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空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理是什么?當組織冷凍切片附在空間轉(zhuǎn)錄組載片上時,條形碼引物結(jié)合并從組織中捕獲鄰近的mRNA。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄,得到的cDNA中包含了空間條形碼。分析Illumina測序結(jié)果中空間條形碼的序列,可以將每個mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的起始位置。空間轉(zhuǎn)錄組的條形碼逆轉(zhuǎn)錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著,空間轉(zhuǎn)錄組使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,致力通過質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。10X Genomics 繼單細胞測序后也推出了空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)。上??臻g轉(zhuǎn)錄組報價
空間轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用有哪些?一、發(fā)現(xiàn)疾病的空間異質(zhì)性:同時了解患病組織中的細胞類型及其定位有助于解決空間分辨的轉(zhuǎn)錄組學(xué)問題。在不同的環(huán)境下,明智地選擇這些方法在生物學(xué)研究中也是至關(guān)重要的,例如在神經(jīng)科學(xué)中,基于FISH的方法很普遍;基于LCM的方法適用于小樣本(例如臨床樣本)以及整個轉(zhuǎn)錄組或基因組分析。二、構(gòu)建空間轉(zhuǎn)錄組圖譜:借助于空間分辨的單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué),建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結(jié)構(gòu)的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄技術(shù),得到多個***的時空轉(zhuǎn)錄組圖譜(相關(guān)研究后續(xù)會在如下專輯更新)。江西10x空間轉(zhuǎn)錄組空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析軟件開發(fā)語言統(tǒng)計情況。
空間轉(zhuǎn)錄組的方法和技術(shù)有哪些?廣義上講,現(xiàn)有的生成空間分辨轉(zhuǎn)錄組學(xué)的方法可分為四類:用于空間重建的計算策略和組學(xué)實驗的組合,使用激光捕獲顯微切割(LCM)結(jié)合高通量進行直接測量,使用熒光物質(zhì)的基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學(xué) ,以及基于寡核苷酸的空間條形碼再加上高通量。每種方法都有其優(yōu)點和缺點??臻g重構(gòu)的計算策略:這種計算方法可以充分利用內(nèi)在基因表達模式或共表達的趨勢,從單個細胞的大量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中重構(gòu)細胞間的環(huán)境。然而,這些推論方法在某些情況下*呈現(xiàn)空間趨勢或特定組織的總體布局。基于LCM的方法:基于LCM的轉(zhuǎn)錄組學(xué)或基因組學(xué)成功地獲得了單個細胞的空間轉(zhuǎn)錄組,盡管其通量很低,但是在可以標記成千上萬個單個細胞位置的多路復(fù)用條形碼策略可行之前,將少量細胞的數(shù)據(jù)粗略地整合到構(gòu)成***的巨大背景中,可能具有一定價值。基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學(xué):基于圖像的原位轉(zhuǎn)錄組學(xué)在很大程度上增加了可檢測區(qū)域,但也存在一些問題,例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾、轉(zhuǎn)錄本積累等復(fù)雜背景中提取單個細胞??臻g條形碼加高通量:費用較高且無法在單個細胞中獲得轉(zhuǎn)錄組。
歐易生物自引進10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組以來已經(jīng)完成了上百例樣本測序,在樣本包埋、切片、實驗和數(shù)據(jù)分析上積累了大量寶貴的經(jīng)驗。本次培訓(xùn)班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉(zhuǎn)錄組的研究熱點和方案設(shè)計,分享歐易生物在樣本處理、實驗和數(shù)據(jù)挖掘上的成功經(jīng)驗,助力各位科研工作者取得新的突破。招生對象:A、對空間轉(zhuǎn)錄組感興趣,期望了解空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),或近期準備開展空間轉(zhuǎn)錄組測序項目B、項目已經(jīng)開展,需要深入挖掘數(shù)據(jù)的科研工作者。本次培訓(xùn)班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉(zhuǎn)錄組的研究熱點和方案設(shè)計。
空間轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用有哪些?一、構(gòu)建空間轉(zhuǎn)錄組圖譜:借助于空間分辨的單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué),建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結(jié)構(gòu)的重要步驟。目前的多項研究通過單細胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄技術(shù),得到多個***的時空轉(zhuǎn)錄組圖譜(相關(guān)研究后續(xù)會在如下專輯更新)。二、描繪胚胎發(fā)育和空間藍圖:胚胎發(fā)育是一個復(fù)雜的過程,其中動態(tài)變化在生物分子水平上迅速發(fā)生。對這種微觀變化的時間和空間方面的分析都具有挑戰(zhàn)性。預(yù)期使用空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)可以表征胚胎發(fā)育的空間表達藍圖。研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦,而其他***(例如肝臟)的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究相對滯后。重慶歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組是什么
了解空間轉(zhuǎn)錄組樣本準備注意事項。上海空間轉(zhuǎn)錄組報價
轉(zhuǎn)錄本的空間位置信息可以通過在原位陣列上捕獲的組織切片中的轉(zhuǎn)錄本來獲取,目前已有多種技術(shù)策略被開發(fā)報道, 如空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)(Spatial Transcriptomics,ST)和 Visium 技術(shù),通過將包含空間位置信息的條形碼、UMI 標簽、poly-dT 的探針固定在商用微陣列載玻片上,來捕獲包含 poly(A) 尾巴的轉(zhuǎn)錄本,并獲取全轉(zhuǎn)錄組水平的基因表達及位置信息。一些無需成像即可計算重建空間基因表達模式所需信息的技術(shù)也被開發(fā)了出來,其中之一就是是 DNA 顯微技術(shù),它記錄 cDNA 之間的接近度,該信息可用于重建轉(zhuǎn)錄本之間的相對位置。上??臻g轉(zhuǎn)錄組報價
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司坐落在聯(lián)航路1188號25幢,是一家專業(yè)的檢驗檢測服務(wù)。(依法須經(jīng)批準的項目,經(jīng)相關(guān)部門批準后方可開展經(jīng)營活動,具體經(jīng)營項目以相關(guān)部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。公司。公司目前擁有專業(yè)的技術(shù)員工,為員工提供廣闊的發(fā)展平臺與成長空間,為客戶提供高質(zhì)的產(chǎn)品服務(wù),深受員工與客戶好評。公司業(yè)務(wù)范圍主要包括:科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢等。公司奉行顧客至上、質(zhì)量為本的經(jīng)營宗旨,深受客戶好評。公司力求給客戶提供全數(shù)良好服務(wù),我們相信誠實正直、開拓進取地為公司發(fā)展做正確的事情,將為公司和個人帶來共同的利益和進步。經(jīng)過幾年的發(fā)展,已成為科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢行業(yè)出名企業(yè)。