歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組價格

來源: 發(fā)布時間:2021-11-03

如果只是通過空間轉(zhuǎn)錄組或者單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,研究人員在兩個樣本中均可以發(fā)現(xiàn)淋巴細(xì)胞相關(guān)基因或者淋巴細(xì)胞群,無法解釋兩個樣本預(yù)后之間的差異。但是通過空間轉(zhuǎn)錄組,就能很清晰看到兩個樣本之間的差異。作者借助空間轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)探究人類心臟在發(fā)育過程中的基因表達(dá)特征和細(xì)胞圖譜變化,發(fā)現(xiàn)對于每個發(fā)育階段的不同解剖區(qū)域,都有獨特的基因表達(dá)特征。結(jié)合單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),作者進(jìn)一步確定和豐富了胚胎心臟基因表達(dá)的空間注釋信息。 了解空間轉(zhuǎn)錄組樣本準(zhǔn)備注意事項。歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組價格

 **近,空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究炙手可熱。細(xì)胞及其在組織樣本中的相對位置之間的關(guān)系對于理解疾病病理可能至關(guān)重要。空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)是一項開創(chuàng)性的技術(shù),它使科學(xué)家能夠測量組織樣本中的所有基因活性,并繪制出發(fā)生該活性的位置的圖。該技術(shù)已經(jīng)導(dǎo)致了新發(fā)現(xiàn),這些新發(fā)現(xiàn)將有助于幫助科學(xué)家更好地了解生物過程和疾病。10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)可以應(yīng)用于**、免疫、發(fā)育、神經(jīng)和病理等研究方向。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,致力通過質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。浙江歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組做什么空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)重點為特殊的載玻片。

Visium空間轉(zhuǎn)錄組能夠做何種組織類型以及推薦切片厚度是什么?10X Genomics測試過很多組織類型,絕大多數(shù)都可以用于空間轉(zhuǎn)錄組的分析。下圖是他們官網(wǎng)上測試過的組織類型的列表,測試過的組織都可以運用在空間轉(zhuǎn)錄組的分析上面。但建議用戶用基因表達(dá)玻片做正式實驗前,務(wù)必用組織優(yōu)化的玻片測試一下,看組織能否用于空間轉(zhuǎn)錄組的實驗,同時也找到比較好的組織通透時間。切片厚度基本上以10μm為主,但也有少量組織例外。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項目執(zhí)行經(jīng)驗,致力通過質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。

空間轉(zhuǎn)錄組(Spatial Transcriptomics)就是將基因的表達(dá)情況與關(guān)注的組織切片的免疫化學(xué)染色圖像進(jìn)行整合,從而將組織內(nèi)不同細(xì)胞的基因表達(dá)信息定位到組織的原始空間位置上去,進(jìn)而直接觀測組織中不同部位功能區(qū)基因表達(dá)的差異??臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)利用了常規(guī)的原位技術(shù)和組學(xué)技術(shù)兩方面的優(yōu)勢。目前已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有主要有 Spatial Transcriptomics, Slide-seq, LCM-seq, seqFISH, MERFISH, Liver single cell zonation, Geo-seq 和 Tomo-seq, 涉及物種有人、小鼠、果蠅、秀麗隱桿線蟲、斑馬魚、擬南芥、楊樹和云杉等??臻g轉(zhuǎn)錄組組織學(xué)板塊包括樣品的包埋、切片、固定、染色及成像,記錄切片的形態(tài)學(xué)信息。

第二,數(shù)據(jù)庫的建立。盡管當(dāng)前空間轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)在快速地增長,但尚未有對應(yīng)的數(shù)據(jù)庫來對這些數(shù)據(jù)進(jìn)行匯總集成。第三,研究物種及組織的多樣化。在當(dāng)前時代,除 LCM 之外,研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦,而其他***(例如肝臟)的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究相對滯后。對除人類和小鼠以外的其他生物以及除大腦以外的其他***的技術(shù)現(xiàn)代化,將為開發(fā)有用的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)地圖集提供廣闊的前景。第四,集成度高、交互性強(qiáng)、易擴(kuò)展、文檔信息完善的開源工作流程的開發(fā)。該類工具的開發(fā)將簡化不同類型空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)的整合和分析。對于 EDA 以外的任務(wù),用戶仍然經(jīng)常需要學(xué)習(xí)新的語法,轉(zhuǎn)換對象類型,空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)仍然面臨許多挑戰(zhàn)。山西歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組

許多當(dāng)前時代空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的基礎(chǔ)都是在自七十年代以來的幾十年間建立的。歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組價格

早期空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的另一條發(fā)展路線是基因捕獲和增強(qiáng)子捕獲篩選,開發(fā)于二十世紀(jì)八十年代,當(dāng)時 DNA 測序通量正在增加,動物基因組是新開放的前沿領(lǐng)域。果蠅和小鼠的篩選是在八十年代后期進(jìn)行的,目的是觀察未靶向且通常未知的基因表達(dá)情況。隨著通量的增加,增強(qiáng)子和基因捕獲技術(shù)在九十年代成為空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的技術(shù),直到 WMISH 在九十年代后期興起。WMISH 技術(shù)的自動化程度較高,避免了對轉(zhuǎn)基因品系的依賴,同時由于在二十一世紀(jì)初獲得物種的參考基因組信息變得越來越便利,探針設(shè)計因此也更為方便。歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組價格

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