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磷酸化修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用:蛋白質(zhì)組(Proteome)泛指一個(gè)生命體內(nèi)所有蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué),是對蛋白質(zhì)進(jìn)行定性、定量及功能的分析。定性分析包括鑒定蛋白質(zhì)的序列、PTM及蛋白之間的相互作用,對比來看,磷酸化蛋白質(zhì)組(Phosphoproteome)就是蛋白質(zhì)組中全部的磷酸化蛋白質(zhì),而磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)(Phosphoproteomics,下文簡稱PP)就是針對磷酸化蛋白質(zhì)的全方面的分析,包括對磷酸化的鑒定、定位和定量。本來屬于蛋白質(zhì)組學(xué)的一個(gè)分支,但隨著研究的深入,人們在各個(gè)領(lǐng)域關(guān)于PP都有重大發(fā)現(xiàn),基于PP的研究也越來越多。乙?;揎椊M學(xué)技術(shù)服務(wù)采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙酰化鑒定的影響。河南棕櫚?;揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)分析價(jià)格
蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質(zhì)組研究的大部分工作集中在細(xì)胞生長的不同時(shí)期,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質(zhì)表達(dá)水平的變化。然而,許多生命過程不僅受蛋白質(zhì)的相對豐度控制,還受時(shí)空分布可逆的翻譯后修飾控制。因此,揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質(zhì)復(fù)雜性和多樣的生物學(xué)功能的前提。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾是一個(gè)復(fù)雜的過程。目前,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。樣品中翻譯后修飾蛋白質(zhì)含量低、動態(tài)范圍廣給相關(guān)研究帶來了很大的挑戰(zhàn)?;诜g后修飾蛋白的異質(zhì)性和相對豐度低的特點(diǎn),主要利用凝膠、生物質(zhì)譜和生物信息學(xué)工具對其進(jìn)行研究。用于PTM分析的質(zhì)譜方法類似于用于“常規(guī)”蛋白質(zhì)鑒定的方法,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白質(zhì)組學(xué)分析。深圳泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)價(jià)格大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計(jì)量和豐度存在,這限制了在分析全細(xì)胞裂解液時(shí)對其的檢測。
磷酸化修飾蛋白質(zhì)組學(xué):在有機(jī)體內(nèi),磷酸化是蛋白翻譯后修飾中比較普遍的共價(jià)修飾形式,同時(shí)也是原核生物和真核生物中比較重要的調(diào)控修飾形式。磷酸化對蛋白質(zhì)功能的正常發(fā)揮起著重要的調(diào)節(jié)作用,該過程是由蛋白質(zhì)激酶(Kinase)催化的把ATP或GTP的γ位磷酸基轉(zhuǎn)移到底物蛋白質(zhì)的氨基酸殘基,如絲氨酸(Serine,Ser,S)、蘇氨酸(Threonine,Thr,T)和酪氨酸(Tyrosine,Tyr,Y)等上的過程,而其逆向過程則是由蛋白質(zhì)磷酸酶去除相應(yīng)的磷酸基團(tuán)。正是這兩種酶的相反作用及其中所涉及到的能量消耗與生成使磷酸化成為體內(nèi)很多生理活動調(diào)控的首先選擇方式。
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)有些什么?泛素化可以生產(chǎn)出單泛素化或多泛素化蛋白質(zhì)。后者在當(dāng)7個(gè)賴氨酸殘基的泛素與另一個(gè)泛素的甘氨酸C端連接形成。這種泛素分子鏈接在生物過程中起到重要的作用。共價(jià)結(jié)合泛素的蛋白質(zhì)能被蛋白酶識別并降解,這是細(xì)胞內(nèi)短壽命蛋白質(zhì)和一些異常蛋白降解的普遍途徑。泛素化及類泛素化蛋白在細(xì)胞分裂,自噬,DNA修復(fù),免疫應(yīng)答,細(xì)胞消亡等方面同樣起到關(guān)鍵作用。與消化道內(nèi)進(jìn)行的蛋白質(zhì)水解不同,從泛素與蛋白的結(jié)合到將蛋白水解成小的肽段,整個(gè)水解過程需要能量參與。人們開始意識到泛素-蛋白酶系統(tǒng)是一個(gè)對于真核細(xì)胞非常重要的調(diào)節(jié)系統(tǒng)。蛋白質(zhì)磷酸化修飾可應(yīng)用于食品工業(yè)方面。
蛋白質(zhì)的甲基化修飾 :蛋白質(zhì)的甲基化(methylation)是指將甲基酶促轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)的某個(gè)殘基上,通常是賴氨酸或精氨酸,也包括組氨酸、半胱氨酸和天冬酰胺等。蛋白質(zhì)的甲基化是一種普遍的修飾,在大鼠肝細(xì)胞核的總蛋白提取物中,大約2%的精氨酸殘基是二甲基化的。蛋白質(zhì)甲基化經(jīng)常與乙?;⒘?,因?yàn)樗鼈兌际浅R姷谋碛^遺傳修飾,經(jīng)常發(fā)生在組蛋白上。不過從化學(xué)反應(yīng)的角度來看,乙?;梢运阕饕环N短鏈脂?;揎?,這里主要討論甲基化方面的問題。泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)普遍存在于真核細(xì)胞內(nèi),故名泛素。濟(jì)南蛋白質(zhì)甲基化修飾組學(xué)方法
目前,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。河南棕櫚酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析價(jià)格
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)產(chǎn)品:常規(guī)的蛋白質(zhì)組學(xué)研究往往只關(guān)注不同生理、病理?xiàng)l件下蛋白質(zhì)表達(dá)水平的變化。然而,越來越多的研究發(fā)現(xiàn),許多重要的生命活動、疾病發(fā)生不僅與蛋白質(zhì)的豐度相關(guān),更重要的是被各類蛋白質(zhì)翻譯后修飾所調(diào)控。因此深入研究蛋白質(zhì)翻譯后修飾對揭示生命活動的機(jī)理、篩選疾病的臨床標(biāo)志物、鑒定藥物靶點(diǎn)等方面都具有重要意義。由于翻譯后修飾的蛋白質(zhì)在生物樣本中含量低、動態(tài)范圍廣,質(zhì)譜分析前需要對修飾進(jìn)行富集以提高其豐度。河南棕櫚酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析價(jià)格