山西空間代謝組學(xué)公司

質(zhì)譜成像（Mass Spectrometry Imaging, MSI）作為一種新型的分子影像技術(shù)，能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對于其他成像方法（如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等），該技術(shù)無需化學(xué)或放射性標(biāo)記、不需復(fù)雜樣品前處理，具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析，結(jié)合生物信息學(xué)分析，發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法，可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物，并識別其生物學(xué)功能?？臻g代謝組學(xué),代謝組數(shù)據(jù)如何分析。山西空間代謝組學(xué)公司

在空間上的代謝變化表明，在東莨菪堿***后，大鼠腦微區(qū)的代謝網(wǎng)絡(luò)發(fā)生紊亂。但是代謝物和代謝酶是代謝網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵因素，基于空間分辨的代謝組學(xué)信息為發(fā)現(xiàn)酶或基因異常提供了線索，但若要完成完整的代謝網(wǎng)絡(luò)分析必須進(jìn)一步驗(yàn)證蛋白質(zhì)和基因表達(dá)水平。本文作者開發(fā)了一種空間分辨代謝網(wǎng)絡(luò)作圖方法，通過無需衍生化、特定標(biāo)記或復(fù)雜樣品預(yù)處理的高通量AFADESI-MSI方法和代謝組學(xué)策略，在具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)化腦組織中發(fā)現(xiàn)代謝分子變化。能檢測出多種極性內(nèi)源性代謝物，并繪制相關(guān)代謝網(wǎng)絡(luò)，提供組織微區(qū)分布的圖譜。還將多種功能性小分子（例如核苷酸、多胺、肌酸、神經(jīng)酰胺代謝物）含量分布可視化。山西空間代謝組學(xué)公司空間代謝組學(xué):一種高靈敏、高覆蓋質(zhì)譜成像技術(shù)新技術(shù)。

通過空間代謝組學(xué)測量了四種轉(zhuǎn)基因小鼠模型（肺*（LC）、RCC、HCC和T-ALL）中甘油磷脂（GPs）的含量，發(fā)現(xiàn)在不同的**中，MYC誘導(dǎo)改變了磷酸酰甘油（PGs）的豐度（圖 4A），能夠增加了大多數(shù)PG物質(zhì)。MYC失活后，PG豐度恢復(fù)到基礎(chǔ)水平（圖 4B）。PGs由磷脂酸(PA)通過向3-磷酸甘油中添加兩種FA形成，因此，PG誘導(dǎo)可以建立在MYC促進(jìn)的FA增加的基礎(chǔ)上。然而，在體內(nèi)PGs相對于其他GPs的相對優(yōu)先合成，這意味著MYC有除FA合成之外的其他方式調(diào)節(jié)脂肪生成。

空間代謝組學(xué)能夠在復(fù)雜的EA微環(huán)境中區(qū)分組織類型，本文作者使用兩個(gè)隊(duì)列對食管腺*的甘油磷脂特征進(jìn)行了表征。**初運(yùn)用空間代謝組學(xué)對連續(xù)患者的成對手術(shù)切除活檢(EA和MHEE)進(jìn)行甘油磷脂差異分析；（樣本策略）選擇這種取樣方法的目的是為了進(jìn)行手術(shù)切緣分析，并通過取樣更大的樣本來克服**的區(qū)域代謝組學(xué)差異。接下來，采用內(nèi)窺鏡活檢對第二組人群進(jìn)行采樣。這樣就可以從健康的志愿者和Barrett化***育不良的患者身上獲得標(biāo)本。這樣還使作者能夠驗(yàn)證***個(gè)隊(duì)列的發(fā)現(xiàn)，調(diào)查該技術(shù)在小樣本上的表現(xiàn)，并演示在內(nèi)鏡套件中促進(jìn)診斷的第二次臨床應(yīng)用?？臻g代謝組具有覆蓋范圍廣,靈敏度高,動態(tài)范圍寬。

空間代謝組學(xué)研究作者對P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系（BCL）進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析，發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表達(dá)，在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*（HCC）、急性白血?。═-ALL）和腎細(xì)胞*（RCC）的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結(jié)合并啟動mRNA轉(zhuǎn)錄，如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用，作者首先，對這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析，證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結(jié)合（圖1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達(dá)，但不降低MYC基因的表達(dá)。其次，ChIP的MYC與啟動子結(jié)合，不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達(dá)，還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達(dá)。因此，MYC似乎會依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因：首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺，然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過RNA測序（RNA-seq）發(fā)現(xiàn)，增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法。山西空間代謝組學(xué)公司

空間代謝組學(xué)-靶向代謝組學(xué)服務(wù)-擅長多組學(xué)聯(lián)合分析。山西空間代謝組學(xué)公司

本篇小鹿分享一篇空間代謝組學(xué)專業(yè)應(yīng)用技術(shù)文章，探究空間代謝組學(xué)如何進(jìn)行前列腺*診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物的差異研究？該研究發(fā)現(xiàn)了前列腺*樣本中的特定組織區(qū)室的不同代謝特征，確定了幾種可能被進(jìn)一步開發(fā)為前列腺*的診斷和預(yù)后生物標(biāo)志物的差異代謝物和脂質(zhì)。空間代謝組學(xué)能夠快速提供代謝物的水平差異和空間信息，是臨床上有潛力的創(chuàng)新診斷工具。免標(biāo)記、無需基質(zhì)噴涂、周期短、定位準(zhǔn)是AFADESI空間代謝組技術(shù)的主要特點(diǎn)。該技術(shù)作為一種新型的分子影像技術(shù)，能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個(gè)維度的信息。山西空間代謝組學(xué)公司

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