土壤代謝物可以間接反映微生物代謝過程的變化,使用基于GC-MS的非靶向代謝組學(xué),在土壤樣品***鑒定272種代謝物并對其進行非靶向代謝組學(xué)定量,定量結(jié)果表明AgNPs暴露***改變了土壤代謝物的分布。通過參數(shù)VIP>1.5,在土壤中鑒定出20種具有重要變化的代謝物(圖3I),除少數(shù)幾個代謝物上調(diào),大多數(shù)代謝物減少,表明AgNPs暴露通常會對土壤微生物的代謝產(chǎn)生負(fù)面影響。土壤代謝組學(xué)可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上應(yīng)對AgNPs并作出反應(yīng),包括毒性機制和***策略。代謝組學(xué)熱圖聚類分析 火山圖 散點圖如何繪制。北京代謝組學(xué)藥物靶點
代謝組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究:2022年2月,中國海洋大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院劉尊英教授課題組在《Foods》期刊發(fā)表的題為“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果,通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和代謝組學(xué)等研究方法,發(fā)現(xiàn)植物乳孢桿菌可以通過AI-2/luxs介導(dǎo)的群體感應(yīng)(QS)系統(tǒng)來調(diào)節(jié)其生長特性和代謝,該系統(tǒng)是參與食品安全的正調(diào)控因子,這將有助于研究植物乳孢桿菌的生物保護控制潛力,特別是在食品工業(yè)生物技術(shù)中的應(yīng)用。北京樣本代謝組學(xué)非靶向代謝組學(xué) 土壤非靶向代謝組學(xué) 脂質(zhì)組學(xué)研究。
糞便代謝組分析,中文標(biāo)題:二烯丙基二硫化物(DADS)通過調(diào)節(jié)腸道微生物群和代謝物來保護小鼠腸道及改善白色念珠菌***研究對象:小鼠糞便發(fā)表期刊:FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology影響因子:5.293發(fā)表時間:2022年1月7日合作單位:復(fù)旦大學(xué)上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學(xué)科運用生物技術(shù):糞便代謝組分析(由鹿明生物提供技術(shù)支持)、微生物16SrRNA測序。文章通過建立DSS 誘導(dǎo)的腸道白色念珠菌小鼠模型,模擬人類腸道******。一方面證實了白色念珠菌可以增強 DSS 結(jié)腸炎的嚴(yán)重程度,另一方面通過微生物組學(xué)和代謝組學(xué)等手段確認(rèn)了 DADS ***可以改善腸道生態(tài)失調(diào)(改變腸道微生物群和代謝物)、腸道通透性和全身炎癥反應(yīng)。深入了解 DADS ***的效果可能會為腸道白色念珠菌***提供新的***策略。
LC-MS非靶向代謝組學(xué)研究方法,2021年11月,寧波大學(xué)海洋科學(xué)學(xué)院王春琳團隊在Frontiers in Marine Science期刊發(fā)表了題為“Metabolic Changes in Scylla paramamosain During Adaptation to an Acute Decrease in Salinity”的研究成果,通過LC-MS非靶向代謝組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了氨基酸和能量代謝是參與青蟹適應(yīng)鹽度變化的主要因素,而脂質(zhì)代謝物起輔助作用。中文標(biāo)題:青蟹在適應(yīng)鹽度急劇下降過程中的代謝變化研究對象:青蟹發(fā)表期刊:FrontiersinMarineScience影響因子:4.912發(fā)表時間:2021年11月2日合作單位:寧波大學(xué)應(yīng)用海洋生物技術(shù)教育部重點實驗室運用生物技術(shù):LC-MS非靶向代謝組(由鹿明生物提供技術(shù)支持)3分鐘帶你看懂代謝組學(xué)研究。
土壤代謝組學(xué):銀納米顆粒(AgNPs)是使用*****的工程納米材料之一,泄露可能導(dǎo)致顆粒在土壤中積累,并對環(huán)境造成未知風(fēng)險。有報告指出AgNPs可能通過影響根系分泌物間接對微生物群落功能和基因組多樣性產(chǎn)生***影響,但對其機理了解甚少。土壤代謝物可作為土壤微生物群落變化的表型特征,但當(dāng)前有關(guān)NPs暴露對土壤微生物群落影響的研究不包括對土壤代謝產(chǎn)物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改變的土壤微生物群相關(guān)信息,鑒于它們的已知功能,人們可以對土壤生物化學(xué)的變化提出合理假設(shè)。本文作者利用16S rRNA基因測序和非靶向代謝組學(xué)方法,研究了AgNPs對土壤微生物群落的長期影響。讀懂代謝組學(xué) 代謝組學(xué)的研究范疇。江蘇代謝組學(xué)和脂質(zhì)組學(xué)
代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)庫,代謝組分析,基因檢測。北京代謝組學(xué)藥物靶點
代謝組學(xué)經(jīng)典研究:本篇小鹿將為各位看官推薦4篇使用代謝組學(xué)的經(jīng)典研究,***篇文章運用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學(xué)探究番茄果實成熟過程中的代謝變化。第二篇文章運用16S rRNA測序+代謝組學(xué)技術(shù)研究不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環(huán)境的機制。第三篇文章運用GC-MS頂空代謝組學(xué)探究新等位基因系和野生型的成熟種子中發(fā)現(xiàn)了幾種不同的揮發(fā)性化合物。第四篇文章運用GC-MS非靶向代謝組學(xué)技術(shù)對對全氟辛酸(PFOA)暴露土壤栽培的黃瓜組織代謝途徑變化進行了研究。北京代謝組學(xué)藥物靶點
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