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藥物代謝和代謝組學(xué)區(qū)別:代謝組學(xué)與藥物代謝不同是它關(guān)注的對象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內(nèi)源性代謝物。這些代謝物是糖,脂肪,蛋白質(zhì),核酸,膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的,是一個(gè)龐大的混合物。目的是通過樣本的對比,發(fā)現(xiàn)潛在標(biāo)志物,指導(dǎo)疾病早期診斷甚至基因水平的研究。而藥物代謝的目標(biāo)是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內(nèi)變化就好,相當(dāng)具有靶向性,因此使用的技術(shù)手段就是LC-MS。檢測藥物的中間體,和具體的藥效,藥代動(dòng)的效應(yīng)。代謝組學(xué)的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細(xì)胞在一特定生理時(shí)期內(nèi)所有的低分子量代謝產(chǎn)物。哈爾濱非靶向代謝組學(xué)
代謝組學(xué)的研究領(lǐng)域有哪些?1、疾病機(jī)制研究;2、疾病診斷與防治;3、新藥篩選和開發(fā);4、藥物作用機(jī)制的研究;5、藥物毒性評價(jià);6、植物的細(xì)胞代謝組學(xué)研究;7、微生物代謝組學(xué)研究。代謝組學(xué)的研究方法:代謝組學(xué)的研究方法與蛋白質(zhì)組學(xué)的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析,采用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產(chǎn)物以確定其中所有的代謝產(chǎn)物。從本質(zhì)上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個(gè)體中代謝產(chǎn)物的質(zhì)譜峰,了解不同化合物的結(jié)構(gòu),建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析,研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對此進(jìn)行更深入的研究。廣東非靶向代謝組學(xué)定量分析代謝組學(xué)著重研究的是生物整體、組織代謝途徑及其所受內(nèi)在或者外在因素的影響及隨時(shí)間變化的規(guī)律。
代謝組學(xué)技術(shù)介紹:代謝組學(xué)技術(shù)(Metabolomics) 是基因時(shí)代發(fā)展起來的系統(tǒng)生物學(xué)新技術(shù),以生物體內(nèi)所有代謝產(chǎn)物為研究對象,其主要目標(biāo)是定性定量研究代謝物與機(jī)體生理病理變化之間的關(guān)系。代謝物的變化與細(xì)胞所處內(nèi)外環(huán)境密切相關(guān)。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)提供了一種更加直接的生理狀態(tài)檢測方式。就研究方法而言,代謝組學(xué)主要包括靶向(Targeted)代謝組學(xué)和非靶向(Untargeted)代謝組學(xué)兩部分。非靶向代謝組學(xué)是針對一定生理狀態(tài)下的全代謝組學(xué),一目了然地發(fā)現(xiàn)差異性代謝物,其優(yōu)勢在于全方面性。而靶向代謝組學(xué)則是針對具體代謝物,以標(biāo)準(zhǔn)品為參照,進(jìn)行相對的定量分析,具有更好的靈敏度和準(zhǔn)確度。隨著分辨率和掃描速度的提升,高分辨質(zhì)譜儀已經(jīng)應(yīng)用到不同疾病的代謝組學(xué)中??煞治鲅獫{、血清、尿液、唾液、以及細(xì)胞和組織提取液等多種樣本。
代謝組學(xué)樣本收集植物組織:果實(shí)、種子:1)對于含水量高、體積較大的果實(shí)(番茄、西瓜、蘋果等)需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中,標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)對于細(xì)小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等),可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中,標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3)對于要求對整個(gè)果實(shí)進(jìn)行提取的(整粒葡萄等),需要把果實(shí)裝在50 mL離心管/自封袋中,標(biāo)號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min,-80 ℃凍存,干冰寄送。代謝組學(xué)技術(shù)是基因時(shí)代發(fā)展起來的系統(tǒng)生物學(xué)新技術(shù)。
代謝組學(xué)檢測的手段有哪些?主要技術(shù)手段是核磁共振(NMR ),液-質(zhì)聯(lián)用(LC-MS),氣-質(zhì)聯(lián)用(GC-MS),色譜(HPLC,GC)等。通過檢測一系列樣品的譜圖,再結(jié)合化學(xué)模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),基因的功能,藥物的毒性和藥效等,并有可能找出與之相關(guān)的生物標(biāo)志物(biomarker)。代謝組學(xué)可以檢測哪些樣品?代謝組學(xué)主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產(chǎn)物的小分子代謝物(MW<1000)。其樣品主要是尿液,血漿或血清,唾液,以及細(xì)胞和組織的提取液。我們也做過植物,微生物提取物,腦脊液昆蟲血淋巴,羊水,卵泡液,膝蓋滑液,眼淚,糞便及腸道內(nèi)容物提取液等。代謝組學(xué)研究已經(jīng)能診斷出一些代謝類疾病,如糖尿病、肥胖癥,代謝綜合癥。廣東非靶向代謝組學(xué)定量分析
代謝組學(xué)的發(fā)展很迅速。哈爾濱非靶向代謝組學(xué)
靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測 (SIM),或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測 (MRM) 進(jìn)行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強(qiáng)的原因是延長了所選擇離子的采集時(shí)間。因?yàn)楸O(jiān)測的是一個(gè)很小的質(zhì)量窗口,所以質(zhì)量色譜圖只表示對極為特定質(zhì)量的檢測。在大多數(shù)情況下,靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進(jìn)行質(zhì)譜定量的選擇方法,與 SIM 相比更為靈敏、更加特異。可以產(chǎn)生獨(dú)特的碎片離子,可對非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進(jìn)行監(jiān)測和定量。哈爾濱非靶向代謝組學(xué)