長沙BD單細胞測序公司

來源: 發(fā)布時間:2022-07-19

烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細胞測序實驗組中心,多地部署搭建BD Rhapsody單細胞實驗平臺,基于微孔的強大的高通量單細胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過簡單的唯恐把工作流程和多重條碼標記系統(tǒng),對高通量單細胞進行多組學的信息捕獲,由此捕獲的信息科進一步生成各種類型的二代測序(NGS)文庫。之后對文庫進行測序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(云平臺)的數(shù)據(jù)可視化分析,實現(xiàn)高位分辨率下的組織內基因的表達差異和表達豐度。單細胞測序技術的迅速發(fā)展和應用推廣,為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強有力的工具。長沙BD單細胞測序公司

烈冰生物BD Rhapsody單細胞分析系統(tǒng),可平行分析成千上萬個單細胞內數(shù)千個基因的表達水平,單細胞RNA-seq正在改變我們對細胞的理解。而烈冰作為多平臺的技術服務提供商,基于BD 在生物學領域40年的專業(yè)技術,滿足您的實驗需求,在單細胞水平理解細胞形態(tài)和功能。BD單細胞測序分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測的局限性,如微陣列和大量細胞RNA-seq,這些技術檢測通過實現(xiàn)對各個細胞之間的微妙差異的觀察,依賴于對多個細胞的平行檢測。用戶可以鑒定和表征新型和罕見細胞類型,其進一步幫助理解從免疫學到疾病發(fā)展的多個領域內的生物學過程。四川BD單細胞轉錄組測序測序的革新讓科學研究從個體基因差異逐漸轉為個體細胞的基因差異。

針對單細胞測序的細胞上樣數(shù),為什么不建議捕獲到的細胞數(shù)量越高越好?一味地追求高數(shù)量的細胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機細胞懸液濃度固定時,如果目標細胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,上樣細胞懸液體積勢必增加,在細胞懸液質量不是很理想(細胞活性<90%、碎片率>5%、結團率均>5%)的情況下,引入的背景信號會增加,分析結果不理想的直接體現(xiàn)包括:cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當cell和non-cell無法有效區(qū)分時,會使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結果!當目標細胞捕獲數(shù)很大時,多細胞率會增加,數(shù)據(jù)分析時,此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測數(shù)和UMI檢測數(shù)是正常cell的N倍(N是一個GEM包裹的細胞數(shù)),導致所有細胞的統(tǒng)計數(shù)據(jù)(單個細胞基因檢測中位數(shù)、單個細胞UMI檢測中位數(shù))虛高。此部分“cell”雖然可以通過設置數(shù)據(jù)分析閾值進行過濾,但是容易會有此類數(shù)據(jù)的殘留和正常高基因檢測細胞的人為去除!

單細胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便:單細胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數(shù)即可運行,即使生信0基礎用戶也可以運用自如;可視化展示海量結果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結果進行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。BD 單細胞捕獲平臺搭配BD Scanner,全流程實時質控,項目質量盡在掌握。

烈冰生物單細胞測序服務,為您提供可視化質控系統(tǒng),保證每次實驗的可靠性:BD Rhapsody 掃描儀具有直接成像功能,可在工作流程的不同階段進行質量控制,如細胞捕獲率和細胞多態(tài)率(雙細胞率)。成像儀指標可以確認起始細胞樣本的質量,并確認微孔板工作流程中每個步驟的成功完成狀態(tài) ;在細胞裂解前的步驟中評估細胞活性;并對通過測序確定的細胞回收量進行可靠估算。利用這些信息,在進行高成本的下游測序之前,用戶可根據(jù)需要改變方向并解決實驗中遇到的問題。這些指標允許用戶對不同工作日間的或者不同研究中心間的工作流程性能進行跟蹤。烈冰斥巨資引進Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀元。single cell 單細胞測序服務

烈冰單細胞多組學測序助您探究細胞類型特異性和基因調控網(wǎng)絡特征。長沙BD單細胞測序公司

對于稀有樣本,或細胞量比較少的稀有組織,樣本中每一粒細胞都很珍貴,BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對該種類型的樣本能實現(xiàn)友好包容,如果在實際實驗中,我們發(fā)現(xiàn)因為樣本類型和制備單細胞懸液方法的不同,容易出現(xiàn)單細胞懸液中死亡細胞的比例較高的情況。也會和您探討是否考慮去除單細胞懸液中的死細胞和其他污染物的操作,以獲得高質量數(shù)據(jù)是至關重要的。這是因為,死亡的細胞易裂解導致其中的RNA釋放出來。這種cell-free RNA會導致檢測的背景噪聲,并會影響單細胞數(shù)據(jù)的質量。因此當樣本活性較差時,對細胞懸液中細胞活性檢測后,需要進行一般死細胞去除的工作(一般懸液活性小于70%時考慮此操作),以保證較高的上機捕獲細胞的質量。長沙BD單細胞測序公司

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營品牌有NovelBio,烈冰生物,NovelBrain,PanoCell,烈冰智造,發(fā)展規(guī)模團隊不斷壯大,該公司服務型的公司。烈冰生物是一家有限責任公司(自然)企業(yè),一直“以人為本,服務于社會”的經(jīng)營理念;“誠守信譽,持續(xù)發(fā)展”的質量方針。以滿足顧客要求為己任;以顧客永遠滿意為標準;以保持行業(yè)優(yōu)先為目標,提供***的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序。烈冰生物順應時代發(fā)展和市場需求,通過**技術,力圖保證高規(guī)格高質量的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉錄組測序,單細胞多組學測序。