代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究:2022年2月,中國(guó)海洋大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院劉尊英教授課題組在《Foods》期刊發(fā)表的題為“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)植物乳孢桿菌可以通過(guò)AI-2/luxs介導(dǎo)的群體感應(yīng)(QS)系統(tǒng)來(lái)調(diào)節(jié)其生長(zhǎng)特性和代謝,該系統(tǒng)是參與食品安全的正調(diào)控因子,這將有助于研究植物乳孢桿菌的生物保護(hù)控制潛力,特別是在食品工業(yè)生物技術(shù)中的應(yīng)用。代謝組學(xué)熱圖聚類分析 火山圖 散點(diǎn)圖如何繪制。江蘇代謝組學(xué) 定性定量
代謝組學(xué)等多組學(xué)研究,2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文,通過(guò)基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對(duì)262例肝內(nèi)膽管*(iCCA)患者的配對(duì)**和*旁組織進(jìn)行了分析,通過(guò)繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進(jìn)一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機(jī)制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。江蘇代謝組學(xué) 定性定量代謝組學(xué)暨多元變量統(tǒng)計(jì)分析研究。
土壤代謝組學(xué):銀納米顆粒(AgNPs)是使用*****的工程納米材料之一,泄露可能導(dǎo)致顆粒在土壤中積累,并對(duì)環(huán)境造成未知風(fēng)險(xiǎn)。有報(bào)告指出AgNPs可能通過(guò)影響根系分泌物間接對(duì)微生物群落功能和基因組多樣性產(chǎn)生***影響,但對(duì)其機(jī)理了解甚少。土壤代謝物可作為土壤微生物群落變化的表型特征,但當(dāng)前有關(guān)NPs暴露對(duì)土壤微生物群落影響的研究不包括對(duì)土壤代謝產(chǎn)物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改變的土壤微生物群相關(guān)信息,鑒于它們的已知功能,人們可以對(duì)土壤生物化學(xué)的變化提出合理假設(shè)。本文作者利用16S rRNA基因測(cè)序和非靶向代謝組學(xué)方法,研究了AgNPs對(duì)土壤微生物群落的長(zhǎng)期影響。
代謝組學(xué)研究,2021年12月威爾康奈爾醫(yī)學(xué)中心和紀(jì)念斯隆凱特琳**中心的Linda T. Vahdat 和 Vivek Mittal教授課題組在Nature Communications期刊發(fā)表的題為 “Copper depletion modulates mitochondrial oxidative phosphorylation to impair triple negative breast cancer metastasis”的研究成果,通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了高度轉(zhuǎn)移性 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞的離散亞群表現(xiàn)出細(xì)胞內(nèi)銅水平升高特征,探究了TM 介導(dǎo)的復(fù)合物 IV 失活確定為 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞群中的主要代謝缺陷,AMPK/mTORC1 能量傳感器為重要的下游途徑。描繪了銅-代謝-轉(zhuǎn)移軸,為高風(fēng)險(xiǎn)三陰性乳腺*患者的下一代治療方法提供了理論依據(jù)。讀懂代謝組學(xué) 代謝組學(xué)的研究范疇。
雙平臺(tái)代謝組學(xué)研究,2022年02月,中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院廣安門醫(yī)院李敏教授課題組在Biomedicine & Pharmacotherapy發(fā)表的題為 “Yiqi Tongluo Fang could preventive and delayed development and formation of diabetic retinopathy through antioxidant and anti-inflammatory effects ”的研究成果,發(fā)現(xiàn)了***通絡(luò)方可有效地防治糖尿病并發(fā)癥形成與發(fā)展,探究了***通絡(luò)方防治糖尿病視網(wǎng)膜病變的作用機(jī)制,***通絡(luò)方可改善糖尿病大鼠視網(wǎng)膜組織病理?yè)p害;提高視網(wǎng)膜緊密連接蛋白,保護(hù)血-視網(wǎng)膜屏障;抑制p38MAPK相關(guān)通路及IncRNA MALAT1水平;降低全身及局部視網(wǎng)膜的炎癥及氧化應(yīng)激水平。為***通絡(luò)方防治糖尿病視網(wǎng)膜病變提供了實(shí)驗(yàn)依據(jù)。LC-MS+GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)主要用于***的中藥成分分析。代謝組學(xué)四大公司 代謝組學(xué)一般研究方法及步驟代謝組學(xué)分析流程。浙江腸內(nèi)容物代謝組學(xué)
非靶向代謝組學(xué),靶向代謝組學(xué)研究經(jīng)驗(yàn)。江蘇代謝組學(xué) 定性定量
本研究通過(guò)LC-MS和GC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)研究方法,對(duì)92例樣品5個(gè)時(shí)間點(diǎn)的尿液樣品進(jìn)行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關(guān)的差異標(biāo)志物,結(jié)果揭示了年輕健康人在五個(gè)不同時(shí)間點(diǎn)的尿液代謝譜的動(dòng)態(tài)變化,采用KEGG通路富集分析和時(shí)間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關(guān)的幾種潛在代謝物生物標(biāo)志物,發(fā)現(xiàn)短期高濃度暴露于PM可能會(huì)導(dǎo)致代謝改變并降低應(yīng)激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質(zhì)軸的***有關(guān);而生物氣溶膠劑則通過(guò)***系統(tǒng)對(duì)病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標(biāo)志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標(biāo)志物,可用于分別預(yù)測(cè)或診斷PM或生物氣溶膠相關(guān)疾病。江蘇代謝組學(xué) 定性定量
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