蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾自下而上分析策略:常用的糖蛋白分離和富集技術(shù)有:a. 凝集素親和技術(shù);b. 肼化學(xué)富集;c. 親水性相互作用色譜法;d. β-消除/邁克爾加成反應(yīng)?;谫|(zhì)譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點測定方法有:a. PNGase F酶法;b. Endo H酶法;c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化:泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽,在真核生物中高度保守,可通過異肽鍵與目標(biāo)蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標(biāo)記,泛素用親和標(biāo)簽(通常為6xHis)進行標(biāo)記,并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結(jié)構(gòu),經(jīng)胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上,使肽的質(zhì)量增加114,因此可作為泛素定位位點的質(zhì)量標(biāo)記。用HPLC對樣品進行預(yù)分離,使用針對特定殘留結(jié)構(gòu)的抗體富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質(zhì)譜可以鑒定泛素化位點。自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。山東蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)費用
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾分析:組蛋白是一類高度保守的蛋白質(zhì),是染色質(zhì)的關(guān)鍵成分,是DNA包裝的結(jié)構(gòu)單位。組蛋白的功能受其翻譯后修飾介導(dǎo)。組蛋白翻譯后修飾包括通過絲氨酸或蘇氨酸殘基的磷酸化,賴氨酸或精氨酸的甲基化,賴氨酸的乙?;兔撘阴;?,賴氨酸的泛素化和磺?;葘M蛋白進行的共價修飾。組蛋白這些修飾對于核完整性至關(guān)重要,因為它們可以調(diào)節(jié)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)并募集參與基因調(diào)節(jié)、DNA修復(fù)和染色體濃縮的酶。組蛋白的翻譯后修飾大多位于N末端的尾巴上,因為N末端是蛋白質(zhì)中比較暴露和比較靈活的區(qū)域。分析組蛋白翻譯后修飾有助于探索組蛋白修飾與染色體濃縮、DNA轉(zhuǎn)錄等生物功能之間的關(guān)系。南京丙二?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)服務(wù)通過蛋白質(zhì)翻譯后修飾也進一步增加了細胞通路機制和生命活動的多樣性和復(fù)雜性。
蛋白磷酸化修飾過程:蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化,將磷酸基團從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸,或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過程是可逆的,去磷酸化反應(yīng)由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測方法:Western Blot檢測方法:Western Blot是檢測蛋白磷酸化水平的常用方法,主要過程為先利用SDS-PAGE分離蛋白質(zhì),隨后將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,然后使用特異性識別磷酸化蛋白的抗體來鑒定目標(biāo)蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修飾的蛋白才會在相應(yīng)分子質(zhì)量的地方顯現(xiàn)特異性蛋白條帶。
蛋白磷酸化檢測方法:一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢:1. WB方法簡便,多數(shù)實驗室具備Western Blot設(shè)備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏,能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白,可以先通過IP使用目標(biāo)蛋白的抗體對目標(biāo)蛋白進行富集,再進行WB檢測被磷酸化的蛋白,檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質(zhì)譜檢測方法:Western Blot的方法雖然簡便,但是對于大規(guī)模分析復(fù)雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質(zhì)譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準(zhǔn)確度質(zhì)譜儀,如今快速準(zhǔn)確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠,或者2D-PAGE膠等分離目標(biāo)蛋白,將含有目標(biāo)蛋白的條帶切下,胰酶消化,LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應(yīng)位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標(biāo)蛋白的磷酸化水平。蛋白質(zhì)磷酸化修飾的免疫印跡技術(shù)優(yōu)點:檢測特異性高。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質(zhì)組研究的大部分工作集中在細胞生長的不同時期,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質(zhì)表達水平的變化。然而,許多生命過程不只受蛋白質(zhì)的相對豐度控制,還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制。因此,揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質(zhì)復(fù)雜性和多樣的生物學(xué)功能的前提。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾是一個復(fù)雜的過程。目前,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。樣品中翻譯后修飾蛋白質(zhì)含量低、動態(tài)范圍廣給相關(guān)研究帶來了很大的挑戰(zhàn)?;诜g后修飾蛋白的異質(zhì)性和相對豐度低的特點,主要利用凝膠、生物質(zhì)譜和生物信息學(xué)工具對其進行研究。用于PTM分析的質(zhì)譜方法類似于用于“常規(guī)”蛋白質(zhì)鑒定的方法,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白質(zhì)組學(xué)分析。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有簡單的特性。四川磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域
蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有有效性。山東蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)費用
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué):蛋白質(zhì)翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團,可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì),進而影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和活性狀態(tài)、亞細胞定位、折疊及其穩(wěn)定性以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的豐度變化在生命活動研究中具有重大意義,異常的翻譯后修飾會導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生。質(zhì)譜可以分辨蛋白質(zhì)修飾前和修飾后分子量上的變化,因此只要知道靶蛋白翻譯后修飾前后分子量的變化,就能對翻譯后修飾方式進行鑒定和定量。山東蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)費用
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