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什么是代謝組學(xué)?代謝組學(xué)是用來(lái)解決什么問題的?代謝組學(xué)(Metabonomics/Metabolomics)是發(fā)展起來(lái)的一門新興學(xué)科,是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來(lái)反映某種病理生理過程中所發(fā)生的一系列生物事件。為什么選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段?哈爾濱常規(guī)靶向代謝組學(xué)分析研究
靶向代謝組學(xué):靶向代謝組學(xué)分析主要是以標(biāo)準(zhǔn)品為參照,對(duì)特定的代謝物群進(jìn)行有針對(duì)性地、特異性地檢測(cè)與分析。通常采用的技術(shù)方案包括常規(guī)的液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)分析技術(shù)和選擇性反應(yīng)/多反應(yīng)監(jiān)測(cè)技術(shù)(MRM/ SRM)。常規(guī)分析法首先利用LC-MS的方法對(duì)待分析樣本進(jìn)行大規(guī)模代謝組分析,然后通過與相同分析條件下標(biāo)準(zhǔn)品的分析結(jié)果進(jìn)行比對(duì),實(shí)現(xiàn)對(duì)樣本內(nèi)目標(biāo)代謝群的定性和定量分析。MRM/SRM技術(shù)是基于已知或假定的反應(yīng)離子信息,有針對(duì)性地選擇數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)譜信號(hào)采集,對(duì)符合規(guī)則的離子對(duì)進(jìn)行信號(hào)記錄,去除不符合規(guī)則離子信號(hào)的干擾。定量過程中,該技術(shù)首先篩選到目標(biāo)代謝物特異性的母離子,然后選擇性地對(duì)這些母離子進(jìn)行碰撞誘導(dǎo),去除其他離子的干擾,只對(duì)選定的特異MS/MS2離子進(jìn)行質(zhì)譜信號(hào)的采集,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)目標(biāo)代謝分子更為特異、靈敏、準(zhǔn)確的分析。哈爾濱脂質(zhì)代謝組學(xué)多分析方法代謝組學(xué)與臨床化學(xué)較為相似。
代謝組學(xué)的功能:代謝組學(xué)的功能,就有點(diǎn)類似GPS。代謝組學(xué)不做任何假設(shè),針對(duì)樣本和參照物分別進(jìn)行代謝物全譜檢測(cè),幫你尋找出與差異代謝物,可能會(huì)有好幾十個(gè)甚至更多,從它們所在的被上調(diào)或下調(diào)的代謝通路上去找到關(guān)鍵的代謝酶,再找到它們上游的調(diào)控基因,再進(jìn)行后續(xù)的深入研究,是不是可以避免走一些彎路?可以說代謝組學(xué)是一個(gè)相當(dāng)有效率的研究工具。代謝組學(xué)在生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn),疾病早期診斷和預(yù)測(cè),藥物或營(yíng)養(yǎng)干預(yù)的評(píng)價(jià),藥物毒性評(píng)價(jià),代謝工程研究中均有應(yīng)用,但代謝組學(xué)只是一個(gè)“檢測(cè)平臺(tái)”,它無(wú)法單獨(dú)開展機(jī)制性研究,但是如果合理的將代謝組學(xué)與分子生物學(xué)等學(xué)科協(xié)同使用,就可以起到事半功倍的作用。
代謝組學(xué)是什么?代謝組學(xué)是繼基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)之后新近發(fā)展起來(lái)的一門學(xué)科,是系統(tǒng)生物學(xué)的重要組成部分?;蚪M學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分別從和蛋白質(zhì)層面探尋生命的活動(dòng),而實(shí)際上細(xì)胞內(nèi)許多生命活動(dòng)是與代謝物相關(guān)的,如細(xì)胞信號(hào)(cell signaling),能量傳遞等都是受代謝物調(diào)控的。代謝組學(xué)正是研究代謝組(metabolome)——在某一時(shí)刻細(xì)胞內(nèi)所有代謝物的組合——的一門學(xué)科?;蚺c蛋白質(zhì)的表達(dá)緊密相連,而代謝物則更多地反映了細(xì)胞所處的環(huán)境,這又與細(xì)胞的營(yíng)養(yǎng)狀態(tài),藥物和環(huán)境污染物的作用,以及其它外界因素的影響密切相關(guān)。因此有人認(rèn)為,基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)能夠說明可能發(fā)生的事件,而代謝組學(xué)則反映確實(shí)已經(jīng)發(fā)生了的事情。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體或組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑。
代謝組學(xué)有哪些研究方式?根據(jù)有沒有研究目標(biāo)或方向來(lái)確定,在不確定代謝物或者代謝途徑時(shí)可使用非靶向代謝組學(xué)尋找切入點(diǎn),在有目標(biāo)時(shí)則使用靶向定量進(jìn)行深入研究,針對(duì)性研究脂質(zhì)的則可以使用脂質(zhì)組學(xué)技術(shù)。另外比較新的,譜領(lǐng)生物還提供基于穩(wěn)定性同位素示蹤技術(shù)的代謝流組學(xué)技術(shù)服務(wù)來(lái)研究代謝流量問題。什么是代謝組學(xué)?代謝組學(xué)是末期發(fā)展起來(lái)的一門新興學(xué)科,是研究關(guān)于生物體被擾動(dòng)后(如基因的改變或環(huán)境變化后)其代謝產(chǎn)物(內(nèi)源性代謝物質(zhì))種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的科學(xué)。代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織的內(nèi)源性代謝物質(zhì)的代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。代謝組學(xué)通過揭示內(nèi)在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來(lái)反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程。什么是非靶向代謝組學(xué)、靶向代謝組學(xué)?河南GC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)
代謝組學(xué)主要技術(shù)手段是核磁共振。哈爾濱常規(guī)靶向代謝組學(xué)分析研究
代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅(jiān)信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對(duì)某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。哈爾濱常規(guī)靶向代謝組學(xué)分析研究