貴州mRNA-seq轉錄組學服務

來源: 發(fā)布時間:2022-05-20

轉錄組學應用于胃腸瘤轉移機制研究:circRNA是一種非編碼RNA,可以多種方式參與生物學功能,如細胞增殖、細胞周期、侵襲和轉移等。近年來研究發(fā)現,環(huán)狀RNA可以通過海綿吸附微小RNA和RNA結合蛋白參與轉錄后調控,從而影響瘤耐藥過程中的DNA修復、凋亡、增殖、細胞轉運,以及介導瘤耐藥的細胞內酶,進而在瘤耐藥中發(fā)揮重要調節(jié)作用。轉錄組學應用領域:農林領域:生長發(fā)育機制,抗逆脅迫機制,育種,物種保護研究等;畜牧業(yè):生長發(fā)育機制,致病機理研究,肉類及乳制品品質研究等。轉錄組學是研究特定的細胞、組織或個體在特定時間和狀態(tài)下所轉錄出所有 RNA 的學科。貴州mRNA-seq轉錄組學服務

RNA-Seq轉錄組學技術優(yōu)勢:RNA-seq技術可以檢測到低水平表達、未識別的轉錄子和新拼接亞型基因。另一方面,與基因芯片相比,RNA-Seq有一個更廣的檢測動態(tài)范圍,可以研究編碼和非編碼RNA,更易于基因網絡的構建、發(fā)現選擇性剪切轉錄物,檢測到等位基因的具體表達方式,也可以用來提取基因型信息。在RNA-Seq單細胞研究中,一個主要優(yōu)勢是可以分析整個轉錄序列,而不是有限制數量的基因,并且,研究DNA和RNA的方法并不是相互排斥的,他們可以相互結合使用,產生更多的生物學上重要的信息。北京外泌體轉錄組學定量分析RNA-Seq轉錄組學有著巨大的應用前景。

轉錄組學技術路線及研究意義:轉錄組測序的研究對象為特定細胞在某一功能狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA。相對于傳統(tǒng)的芯片雜交平臺,轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針,即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測,提供更準確的數字化信號,更高的檢測通量以及更普遍的檢測范圍,是目前深入研究轉錄組復雜性的強大工具?;诟咄繙y序平臺的轉錄組測序技術能夠全方面獲得物種特定組織的轉錄本信息,從而進行基因表達水平研究、新轉錄本發(fā)現研究、轉錄本結構變異研究等。

circRNA轉錄組學成環(huán)機制:circRNA環(huán)化方式分為內含子環(huán)化和外顯子環(huán)化。目前主流的成環(huán)機制可歸類為:依賴于剪切體的索尾插接環(huán)化。在mRNA前體上,通過連續(xù)的組裝小核核糖體蛋白從而催化外顯子下游的5′供體的位點連接到上游的3′受體的位點,索尾插接形成環(huán)化,然后通過剪切形成circRNA。順式作用元件促進circRNA形成。部分circRNA外顯子兩側的內含子中含有反向互補序列,首先在剪切位點上并排形成RNA雙鏈體,再通過可變剪切形成帶內含子和不帶內含子兩種不同的circRNA?;蛘咄怙@子內部以及兩側的內含子可以競爭進行RNA配對,然后通過可變剪切形成不同類型的circRNA。轉錄組學測序有什么樣的樣品要求?

轉錄組學和基因組學目前有實用價值嗎?二者實用價值非常大,尤其是對有瘤的患者的醫(yī)治,簡直顛覆了傳統(tǒng)醫(yī)治的模式。轉錄組和基因組月在生物學研究中有著重要價值。例如研究某個基因功能的時候,可以構建該基因的敲除或者過表達生物,然后對比野生型進行轉錄組分析看看該基因涉及什么表達網絡。此外在醫(yī)學方面的應用也很大,例如在有的瘤病人中進行基因組學測序和分析能夠了解其中的發(fā)生的發(fā)展的驅動基因,然后能根據發(fā)展的驅動基因研究靶向藥物,從而推動瘤的藥物研發(fā)和醫(yī)治!轉錄組學可應用于非生物環(huán)境關系研究、植物與微生物、在表型鑒定中的應用、代謝途徑及功能基因組研究。武漢高通量轉錄組學質譜鑒定

轉錄組學可以直接測定每個轉錄本單核苷酸分辨率的準確度。貴州mRNA-seq轉錄組學服務

轉錄組學:隨著越來越多的基因組序列相繼被測定,生命科學的研究進入了后基因組時代,各類組學技術得到迅速地發(fā)展與普遍地應用包括以基因為研究對象的基因組學(Genomics)、以轉錄過程為研究對象的轉錄組學(Transcriptomics)。意義:1.轉錄組譜可以提供特定條件下某些基因表達的信息,并據此推斷相應未知基因的功能,揭示特定調節(jié)基因的作用機制.2.通過基于基因表達譜的分子標簽,不只可以辨別細胞的表型歸屬,還可以用于疾病的診斷.3.轉錄組的研究應用于臨床的另一個例子是可以將表面上看似相同的病癥分為多個亞型,尤其是對原發(fā)性惡性瘤,通過轉錄組差異表達譜的建立,可以詳細描繪出患者的生存期以及對藥物的反應等。貴州mRNA-seq轉錄組學服務