寧波烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序

來源: 發(fā)布時間:2022-08-15

RNA測序(RNA-seq)是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的重要工具,也是生命科學(xué)領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性,轉(zhuǎn)錄組學(xué)有以下優(yōu)勢:1)能夠動態(tài)考察細胞基因組的表達,多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結(jié)構(gòu)以及在細胞生命活動中的重要調(diào)控作用;3)與蛋白組學(xué)研究相互補充,多角度呈現(xiàn)細胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的技術(shù)基礎(chǔ),RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代,現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序為眾多科研和醫(yī)學(xué)工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。烈冰科技成立10余年,為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。寧波烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序

基因測序是基因檢測的方法之一,其又叫基因譜測序,是國際上公認的一種基因檢測標準。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次顛覆性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條核酸序列進行測定,被稱為下一代測序技術(shù)(nextgenerationsequencing),足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉(zhuǎn)錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)?;驕y序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實驗室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用,可以說,基因測序技術(shù)將是下一個改變世界的技術(shù)。溫州scRNA空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持空間轉(zhuǎn)錄組測序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。

空間組測序技術(shù),作為現(xiàn)階段單細胞技術(shù)的重要補充技術(shù)進入了組學(xué)的實驗領(lǐng)域以及生物信息學(xué)的分析領(lǐng)域。通過單細胞測序(單細胞表達尺度)+空間轉(zhuǎn)錄組測序(空間表達尺度)+數(shù)字病理(臨床診斷尺度)聯(lián)合分析可在空間和時間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng),多角度深入分析組織的形態(tài)特征、基因組學(xué)特征、表觀遺傳調(diào)控因子以及樣本中的免疫微環(huán)境。不同于單細胞測序分析的需求-分析-需求-分析的模式,空間轉(zhuǎn)錄組分析實際上是非常需要研究者和企業(yè)之間的互動的,尤其是對于組織切片的理解,一個在線互相交流空間轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的系統(tǒng)也是空轉(zhuǎn)分析中不可或缺的一環(huán),也是重中之重。

轉(zhuǎn)錄組分析指對細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的分析。轉(zhuǎn)錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)進行親和純化的RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄生成的成熟mRNA和ncRNA進行高通量測序。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺,轉(zhuǎn)錄組測序無需預(yù)先針對已知序列設(shè)計探針,即可對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進行檢測,提供更精確的數(shù)字化信號,是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強大工具。FFPE空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理 為同時獲得空間表達和組織學(xué)背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學(xué)染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。烈冰對于一個細胞群體中的每個細胞單獨進行建庫測序分析。

空間組學(xué)可以應(yīng)用的方向:1.可以鑒定到疾病的空間位置異質(zhì)性:對于阿爾茨海默癥的研宄可以探索到小神經(jīng)質(zhì)細胞趨向于阿爾茨海默神經(jīng)班。 2.建立空間轉(zhuǎn)錄組圖譜構(gòu)建個人空間轉(zhuǎn)錄組圖譜將極大提升科研人員對生物體組織間的細胞差異。3、描述胚胎發(fā)育及空間藍區(qū)胚胎發(fā)育的動態(tài)過程是科研人員一直為之著迷的,空間組學(xué)發(fā)展可以清晣的描繪胚胎發(fā)育的藍圖。除了皮膚、胰腺和骨頭組織外,其余樣本類型均可開展10xGenomics空間轉(zhuǎn)錄組研究。10xGenomics公司已經(jīng)測試完畢的組織類型有:人:心勝、腎勝、卵巢、乳房、淋巴結(jié)、大腦、大腸、肺、脾臟小鼠:大腦、眼睛、心勝、腎勝、大腸、肝臟、肺、卵巢,四頭肌、小腸、脾勝、胃、翠丸、甲狀腺、舌頭大鼠:大腦、腎臟、心臟空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,為從多維度揭示疾病進展提供了強有力的工具。廣州烈冰空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析

烈冰實驗室包含從樣本處理到測序下機的全套實驗平臺。寧波烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序

空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可以用單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析策略進行分析,例如,利用GO和Pathway分析篩選不同發(fā)育時期特定空間區(qū)域內(nèi)的信號通路及其關(guān)鍵基因的較大情況,揭示在特定發(fā)育時期特定區(qū)域內(nèi)發(fā)生的生物學(xué)過程。針對任何一個基因,空間轉(zhuǎn)錄組可以顯示表達該基因的點陣及其空間排布;單細胞轉(zhuǎn)錄組可以給出該基因表達的細胞類群;原位測序可以給出該基因在細胞內(nèi)的表達狀況。通過不同發(fā)育時間點的信息比較,可以分析細胞類群在某個部位在不同時間點的差異,給出其在細胞內(nèi)的真實的演變狀況。寧波烈冰科技空間轉(zhuǎn)錄組測序

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除??兀浖_發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實、誠實可信的企業(yè)。烈冰生物作為醫(yī)藥健康的企業(yè)之一,為客戶提供良好的單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學(xué)測序。烈冰生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心,為用戶帶來良好體驗。烈冰生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場需求,提高產(chǎn)品價值,是我們前行的力量。