蛋白質(zhì)乙?；揎楄b定流程：1. 組織/細(xì)胞破碎，提取、提純目的蛋白質(zhì)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特異性乙?；贵w對乙酰化修飾肽段進(jìn)行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS對富集的乙酰化肽段進(jìn)行鑒定分析。5. 數(shù)據(jù)分析，并對鑒定的乙酰化位點(diǎn)的生物學(xué)功能進(jìn)行解釋預(yù)測。隨著蛋白質(zhì)組研究的發(fā)展，我們越來越深刻地意識到，對于生物體生命活動(dòng)的管理和調(diào)控過程，密切相關(guān)的不只是單個(gè)蛋白質(zhì)層面的修飾狀態(tài)，更重要的是研究蛋白質(zhì)組學(xué)水平研究在翻譯后修飾的動(dòng)態(tài)變化。高質(zhì)、高效的蛋白質(zhì)翻譯后修飾富集技術(shù)和豐富的、準(zhǔn)確的定量手段使得研究蛋白質(zhì)水平的翻譯后修飾組學(xué)成為現(xiàn)實(shí)，借助這些組學(xué)研究手段能夠?qū)崿F(xiàn)不同生理病理狀態(tài)下生物樣本在翻譯后修飾水平上的定量比較，深入地揭示翻譯后修飾水平的波動(dòng)與生物生命活動(dòng)的密切聯(lián)系。泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位。江蘇氧化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)
蛋白磷酸化檢測方法：一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢：1. WB方法簡便，多數(shù)實(shí)驗(yàn)室具備Western Blot設(shè)備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏，能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白，可以先通過IP使用目標(biāo)蛋白的抗體對目標(biāo)蛋白進(jìn)行富集，再進(jìn)行WB檢測被磷酸化的蛋白，檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質(zhì)譜檢測方法：Western Blot的方法雖然簡便，但是對于大規(guī)模分析復(fù)雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質(zhì)譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準(zhǔn)確度質(zhì)譜儀，如今快速準(zhǔn)確分析細(xì)胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠，或者2D-PAGE膠等分離目標(biāo)蛋白，將含有目標(biāo)蛋白的條帶切下，胰酶消化，LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應(yīng)位點(diǎn)的磷酸化修飾。這個(gè)方法適用于同時(shí)檢測多個(gè)目標(biāo)蛋白的磷酸化水平。廣州丙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)質(zhì)譜鑒定在眾多乙?；揎椀牡鞍踪|(zhì)中，研究較多的要數(shù)細(xì)胞核中包圍DNA的組蛋白了。
蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)：乙?；揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。此外，還存在的非組蛋白乙酰化修飾參與了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙?；b定的影響，再結(jié)合免疫共沉淀通過抗體富集乙?；碾亩?，從而實(shí)現(xiàn)乙酰化的鑒定及定量。樣品要求：1、SDS-PAGE條帶：5個(gè)以上可見考染條帶。2、溶液（目標(biāo)蛋白質(zhì)）：目標(biāo)蛋白總量>50μg，目標(biāo)蛋白濃度>80%。3、溶液（大規(guī)模混合蛋白質(zhì)）：蛋白總量>1mg，蛋白濃度>1μg/μl。
蛋白質(zhì)學(xué)組翻譯后修飾的類型：翻譯后修飾的類型包括N端fMet或Met的去除、二硫鍵的形成、化學(xué)修飾和肽鍵的裂解，其中磷酸化是比較常見的。蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾反應(yīng)是在維持蛋白質(zhì)的完整性和功能性的基礎(chǔ)上，通過基于其氨基酸殘基的化學(xué)反應(yīng)獲得新的生物結(jié)合物。翻譯后修飾在哪里發(fā)生？翻譯后修飾主要發(fā)生在氨基酸側(cè)鏈或蛋白質(zhì)的C端或N端?，F(xiàn)有的官能團(tuán)或新官能團(tuán)的引入可被用于修飾蛋白質(zhì)，以擴(kuò)展20個(gè)標(biāo)準(zhǔn)氨基酸的化學(xué)組成。翻譯后修飾的位點(diǎn)通常帶有可以在化學(xué)反應(yīng)中充當(dāng)親核試劑的官能團(tuán)，如絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸的羥基；賴氨酸、精氨酸和組氨酸胺形式；同時(shí)，在蛋白質(zhì)的N端和C端，天冬酰胺也可作為翻譯后修飾中的一種聚糖連接點(diǎn)。翻譯后修飾也發(fā)生在氧化的蛋氨酸和側(cè)鏈位點(diǎn)的一些亞甲基上。蛋白質(zhì)修飾可檢測修飾類型有磷酸化、糖基化、乙?；⒎核鼗?、丙?；⒍□；⒈；?。
質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾原理：相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白，翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質(zhì)譜分析過程中，蛋白會首先被酶切成肽段，然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析；通過質(zhì)譜分析，得到的是一系列肽段的相對分子質(zhì)量信息。對于某一個(gè)特定的肽段而言，在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的，當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后，例如磷酸化修飾，因?yàn)榱姿岣姆肿恿恳彩谴_定的，所以在質(zhì)譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個(gè)磷酸根的分子量，則可以假設(shè)這個(gè)肽段發(fā)生了磷酸化修飾，再通過二級或多級質(zhì)譜的譜圖進(jìn)行二次確認(rèn)即可實(shí)現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點(diǎn)分析等。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的定位。廣州蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學(xué)質(zhì)譜分析
蛋白質(zhì)磷酸化修飾的免疫印跡技術(shù)優(yōu)點(diǎn)：能夠特異鑒定單個(gè)磷酸化位點(diǎn)。江蘇氧化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)
翻譯后修飾蛋白組學(xué)分析：在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中，蛋白會首先被酶切成肽段，然后進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行分析。通過質(zhì)譜分析，得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息。對于某一個(gè)特定肽段而言，在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下，其序列信息和分子量是確定的。當(dāng)它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后，例如磷酸化修飾，由于序列信息和分子量是確定的，磷酸根的分子量也是確定的。在質(zhì)譜檢測過程中發(fā)現(xiàn)其中的部分肽段的分子量剛好增加了一個(gè)磷酸根的分子量，假設(shè)這個(gè)肽段就發(fā)生了磷酸化修飾，再通過二級質(zhì)譜圖進(jìn)行二次確認(rèn)。江蘇氧化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)
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