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蛋白A-微球菌核酸酶(pA-MNase)是一種特殊的融合蛋白,它結(jié)合了蛋白A和微球菌核酸酶(MNase,MicrococcalNuclease)的特性。以下是pA-MNase的一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**融合表達(dá)產(chǎn)物**:pA-MNase是蛋白A與微球菌核酸酶MNase的融合表達(dá)產(chǎn)物,因此它同時(shí)具有ProteinA的抗體結(jié)合活性和MNase的核酸內(nèi)切酶活性。2.**雙重功能**:由于其雙重功能,pA-MNase常用于蛋白質(zhì)-DNA相互作用研究,特別是在ChIC(ChromatinImmunocleavage)和CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)技術(shù)中。3.**ProteinA的特性**:ProteinA是一種發(fā)現(xiàn)于金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的細(xì)胞壁表面蛋白,分子量為42kDa,能特異性地與哺乳動(dòng)物免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)結(jié)合,通常結(jié)合部位為免疫球蛋白的Fc區(qū)。4.**微球菌核酸酶(MNase)的特性**:MNase是一種核酸內(nèi)切酶,能夠降解核酸,常用于降解蛋白質(zhì)制備中存在的核酸,減少細(xì)胞裂解液的粘度,以及用于染色質(zhì)結(jié)構(gòu)分析和快速RNA測(cè)序。5.**反應(yīng)條件**:MNase的反應(yīng)條件包括1XMicrococcalNucleaseReactionBuffer,需要補(bǔ)充100μg/ml重組白蛋白,分子生物學(xué)級(jí),并在37°C下孵化。FnCas12a包含約1300個(gè)氨基酸,含有RuvC-like結(jié)構(gòu)域,同時(shí)具有DNA和RNA內(nèi)切酶的活性。Recombinant Human IL-25/IL-17E Protein,His Tag
Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在PCR產(chǎn)物的克隆中主要應(yīng)用在以下幾個(gè)方面:1.**單鏈DNA的生成**:-Lambda核酸外切酶可以用于從雙鏈DNA中生成單鏈DNA。由于該酶沿5'→3'方向逐步切去5'單核苷酸,底物是5'磷酸化的雙鏈DNA,因此可以用來(lái)消化PCR產(chǎn)物中的一條鏈,從而生成單鏈DNA,這對(duì)于某些克隆技術(shù)來(lái)說(shuō)是必要的步驟。2.**PCR產(chǎn)物的克隆**:-在克隆過(guò)程中,有時(shí)需要將PCR產(chǎn)物的5'端磷酸化,以便與載體連接。Lambda核酸外切酶可以消化非磷酸化的DNA,從而在一定程度上幫助準(zhǔn)備適合克隆的PCR產(chǎn)物。3.**減少自身環(huán)化和非特異性連接**:-在連接反應(yīng)中,為了減少質(zhì)粒載體的自身環(huán)化,可以使用堿性磷酸酶處理質(zhì)粒DNA以去除5'磷酸基團(tuán)。而Lambda核酸外切酶可以消化5'端磷酸化的DNA,因此在某些情況下,它可以輔助減少PCR產(chǎn)物的自身環(huán)化,尤其是在PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒載體的連接反應(yīng)中。4.**提高克隆效率**:-通過(guò)消化PCR產(chǎn)物中的一條鏈,Lambda核酸外切酶可以幫助減少PCR產(chǎn)物的非特異性連接,從而提高克隆的效率和準(zhǔn)確性。綜上所述,Lambda核酸外切酶在PCR產(chǎn)物的克隆中主要通過(guò)生成單鏈DNA、準(zhǔn)備適合克隆的PCR產(chǎn)物、減少自身環(huán)化和非特異性連接以及提高克隆效率等方面發(fā)揮作用。Recombinant Biotinylated Human FGF21 Protein,mFc-Avi Tag盡管Ultra-Long Master Mix設(shè)計(jì)用于長(zhǎng)片段擴(kuò)增,但在某些情況下,可能出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增,需要通過(guò)優(yōu)化引物。
在PCR實(shí)驗(yàn)中,除了BsuDNAPolymerase,還有幾種聚合酶適合高溫?cái)U(kuò)增,包括:1.**TaqDNAPolymerase**:這是常用的PCR聚合酶,來(lái)源于Thermusaquaticus,能夠在72°C的比較好活性溫度下工作。它具有良好的熱穩(wěn)定性,可以承受PCR的熱變性步驟,且中途不需要再添加酶。2.**PfuDNAPolymerase**:來(lái)源于Pyrococcusfuriosus,具有出色的熱穩(wěn)定性和3'→5'外切酶活性,提供校正功能,適用于對(duì)PCR保真性要求較高的實(shí)驗(yàn),如基因篩選、克隆表達(dá)、突變檢測(cè)、定點(diǎn)突變等。3.**VentDNAPolymerase**:來(lái)源于Litoralis棲熱球菌,具有3'→5'外切酶活性,可以去除錯(cuò)配的堿基,具有校對(duì)功能,保真度比TaqDNAPolymerase高5~15倍。4.**KODDNAPolymerase**:來(lái)自Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,保真性比PfuDNAPolymerase更高,優(yōu)化后的PCR反應(yīng)緩沖液能使得其擴(kuò)增速度達(dá)到Taq酶的2倍、Pfu酶的5-6倍。5.**BstDNAPolymerase**:來(lái)源于Bacillusstearothermophilus,具有3'到5'外切割活性,適用于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如LAMP技術(shù),可在恒溫下進(jìn)行DNA擴(kuò)增,無(wú)需繁瑣的溫度循環(huán)。
T5核酸外切酶(T5Exonuclease)具有以下特點(diǎn)和技術(shù)應(yīng)用:1.**降解方向**:T5核酸外切酶按照5'→3'方向降解雙鏈或單鏈DNA。2.**起始消化位置**:T5核酸外切酶既能從單鏈或雙鏈DNA的5'末端起始消化,也可以從線性或環(huán)狀雙鏈DNA的缺口(gap)或缺刻(nick)處起始消化。3.**對(duì)超螺旋雙鏈DNA的作用**:T5核酸外切酶無(wú)法降解超螺旋雙鏈DNA。4.**單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性**:T5核酸外切酶還具有單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性。5.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-用于Gibson組裝,這是一種在恒溫條件下有效連接帶有多個(gè)重疊序列片段的技術(shù)。-從完全連接的環(huán)狀雙鏈DNA中去除不完全連接產(chǎn)物。-降解堿裂解質(zhì)粒提取方法中產(chǎn)生的變性DNA,增加超螺旋DNA比例,提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。-降解質(zhì)粒樣品中污染的線性化和切刻DNA。6.**操作條件**:推薦在37℃溫育30分鐘,之后加入EDTA至終濃度為20mM終止反應(yīng)。7.**儲(chǔ)存條件**:-25~-15℃保存,有效期3年。8.**注意事項(xiàng)**:避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止本品失活。這些特點(diǎn)和技術(shù)應(yīng)用使得T5核酸外切酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,尤其是在DNA克隆和基因片段組裝中,具有重要的應(yīng)用價(jià)值。泛素連接酶E3識(shí)別特定的靶蛋白,并促進(jìn)E2上的泛素轉(zhuǎn)移到靶蛋白的賴氨酸殘基上,形成泛素化標(biāo)記。
在比較BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶對(duì)于復(fù)雜DNA片段擴(kuò)增的適用性時(shí),以下是一些關(guān)鍵點(diǎn):1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高熱穩(wěn)定性和擴(kuò)增效率而被應(yīng)用于常規(guī)PCR。它擴(kuò)增速度為30-60秒/kb,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,無(wú)校正功能,易產(chǎn)生錯(cuò)配堿基。-對(duì)于結(jié)構(gòu)復(fù)雜的模板,如GC含量高、有二級(jí)結(jié)構(gòu)等,TaqPlus可以用于擴(kuò)增,能有效地?cái)U(kuò)增10kb以下的片段。-有產(chǎn)品如TitaniumTaqDNA聚合酶,它是通過(guò)基因工程改造的Taq酶,缺失了5'-3'外切酶活性,具備更強(qiáng)大的擴(kuò)增性能,適合擴(kuò)增高度復(fù)雜的DNA混合物。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高適溫度,能夠適應(yīng)更加苛刻的擴(kuò)增條件,同時(shí)消除DNA二級(jí)結(jié)構(gòu),因而能夠準(zhǔn)確并且均勻地?cái)U(kuò)增全基因組序列。-BstDNA聚合酶大片段能夠優(yōu)先擴(kuò)增短片段的DNA,并且能夠確保擴(kuò)增得到的DNA覆蓋了整個(gè)基因組,連貫并且無(wú)偏地?cái)U(kuò)增所有的遺傳位點(diǎn)。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,Pfu酶的9倍,擴(kuò)增速度高達(dá)10秒/kb,擴(kuò)增目的片段長(zhǎng)達(dá)13kb,具有極強(qiáng)的擴(kuò)增效率的模板適應(yīng)性,非常適合復(fù)雜模板的高保真擴(kuò)增。
隨后,泛素分子從E1轉(zhuǎn)移到泛素結(jié)合酶E2,再通過(guò)泛素連接酶E3的作用,將泛素分子連接到靶蛋白上。Recombinant Human IL-25/IL-17E Protein,His Tag
BsuDNAPolymerase(LargeFragment,5U/μL)是一種來(lái)源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillussubtilis)的DNA聚合酶。這種酶保留了BsuDNAPolymeraseI的5'-3'聚合酶活性,但缺失了5'-3'核酸外切酶結(jié)構(gòu)域,因此它具有鏈置換活性,可以用于重組酶聚合酶擴(kuò)增(RPA)等恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。以下是BsuDNAPolymerase(LargeFragment,5U/μL)的一些關(guān)鍵特性和應(yīng)用:1.**活性定義**:在37°C條件下,30分鐘內(nèi)將10nmol的dNTP摻入酸不溶性物質(zhì)所需的酶量定義為1個(gè)活性單位(U)。2.**熱失活條件**:75°C,20分鐘。3.**酶保存液成分**:25mMTris-HCl,50mMNaCl,1mMDTT,0.1mMEDTA,50%Glycerol,pH7.4@25°C。4.**儲(chǔ)存條件**:-25~-15°C保存,有效期2年。5.**注意事項(xiàng)**:-由于缺乏3'-5'核酸外切酶活性,BsuDNAPolymerase(LargeFragment)不能切除3'未配對(duì)的突出末端,因而不適用于生成平齊末端。-25°C時(shí)BsuDNAPolymerase(LargeFragment)保留50%的活性,是同溫度下Klenow片段(3'-5'exo-)的兩倍。6.**應(yīng)用**:-隨機(jī)引物法標(biāo)記。-cDNA第二條鏈的合成。-單個(gè)dA的加尾。-鏈置換的DNA合成。Recombinant Human IL-25/IL-17E Protein,His Tag