蛋白質(zhì)組學(xué)，指對(duì)某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì)及其特征進(jìn)行大規(guī)模、系統(tǒng)化地研究，以期望在蛋白質(zhì)水平上解釋控制復(fù)雜的生命活動(dòng)的分子網(wǎng)絡(luò)。研究的內(nèi)容主要包括：組成蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)氨基酸的序列特征、蛋白質(zhì)的豐度、蛋白質(zhì)活性、蛋白質(zhì)的修飾、亞細(xì)胞定位和三維結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)之間的相互作用以及對(duì)蛋白質(zhì)的高階復(fù)合物結(jié)構(gòu)。質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展為這些研究提供了有力的技術(shù)支撐，使得許多有實(shí)際應(yīng)用的蛋白質(zhì)組功能研究成為可能，包括翻譯后修飾的整體分析，蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的重建和模式生物蛋白表達(dá)譜的定量研究；在臨床醫(yī)學(xué)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中也越來(lái)越多地應(yīng)用到蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)。iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù)。濟(jì)南Label free非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究?jī)?nèi)容
定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法學(xué)介紹：iTRAQ：iTRAQ定量是目前定量蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用比較普遍的技術(shù)，該技術(shù)的關(guān)鍵原理是多肽標(biāo)記和定量，將多肽的含量轉(zhuǎn)化為114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8標(biāo)記)，從而簡(jiǎn)化了定量的復(fù)雜性，然后通過(guò)多肽定量值回歸到蛋白的定量值，從而測(cè)定出不同樣本之間蛋白質(zhì)的差異。iTRAQ定量不依賴(lài)樣本，可檢測(cè)出較低豐度蛋白，胞漿蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等，且定量準(zhǔn)確，可同時(shí)對(duì)8個(gè)樣本進(jìn)行分析，并可同時(shí)得出鑒定和定量的結(jié)果，特別適用于采用多種處理方式或來(lái)自多個(gè)處理時(shí)間的樣本的差異蛋白分析。蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)多少錢(qián)蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征。
蛋白組學(xué)技術(shù)：質(zhì)譜技術(shù)相較于傳統(tǒng)蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)而言，擁有靈敏、準(zhǔn)確、高通量、自動(dòng)化等特點(diǎn)。質(zhì)譜鑒定蛋白質(zhì)的基本原理是先將樣品分子離子化，然后根據(jù)不同離子之間的質(zhì)荷比差異來(lái)分離并確定蛋白質(zhì)的相對(duì)分子質(zhì)量。根據(jù)蛋白質(zhì)酶解后所得到的肽質(zhì)量指紋圖譜、肽序列標(biāo)簽、和肽階梯序列去檢索蛋白質(zhì)或核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)，質(zhì)譜技術(shù)可達(dá)到對(duì)蛋白質(zhì)的快速鑒定和高通量篩選。因產(chǎn)生離子的方法不同而發(fā)展起來(lái)的質(zhì)譜包括基質(zhì)輔助激光解吸離子化質(zhì)譜、電噴霧離子化質(zhì)譜、表面增強(qiáng)激光解吸離子化質(zhì)譜等。
蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)展趨勢(shì)：1、基礎(chǔ)研究方面：近兩年來(lái)蛋白質(zhì)組研究技術(shù)已被應(yīng)用到各種生命科學(xué)領(lǐng)域，如細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)等。在研究對(duì)象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動(dòng)物等范圍，涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象，如信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。在未來(lái)的發(fā)展中，蛋白質(zhì)組學(xué)的研究領(lǐng)域?qū)⒏悠毡椤?、應(yīng)用研究方面：蛋白質(zhì)組學(xué)將成為尋找疾病分子標(biāo)記和藥物靶標(biāo)比較有效的方法之一。在對(duì)早老性癡呆等人類(lèi)重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質(zhì)組技術(shù)也有十分誘人的前景，目前國(guó)際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究。有很多蛋白質(zhì)組學(xué)的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進(jìn)行相關(guān)研究和日常工作。
蛋白組究竟研究的是什么呢？第1，蛋白質(zhì)定性，或者說(shuō)大規(guī)模檢測(cè)某些蛋白質(zhì)是否存在于樣品當(dāng)中；第2，蛋白質(zhì)定量，也就是大規(guī)模檢測(cè)某些蛋白質(zhì)的含量（包括一定含量與相對(duì)含量）；第3，蛋白質(zhì)翻譯后修飾，這些修飾主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙酰化等等，也包括對(duì)這些翻譯后修飾的定量研究。這三大塊中所提到的大規(guī)模，既可以是樣品數(shù)量的大規(guī)模高通量，也可以是少量樣本中蛋白數(shù)量的大規(guī)模高通量。研究原因：首先，由于翻譯調(diào)控和翻譯后調(diào)控的存在，RNA的表達(dá)量與實(shí)際對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的含量相關(guān)性并不高，就簡(jiǎn)單地測(cè)試了酵母中mRNA和對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)的定量相關(guān)性，結(jié)果是，低豐度蛋白與mRNA的相關(guān)性尤其低，而高豐度蛋白和其mRNA的相關(guān)性則高，經(jīng)過(guò)平均后r值只為0.4。目前國(guó)際上許多大型藥物公司正投入大量的人力和物力進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)方面的應(yīng)用性研究。山東蛋白質(zhì)組學(xué)一般流程
蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有生物質(zhì)譜。濟(jì)南Label free非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究?jī)?nèi)容
PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)：產(chǎn)品分類(lèi)：a.相對(duì)定量(目的同WB)。b.一定定量(目的同Elisa)。技術(shù)優(yōu)勢(shì)：（1）無(wú)需抗體，可直接對(duì)樣本中目標(biāo)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量分析。（2）高特異性、準(zhǔn)確度和靈敏度，靶向檢測(cè)目標(biāo)蛋白對(duì)應(yīng)的多個(gè)unique肽段。（3）通量高，可以同時(shí)實(shí)現(xiàn)幾十個(gè)蛋白的定量檢測(cè)。樣本要求：動(dòng)物及臨床組織標(biāo)本100mg/sample，血清、血漿200μL/sample，細(xì)胞、微生物1×107cells/sample。應(yīng)用方向：驗(yàn)證修飾和非修飾定量蛋白組學(xué)結(jié)果；目標(biāo)蛋白相對(duì)定量和一定定量分析。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時(shí)代的科學(xué)研究，針對(duì)基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)與定量。濟(jì)南Label free非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究?jī)?nèi)容
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