靶向代謝組學:靶向代謝組學分析主要是以標準品為參照,對特定的代謝物群進行有針對性地、特異性地檢測與分析。通常采用的技術方案包括常規(guī)的液質聯(lián)用(LC-MS)分析技術和選擇性反應/多反應監(jiān)測技術(MRM/ SRM)。常規(guī)分析法首先利用LC-MS的方法對待分析樣本進行大規(guī)模代謝組分析,然后通過與相同分析條件下標準品的分析結果進行比對,實現(xiàn)對樣本內目標代謝群的定性和定量分析。MRM/SRM技術是基于已知或假定的反應離子信息,有針對性地選擇數(shù)據(jù)進行質譜信號采集,對符合規(guī)則的離子對進行信號記錄,去除不符合規(guī)則離子信號的干擾。定量過程中,該技術首先篩選到目標代謝物特異性的母離子,然后選擇性地對這些母離子進行碰撞誘導,去除其他離子的干擾,只對選定的特異MS/MS2離子進行質譜信號的采集,從而實現(xiàn)對目標代謝分子更為特異、靈敏、準確的分析。代謝組學主要技術手段是核磁共振。北京GC-MS非靶向代謝組學定性分析
LC-MS非靶向代謝組學:LC-MS非靶向代謝組學通過液質聯(lián)用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化,重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物,進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關關系,其研究對象大都是分子量1500Da以內的小分子物質。LC-MS非靶向代謝組學技術優(yōu)勢:1、較高的靈敏度、分辨率;2、較寬的動態(tài)范圍;3、適合于生物樣本中復雜代謝產物的檢測和潛在標志物的鑒定;4、適合對標本中未知代謝物的探索研究。四川個性化定制靶向代謝組學分析方法代謝組學的研究介于基因、蛋白質和細胞、組織之間。
代謝組學的研究領域有哪些?1、疾病機制研究;2、疾病診斷與防治;3、新藥篩選和開發(fā);4、藥物作用機制的研究;5、藥物毒性評價;6、植物的細胞代謝組學研究;7、微生物代謝組學研究。代謝組學的研究方法:代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析,采用液相色譜-質譜聯(lián)用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜峰,了解不同化合物的結構,建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析,研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對此進行更深入的研究。
代謝組學樣品收集方法及所需樣本量是什么?根據(jù)不同的檢測要求,需要配合不同的樣本量和樣本采集方法,常規(guī)的方法和單個樣本量如下:(1) 微生物和細胞樣本:細胞迅速猝滅細胞并冷凍保存;單個樣本細胞數(shù)量要求10^6。(2) 動物體液(如尿、血、組織、唾液):采樣后要迅速預處理,如加入抗凝血劑、防腐劑,并立即冷凍處理(-80 ℃);單個樣本要求體積為10μL。(3) 植物樣本:采集后迅速冷凍(液氮),然后轉入-80℃保存,單個樣本要求質量為50mg。代謝組學可以檢測的樣品種類有哪些呢?
代謝組學究竟是一門什么樣的研究方向?首先定義什么是代謝組學。簡單的說就是研究生物體對內外刺激的整體代謝應答規(guī)律。那么為什么代謝組學是基因組,轉錄組,蛋白質組的下游。我們研究它到底有什么意義。中心法則告訴我們了遺傳信息的流向,的執(zhí)行者蛋白質中很多酶參與了體內的代謝過程?;驕y序數(shù)量太大,而且基因水平解釋問題往往很吃力。因為基因的調控和生物學事件之間隔了一個很漫長的信號轉導過程。蛋白同理,一是蛋白種類巨大,二是蛋白組學發(fā)展進入瓶頸;發(fā)展代謝組是因為代謝物種類只有不到1w種,建立它的差異分析更加簡單,同時在價格等方面更有推廣的意義。代謝組學的研究處于生物信息流的中游。四川個性化定制靶向代謝組學分析方法
代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物(MW<1000)。北京GC-MS非靶向代謝組學定性分析
非靶向代謝組學分析流程:1、代謝譜分析(也稱為差異表達分析):在一組實驗和對照樣品中,尋找豐度改變有統(tǒng)計學意義的感興趣代謝物;2、鑒定:進行代謝譜分析后,測定這些代謝物的化學結構;3、解釋:研究流程的結尾的一步,解釋所發(fā)現(xiàn)的代謝物與生物過程或生物狀態(tài)之間的關聯(lián)。代謝組學主要是對生物體受到內部(基因)或外部(飲食、環(huán)境等)刺激后所發(fā)生生物響應進行綜合分析的研究工具,代謝組學的研究按照研究目的的不同可分為靶向代謝組學和非靶向代謝組學。北京GC-MS非靶向代謝組學定性分析