上海一步法逆轉(zhuǎn)錄穩(wěn)定性高

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-12-03

逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)備工作:1、實(shí)驗(yàn)器具與材料:(1)移液頭:200ul、10ul;(2)吸頭:200ul、20ul;(3)EP管1。5ml、100ul;(4)水浴箱。2、實(shí)驗(yàn)器具的處理與準(zhǔn)備,塑料制品:(包括吸頭、EP管等)將塑料制品逐個(gè)浸泡于1‰DEPC水中(必要時(shí)小頭頭需要用吸管打入DEPC水)37℃過(guò)夜,然后送至高壓3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小時(shí)左右烘干),試驗(yàn)前將頭頭放入吸頭臺(tái)。3、試劑配制和準(zhǔn)備:(1)DEPC水:泡實(shí)驗(yàn)器具的DEPC水的配制:1000ml雙蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml容量瓶中靜置4小時(shí)后備用。逆轉(zhuǎn)錄中所用的DEPC水的配制:100ml鹽水瓶?jī)?nèi)裝40ml雙蒸水,加40ulDEPC,37℃過(guò)夜,送至高壓,后分裝到幾個(gè)1。5mlEP管中,-20℃中保存?zhèn)溆谩#?)RT中所需要的各種試劑。逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程由逆轉(zhuǎn)錄酶催化,此酶也稱依賴RNA的DNA聚合酶,即以RNA為模板催化DNA鏈的合成。上海一步法逆轉(zhuǎn)錄穩(wěn)定性高

反轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase,也可寫(xiě)成逆轉(zhuǎn)錄酶)又稱為依賴RNA的DNA聚合酶。1970年Temin等在致死RNA病毒中發(fā)現(xiàn)了一種特殊的DNA聚合酶,該酶以RNA為模板,以dNTP為底物,tRNA(主要是色氨酸t(yī)RNA)為引物,在tRNA3'-OH末端上,根據(jù)堿基配對(duì)的原則,按5'-3'方向合成一條與RNA模板互補(bǔ)的DNA單鏈,這條DNA單鏈叫做互補(bǔ)DNA(complementaryDNA,CDNA)。反轉(zhuǎn)錄酶(Reversetranscriptase)是以RNA為模板指導(dǎo)三磷酸脫氧核苷酸合成互補(bǔ)DNA(cDNA)的酶。哺乳類C型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶和鼠類B型病毒的反轉(zhuǎn)錄酶都是一條多肽鏈。鳥(niǎo)類RNA病毒的反轉(zhuǎn)錄酶則由兩上亞基結(jié)構(gòu)。真核生物中也都分離出具有不同結(jié)構(gòu)的反轉(zhuǎn)錄酶。紹興一體化逆轉(zhuǎn)錄酶逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)中引物設(shè)計(jì)時(shí)要注意反向引物特異性和長(zhǎng)度,避免循環(huán)擴(kuò)增和特異性問(wèn)題。

逆轉(zhuǎn)錄的發(fā)現(xiàn)有重要的理論意義和實(shí)踐意義。對(duì)分子生物學(xué)的中心法則進(jìn)行了修正和補(bǔ)充。經(jīng)典的中心法則認(rèn)為:DNA的功能兼有遺傳信息的傳遞和表達(dá),因此,DNA處于生命活動(dòng)的中心位置。逆轉(zhuǎn)錄現(xiàn)象說(shuō)明:至少在某些生物中,RNA同樣兼有遺傳信息傳遞和表達(dá)功能。修正后的中心法則表示為:是指遺傳信息從DNA傳遞給RNA,再?gòu)腞NA傳遞給蛋白質(zhì),即完成遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯的過(guò)程。也可以從DNA傳遞給DNA,即完成DNA的復(fù)制過(guò)程。這是所有有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物所遵循的法則。某些病毒中的RNA自我復(fù)制和在某些病毒中能以RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄成DNA的過(guò)程(某些致死病毒)。有些亞病毒例如朊病毒,這種亞病毒沒(méi)有核酸,是一種因錯(cuò)誤折疊而形成的結(jié)構(gòu)異常的蛋白質(zhì),以蛋白質(zhì)直接形成蛋白質(zhì),可促使與自身具有相同氨基酸序列的蛋白質(zhì)發(fā)生同樣的折疊錯(cuò)誤,從而導(dǎo)致大量結(jié)構(gòu)異常的蛋白質(zhì)的形成。當(dāng)然,一般不認(rèn)為亞病毒屬于生物。

莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄是一種逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)的技術(shù),它利用莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子作為反向引物,在逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程中特異性地?cái)U(kuò)增目標(biāo)RNA分子。該技術(shù)在分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)研究中得到了普遍的應(yīng)用,特別是在RNA的研究和檢測(cè)中具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)的基本原理是利用逆轉(zhuǎn)錄酶和莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA作為反向引物,將RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,并在PCR反應(yīng)中擴(kuò)增。莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子具有較高的穩(wěn)定性和特異性,可以特異性地識(shí)別和結(jié)合目標(biāo)RNA分子,從而在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中作為反向引物擴(kuò)增目標(biāo)cDNA。此外,由于莖環(huán)結(jié)構(gòu)的RNA分子與目標(biāo)RNA分子的堿基序列互補(bǔ),因此莖環(huán)法逆轉(zhuǎn)錄技術(shù)可以避免隨機(jī)引物引起的非特異擴(kuò)增。逆轉(zhuǎn)錄經(jīng)常與細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化有關(guān),艾滋、乙肝等很多疾病也有逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程。

miRNA逆轉(zhuǎn)錄莖環(huán)法:首先需要進(jìn)行RNA樣品制備,可選的方法有:離心柱法抽提(不必去除gDNA);傳統(tǒng)Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分別設(shè)計(jì)。是否采用通用引物視情況而定,正向引物與通用反向引物不會(huì)形成二聚體時(shí)才能用。取200ul的PCR管,根據(jù)所得每組RNA的濃度C,每孔加入1000ng總RNA,按公式1000ng/C計(jì)算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應(yīng)體系說(shuō)明,依次向200μL的PCR管內(nèi)加入下列試劑:加樣結(jié)束后,移液器吹打混勻,低速離心數(shù)秒。將逆轉(zhuǎn)錄PCR管放入PCR擴(kuò)增儀內(nèi),調(diào)整參數(shù):37℃15min(反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)),85℃5s(反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng)),4℃∞。反應(yīng)結(jié)束后根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說(shuō)明:此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉(zhuǎn)錄引物,注意相應(yīng)地調(diào)整無(wú)酶水的體積和反應(yīng)溫度。逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)完成反應(yīng)后要及時(shí)保存和處理PCR產(chǎn)物,并記錄實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和結(jié)果等。上海一步法逆轉(zhuǎn)錄穩(wěn)定性高

逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)反應(yīng)過(guò)程中需控制反應(yīng)溫度,時(shí)間和pH值等指標(biāo)。上海一步法逆轉(zhuǎn)錄穩(wěn)定性高

miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR,miRNA加尾法逆轉(zhuǎn)錄:增加miRNA逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物長(zhǎng)度較直接的方法就是增加miRNA的長(zhǎng)度,即在miRNA的3端后面添加一段序列,然后進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。因此,加尾法是由兩個(gè)酶共同作用完成的,它們分別是PolyA聚合酶和逆轉(zhuǎn)錄酶。PolyA聚合酶負(fù)責(zé)給miRNA加上PolyA尾,增加其長(zhǎng)度。之后逆轉(zhuǎn)錄引物結(jié)合到PolyA序列上,由逆轉(zhuǎn)錄酶完成加長(zhǎng)版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆轉(zhuǎn)錄和qPCR中的qPCR:miRNA熒光定量PCR的過(guò)程跟普通mRNA的相似,但由于加尾法逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的5端均為通用序列,因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R),不同的是根據(jù)miRNA序列設(shè)計(jì)的正向引物。正向引物的特異性就變得非常重要。對(duì)于內(nèi)參,生工生物的miRNA加尾法首先鏈cDNA合成試劑盒(B532451)中內(nèi)置了內(nèi)參U6的正向引物,使用該引物與通用引物R即可進(jìn)行內(nèi)參U6的擴(kuò)增。上海一步法逆轉(zhuǎn)錄穩(wěn)定性高