度的質(zhì)譜,對(duì)富集的琥珀?;亩芜M(jìn)行大規(guī)模鑒定;結(jié)合常用的定量技術(shù)可對(duì)不同樣品間的琥珀酰化水平差異進(jìn)行定量比較。適用范圍:藥物作用靶點(diǎn)研究;疾病標(biāo)志物篩選;植物脅迫/抗逆研究;作用機(jī)制研究;要求物種具有蛋白質(zhì)參考數(shù)據(jù)庫、EST序列(轉(zhuǎn)錄組)或基因組注釋信息。應(yīng)用方向:線粒體代謝、生物合成與代謝、中心代謝途徑、炎癥與疾病。上海泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)類型