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iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組介紹:iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組研究是對(duì)一個(gè)基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個(gè)復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行標(biāo)記,利用標(biāo)記試劑中的二級(jí)報(bào)告離子來(lái)對(duì)蛋白進(jìn)行精確鑒定和定量。技術(shù)優(yōu)勢(shì):1、適用范圍廣:可檢測(cè)到的蛋白除了胞漿蛋白外,還有線(xiàn)粒體蛋白、膜蛋白。也能對(duì)任何類(lèi)型的蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定,包括高分子量,酸性,堿性蛋白質(zhì);2、高通量:一次可以實(shí)現(xiàn)多個(gè)樣品的定性定量分析,特別適用于采用多種處理方式或來(lái)自多個(gè)處理時(shí)間的樣本的差異蛋白分析。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)并帶領(lǐng)生物技術(shù)取得關(guān)鍵性的突破。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究
蛋白質(zhì)組學(xué)的目標(biāo)是要回答關(guān)于蛋白質(zhì)的4個(gè)方面的問(wèn)題:①細(xì)胞中蛋白質(zhì)的含量。②定位。③活性。④修飾。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法主要有:①蛋白質(zhì)雙向電泳。②氨基酸序列測(cè)定(包括N端測(cè)序和C端測(cè)序)。③質(zhì)譜。④生物信息學(xué)。發(fā)育蛋白質(zhì)組學(xué)指在某一特定的生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期,在特定的生長(zhǎng)條件下,特定的細(xì)胞、組織中所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)。發(fā)育蛋白質(zhì)組學(xué)揭示了在每個(gè)特定時(shí)期所表達(dá)的蛋白質(zhì)和這些不同的蛋白質(zhì)在特殊的生長(zhǎng)時(shí)期可能發(fā)揮的作用,是進(jìn)一步了解和深入研究蛋白質(zhì)功能的基礎(chǔ)。武漢高通量蛋白質(zhì)組學(xué)主要技術(shù)近兩年來(lái)蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域。
蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用?基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段,當(dāng)前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。隨著質(zhì)譜、系統(tǒng)生物學(xué)、生物信息學(xué)等相關(guān)學(xué)科的發(fā)展,我認(rèn)為今后我們會(huì)更多地在現(xiàn)實(shí)生活中見(jiàn)到蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)的應(yīng)用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變(鐮刀形紅細(xì)胞癥)、糖化血紅蛋白比例測(cè)定等。從測(cè)試體量估計(jì),應(yīng)該遠(yuǎn)小于1%的ELISA測(cè)試量。由于成本和通量等原因,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)并不如ELISA適合大量的日常分析。但對(duì)于一些分析有問(wèn)題的項(xiàng)目,采用基于質(zhì)譜(或二維膠等手段)的蛋白質(zhì)組學(xué)有獨(dú)特的技術(shù)優(yōu)勢(shì)。另外,蛋白質(zhì)組學(xué)方法開(kāi)發(fā)和驗(yàn)證周期短,在中高級(jí)特殊應(yīng)用(如極少使用的特殊蛋白指標(biāo)臨床檢測(cè)、未知疾病研究和控制)中也有其獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù):等電聚焦:等電聚焦(isoelectricfocusing,IEF)是一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點(diǎn)不同的蛋白質(zhì)的電泳技術(shù)。等電聚焦凝膠電泳依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點(diǎn)進(jìn)行分離,等電聚焦中,蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個(gè)連續(xù)而穩(wěn)定的線(xiàn)性pH梯度中電泳。載體兩性電解質(zhì)是脂肪族多氨基多羧酸,在電場(chǎng)中形成正極為酸性,負(fù)極為堿性的連續(xù)的pH梯度。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點(diǎn)的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場(chǎng)中移動(dòng);當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)遷移至其等電點(diǎn)位置時(shí),其靜電荷數(shù)為零,在電場(chǎng)中不再移動(dòng),據(jù)此將蛋白質(zhì)分離。蛋白質(zhì)組學(xué)研究對(duì)提高我國(guó)生物醫(yī)學(xué)原始創(chuàng)新能力、重大疾病防診治能力發(fā)展具有重大的戰(zhàn)略意義。
蛋白質(zhì)組研究:蛋白質(zhì)組研究是指系統(tǒng)研究在某一特定時(shí)間、特定條件下,某一種特定組織中的所有蛋白質(zhì)。對(duì)蛋白質(zhì)的研究也不只是局限于蛋白質(zhì)的氨基酸序列,而是包括了蛋白質(zhì)的表達(dá)量,蛋白質(zhì)活性,被修飾的狀況以及和其他蛋白質(zhì)或分子的相互作用情況、亞細(xì)胞定位和三維結(jié)構(gòu)。這些信息對(duì)于全方面了解復(fù)雜的生物系統(tǒng)有著重要的意義。因此,蛋白質(zhì)組學(xué)研究目標(biāo)是大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究蛋白質(zhì)的特性,以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復(fù)雜的生命活動(dòng)的分子網(wǎng)絡(luò)。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究
蛋白質(zhì)組(Proteome)一詞,源于蛋白質(zhì)(protein)與基因組(genome)兩個(gè)詞的組合。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究
蛋白質(zhì)組學(xué)在農(nóng)業(yè)生物科研領(lǐng)域的應(yīng)用:蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在農(nóng)業(yè)生物科研領(lǐng)域的應(yīng)用為作物生長(zhǎng)發(fā)育、病蟲(chóng)害防治、遺傳育種、畜牧獸醫(yī)學(xué)疾病診斷等方面發(fā)揮重要的作用,為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)發(fā)展開(kāi)辟新途徑。蛋白質(zhì)組學(xué)在農(nóng)作物研究中的應(yīng)用:農(nóng)業(yè)是我國(guó)人口賴(lài)以生存的基礎(chǔ),而提高糧食產(chǎn)量和品質(zhì)則是農(nóng)業(yè)發(fā)展的關(guān)鍵。蛋白質(zhì)組學(xué)關(guān)鍵技術(shù)在作物遺傳育種、品系鑒定、品質(zhì)改良、逆境脅迫應(yīng)答等關(guān)鍵環(huán)節(jié)的應(yīng)用,為農(nóng)業(yè)作物的進(jìn)一步開(kāi)發(fā)利用提供巨大的參考價(jià)值。蛋白質(zhì)組學(xué)可系統(tǒng)研究農(nóng)作物在特定環(huán)境或某個(gè)發(fā)育階段的組織中蛋白質(zhì)的表達(dá)變化,有助于作物發(fā)育過(guò)程機(jī)制的理解。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析研究