浙江定量N糖基化蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容

蛋白質(zhì)組學主要以全蛋白組（組織、細胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象，通過對蛋白組進行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學功能、作用機制、疾病診斷的標志物以及預(yù)測蛋白的上、下游變化關(guān)系。蛋白質(zhì)組學可以克服核酸水平預(yù)測的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。常用技術(shù)：非靶向蛋白組學：蛋白質(zhì)定性（膠條鑒定和溶液鑒定），高通量定量蛋白組（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽組學。蛋白質(zhì)組學技術(shù)有生物質(zhì)譜。浙江定量N糖基化蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容

蛋白質(zhì)組學發(fā)展趨勢：技術(shù)發(fā)展方面：蛋白質(zhì)組學的研究方法將出現(xiàn)多種技術(shù)并存，各有優(yōu)勢和的特點，而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外，更強調(diào)各種方法間的整合和互補，以適應(yīng)不同蛋白質(zhì)的不同特征。另外，蛋白質(zhì)組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要，這種交叉是新技術(shù)新方法的活水之源，特別是，蛋白質(zhì)組學與其它大規(guī)?？茖W如基因組學，生物信息學等領(lǐng)域的交叉，構(gòu)成組學（omics）生物技術(shù)研究方法，所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學（SystemBiology）研究模式，將成為未來生命科學比較令人激動的新前沿。廣東Label free多肽組學研究蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別。

PRM靶向蛋白質(zhì)組學：是一種基于Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù)，首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標肽段的母離子，隨后在collisioncell中對母離子進行碎裂，然后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣能夠?qū)δ繕说鞍踪|(zhì)、目標肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，即可對目標蛋白質(zhì)/肽段進行相對(一定)定量。從而實現(xiàn)對復(fù)雜樣本中的目標蛋白質(zhì)/肽段進行準確地特異性分析。

常規(guī)蛋白質(zhì)組學：Labelfree多肽組學：顧名思義，就是不使用任何標記方法，直接對肽段進行質(zhì)譜鑒定和定性定量分析。實驗流程簡單，只需要對蛋白進行常規(guī)酶解和除鹽步驟即可上機。定量方式分為兩種：峰面積（Peakintensity）和峰計數(shù)（Spectralcount），常用的是峰面積。不過，由于質(zhì)譜采集時只選取topN的母離子進行二級碎裂和MS2檢測，所以會丟失一些豐度較低的肽段信息，缺失值比較多。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學：TMT全稱是TandemMassTag，是經(jīng)典化學標記試劑，普遍用于差異表達蛋白質(zhì)組分析研究中。該技術(shù)采用6重、10重或16重同位素標簽，與肽段的氨基發(fā)生共價結(jié)合反應(yīng)，可實現(xiàn)同時對6個/10個/16個不同樣品中蛋白質(zhì)的定性和定量分析。（目前16標鹿明生物可提供技術(shù)服務(wù)）。蛋白質(zhì)組學是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學。

蛋白質(zhì)組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質(zhì)基礎(chǔ)，也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質(zhì)組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質(zhì)分子”，它們可成為新藥物設(shè)計的分子靶點，或者也會為疾病的早期診斷提供分子標志。確實，那些世界范圍內(nèi)銷路比較好的藥物本身是蛋白質(zhì)或其作用靶點為某種蛋白質(zhì)分子。因此，蛋白質(zhì)組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。蛋白質(zhì)組學的研究是生命科學進入后基因時代的特征。生物質(zhì)譜技術(shù)是蛋白質(zhì)組學研究中比較重要的鑒定技術(shù)。浙江定量N糖基化蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容

蛋白質(zhì)組學包括翻譯后的修飾。浙江定量N糖基化蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容

蛋白組學研究怎么做？PRM:平行反應(yīng)監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù)，能夠?qū)δ繕说鞍踪|(zhì)、目標肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，從而實現(xiàn)對目標蛋白質(zhì)/肽段進行一定定量，因此也被稱之為基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的WesternBlot（LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB）。PRM技術(shù)基于Q-Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜平臺，首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標肽段的母離子，隨后在Collisioncell中對母離子進行碎裂，之后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣即可對復(fù)雜樣本中的目標蛋白質(zhì)/肽段進行準確地特異性分析。浙江定量N糖基化蛋白質(zhì)組學研究內(nèi)容

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