BDRhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù)，突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性，針對(duì)多種組織類(lèi)型的樣本，采用BD細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后，單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞，基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序，獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類(lèi)型，可以在不同樣本間從細(xì)胞類(lèi)型的組成和豐度角度進(jìn)行比較，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性，提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿(mǎn)足多種實(shí)驗(yàn)需要，并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。烈冰實(shí)驗(yàn)室包含從樣本處理到測(cè)序下機(jī)的全套實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。上海BD Rhapsody單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
您的珍貴樣本，還可以放心依賴(lài)烈冰生物BDRhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)，BDRhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù)，對(duì)細(xì)胞的捕獲沒(méi)有偏好性，實(shí)現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率，由于單個(gè)微孔板中容納了22萬(wàn)+個(gè)微孔，而現(xiàn)階段單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)技術(shù)通常要求單個(gè)樣本捕獲3000-5000，至高達(dá)10000個(gè)細(xì)胞，即可滿(mǎn)足科研探索需求，因此這種“泊松分布”的原理類(lèi)似于上樣細(xì)胞的無(wú)限稀釋過(guò)程，但22萬(wàn)+微孔的存在，也對(duì)大體量細(xì)胞數(shù)目的科學(xué)研究有很好的包容性，細(xì)胞通量分為可擴(kuò)展至100-40000個(gè)細(xì)胞的捕獲（單個(gè)微孔板），滿(mǎn)足您的多重需求。長(zhǎng)沙BD單細(xì)胞測(cè)序公司單細(xì)胞測(cè)序是高通量測(cè)序下的又一重大技術(shù)突破。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是在單細(xì)胞水平上高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù)，突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性，組織解離后，單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-20000個(gè)細(xì)胞，基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序，獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài)，并鑒定細(xì)胞的類(lèi)型，可以在不同樣本間從細(xì)胞類(lèi)型的組成和豐度角度進(jìn)行比較，反映細(xì)胞間的異質(zhì)性。而2021年橫空出世的10XGenomicsChromiumX平臺(tái)實(shí)現(xiàn)了單塊chip上的百萬(wàn)級(jí)別通量的細(xì)胞捕獲，系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)16個(gè)通道同時(shí)運(yùn)行，每個(gè)通道可捕獲2000-20000個(gè)細(xì)胞（不混樣），并支持原ChromiumController體統(tǒng)外的多種細(xì)胞捕獲百萬(wàn)級(jí)別通量實(shí)驗(yàn)，可準(zhǔn)確鑒別稀有細(xì)胞類(lèi)型和適配大規(guī)模單細(xì)胞研究。
針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)分析時(shí)的reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過(guò)程中：以捕獲5000個(gè)細(xì)胞、100G的測(cè)序量為標(biāo)準(zhǔn)，每個(gè)細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右；每個(gè)細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類(lèi)型，例如成熟的B，T，粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中，由于該類(lèi)型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少，導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等，他們的基因表達(dá)數(shù)較高，甚至可以超過(guò)1W，這就導(dǎo)致該類(lèi)樣本基因中位數(shù)非常高。因此，我們對(duì)細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時(shí)，需要考察實(shí)際組織的細(xì)胞組成。烈冰測(cè)序服務(wù)已助力300余篇國(guó)際期刊研究文章發(fā)表。
基于測(cè)序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處，因?yàn)樗軌蛄私馔粏渭?xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說(shuō)單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息，那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜，為您帶來(lái)樣本的真實(shí)視圖。烈冰自2019年引進(jìn)的BDRhapsody單細(xì)胞平臺(tái)以來(lái)，能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同，單細(xì)胞多組學(xué)簡(jiǎn)化了您需要開(kāi)展的實(shí)驗(yàn)，也節(jié)省了您需要分析的樣本，而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本，還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性，因?yàn)槟恍枰ヅ洳鸱謽颖镜臄?shù)據(jù)集并通過(guò)計(jì)算來(lái)推斷各個(gè)組學(xué)之間的關(guān)系。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn)，累計(jì)服務(wù)與5000余項(xiàng)重要科研項(xiàng)目。深圳BD單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
此外，烈冰開(kāi)展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞多組學(xué)以及空間轉(zhuǎn)錄組等多種產(chǎn)品在內(nèi)的全套科研解決方案，歡迎垂詢(xún)。上海BD Rhapsody單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
根據(jù)烈冰多年單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)經(jīng)驗(yàn)，為什么不建議您一味的追求高細(xì)胞數(shù)量的捕獲：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序所有的分析都是基于細(xì)胞聚類(lèi)進(jìn)行，而細(xì)胞聚類(lèi)是在區(qū)分cell和non-cell后，獲得細(xì)胞基因表達(dá)譜，通過(guò)降維（pca），無(wú)監(jiān)督聚類(lèi)以及可視化（t-SNE）得到的。進(jìn)行細(xì)胞聚類(lèi)時(shí)需要考慮到每個(gè)細(xì)胞的基因表達(dá)模式，因此即使是相同的數(shù)據(jù)，在剔除幾個(gè)細(xì)胞的情況下，前后獲得的聚類(lèi)圖也會(huì)出現(xiàn)明顯不同。而當(dāng)細(xì)胞捕獲數(shù)過(guò)多時(shí)，無(wú)論是假陰性和假陽(yáng)性數(shù)據(jù)還是多細(xì)胞數(shù)據(jù)，都會(huì)對(duì)正常細(xì)胞聚類(lèi)產(chǎn)生影響，造成聚類(lèi)結(jié)果失真。這也是很多文章，特別是很多高分文章，為什么單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在2000-3000的原因了。烈冰建議單個(gè)樣本捕獲細(xì)胞數(shù)在3000-5000個(gè)時(shí)，數(shù)據(jù)量在100G左右時(shí)，可以滿(mǎn)足分析和文章發(fā)表的多重需求。上海BD Rhapsody單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)
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