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空間轉(zhuǎn)錄組測序的關(guān)鍵就在于,解決了空間位置保留的問題。被放置在芯片區(qū)域內(nèi)的冰凍組織切片在經(jīng)過H&E染色和成像記錄后,會被進行透化處理,釋放細胞中的RNA。芯片上的捕獲引物的中段設(shè)置了帶有獨特標識的條形碼區(qū)域。芯片被劃分為了數(shù)個不同的捕獲區(qū)域,每個捕獲區(qū)域中錨定的引物都帶有不同的條形碼序列。每個區(qū)域?qū)?yīng)的組織位置會被記錄下來,然后再進行測序后,通過條形碼將不同區(qū)域的測序結(jié)果,映射到對應(yīng)的組織位置上,拼貼形成組織樣品的空間轉(zhuǎn)錄組圖像??臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)提供了空間轉(zhuǎn)錄組水平下的科學研究視角。濟南BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持
RNA測序(RNA-seq)是轉(zhuǎn)錄組學研究的重要工具,也是生命科學領(lǐng)域常用的技術(shù)之一。相比于傳統(tǒng)通路研究低維度、低通量的局限性,轉(zhuǎn)錄組學有以下優(yōu)勢:1)能夠動態(tài)考察細胞基因組的表達,多維度地反映差異變化;2)可用于研究占RNA絕大部分的非編碼RNA,研究其結(jié)構(gòu)以及在細胞生命活動中的重要調(diào)控作用;3)與蛋白組學研究相互補充,多角度呈現(xiàn)細胞水平的變化信息。作為轉(zhuǎn)錄組學研究的技術(shù)基礎(chǔ),RNA測序技術(shù)也在不斷地更新迭代,現(xiàn)如今更大通量、更深精度的測序為眾多科研和醫(yī)學工作者提供了豐富的工具和探索真理的手段。合肥BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組多組學測序空間轉(zhuǎn)錄組測序以分子方式定義病理,完成了病理數(shù)字化結(jié)合病理影像化的革新。
轉(zhuǎn)錄組分析指對細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的分析。轉(zhuǎn)錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶(oligo-dT)進行親和純化的RNA聚合酶II轉(zhuǎn)錄生成的成熟mRNA和ncRNA進行高通量測序。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺,轉(zhuǎn)錄組測序無需預(yù)先針對已知序列設(shè)計探針,即可對任意物種的整體轉(zhuǎn)錄活動進行檢測,提供更精確的數(shù)字化信號,是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強大工具。FFPE空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理 為同時獲得空間表達和組織學背景信息,該方案首先將FFPE組織切片置于Visium基因芯片上進行組織學染色和成像,然后利用切片下方Visium基因芯片上的探針進行表達定量。
作為2019年的明星技術(shù)之一,10x Genomics單細胞測序憑借其高通量、低成本、易操作、穩(wěn)定性高等優(yōu)勢一直保持著高熱度,目前利用該平臺發(fā)表的文章已達500多篇??臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)優(yōu)勢:實現(xiàn)基因表達數(shù)據(jù)與空間定位信息的結(jié)合,解析多種類型組織切片樣本中基因表達譜;無需組織解離,保留組織結(jié)構(gòu)及細胞微環(huán)境,鑒定異質(zhì)性組織中細胞類型,避免相關(guān)偏好性;可用于挖掘新的組織生物標記物;可與現(xiàn)行實驗室組織分析方法輕松對接,短時間內(nèi)即可完成切片及文庫制備流程??臻g轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,為從多維度揭示疾病進展提供了強有力的工具。
烈冰與國內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務(wù)于600+臨床與研究機構(gòu),1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計),在單細胞領(lǐng)域,烈冰助力用戶發(fā)表單細胞文獻30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、NatureCellBiology、NaturePlants、AdvancedScience等生物領(lǐng)域國際主流學術(shù)期刊,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機制,免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。豐富的測序和數(shù)據(jù)分析經(jīng)驗,烈冰配套全程個性化、定制化地數(shù)據(jù)分析服務(wù)。溫州上海烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組商業(yè)化服務(wù)
國產(chǎn)化PanoCell空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺,提供高性價比服務(wù)方案。濟南BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持
空間轉(zhuǎn)錄組測序是在組織原位檢測全轉(zhuǎn)錄組基因表達的?種技術(shù),可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達情況,同時能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細胞轉(zhuǎn)錄組測序相?,空間轉(zhuǎn)錄組測序漿病理影像(H&E染?)與測序數(shù)據(jù)映射在?起,進?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)的細胞異質(zhì)性。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息,而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息??臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境,將成為發(fā)育生物學、神經(jīng)生物學、免疫生物學等領(lǐng)域的研究利器。濟南BD Rhapsody空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司一直專注于生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢,市場營銷策劃,市場信息咨詢與調(diào)查(不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗),從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù),計算機、軟件及耗材(除??兀?,軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動】,是一家醫(yī)藥健康的企業(yè),擁有自己**的技術(shù)體系。公司目前擁有較多的高技術(shù)人才,以不斷增強企業(yè)重點競爭力,加快企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新,實現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營。公司以誠信為本,業(yè)務(wù)領(lǐng)域涵蓋單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序,我們本著對客戶負責,對員工負責,更是對公司發(fā)展負責的態(tài)度,爭取做到讓每位客戶滿意。公司深耕單細胞測序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺,空間轉(zhuǎn)錄組測序,單細胞多組學測序,正積蓄著更大的能量,向更廣闊的空間、更寬泛的領(lǐng)域拓展。