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乙?;揎椀鞍捉M學(xué)介紹:蛋白質(zhì)乙?;?Acetylation)是蛋白在乙?;D(zhuǎn)移酶(或非酶)的催化下,將乙?;鶊F(tuán)轉(zhuǎn)移并添加在蛋白賴氨酸殘基或蛋白N端上的過程,在調(diào)控蛋白質(zhì)功能、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)中起重要作用。乙?;揎椫饕譃閮深悾旱鞍譔端的乙?;揎椇偷鞍踪嚢彼嵘系囊阴;揎?。N端乙酰化修飾大部分發(fā)生在真核生物的蛋白上,由N乙酰轉(zhuǎn)移酶(NATs)催化;賴氨酸上的乙?;揎検且粋€可逆的過程,主要由賴氨酸乙?;?KATs)和賴氨酸去乙?;?KDACs)催化。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)是什么?貴陽蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學(xué)分析
蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)技術(shù)服務(wù):乙?;揎検求w內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾,對細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。此外,還存在大量的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。乙?;揎椊M學(xué)技術(shù)服務(wù)采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙酰化鑒定的影響,再結(jié)合免疫共沉淀通過高效的抗體富集乙?;碾亩危瑥亩鴮崿F(xiàn)大規(guī)模乙?;蔫b定及定量。蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)技術(shù)服務(wù):泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動。湖北蛋白質(zhì)氧化修飾組學(xué)價格研究蛋白質(zhì)磷酸化對闡明蛋白質(zhì)功能具有重要意義。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質(zhì)組研究的大部分工作集中在細(xì)胞生長的不同時期,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質(zhì)表達(dá)水平的變化。然而,許多生命過程不僅受蛋白質(zhì)的相對豐度控制,還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制。因此,揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質(zhì)復(fù)雜性和多樣的生物學(xué)功能的前提。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾是一個復(fù)雜的過程。目前,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。樣品中翻譯后修飾蛋白質(zhì)含量低、動態(tài)范圍廣給相關(guān)研究帶來了很大的挑戰(zhàn)。基于翻譯后修飾蛋白的異質(zhì)性和相對豐度低的特點,主要利用凝膠、生物質(zhì)譜和生物信息學(xué)工具對其進(jìn)行研究。用于PTM分析的質(zhì)譜方法類似于用于“常規(guī)”蛋白質(zhì)鑒定的方法,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白質(zhì)組學(xué)分析。
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué):泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽,在真核生物中高度保守,可通過異肽鍵與目標(biāo)蛋白賴氨酸殘基的氨基進(jìn)行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標(biāo)記,泛素用親和標(biāo)簽(通常為6xHis)進(jìn)行標(biāo)記,并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結(jié)構(gòu),經(jīng)胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上,使肽的質(zhì)量增加114,因此可作為泛素定位位點的質(zhì)量標(biāo)記。用HPLC對樣品進(jìn)行預(yù)分離,使用針對特定殘留結(jié)構(gòu)的抗體富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質(zhì)譜可以鑒定泛素化位點。泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)普遍存在于真核細(xì)胞內(nèi),故名泛素。
乙?;揎椀鞍捉M學(xué)簡介:乙酰化是把一種乙酰官能基團(tuán)添加到另一種有機(jī)化合物上,并進(jìn)行結(jié)合的過程。乙?;彩羌?xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)翻譯后修飾的一種重要形式,其主要發(fā)生在組蛋白賴氨酸上,是由組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶 (HATs) 催化的,其反過程去乙?;山M蛋白去乙酰酶 (Histone deacetylases,HDs 或者 HDACs) 催化的。關(guān)鍵組蛋白的 N-末端富含賴氨酸,生理條件下帶正電,按照組成可以分為 5 種,包括:關(guān)鍵組蛋白(core histone):H2A、H2B、H3、H4;連接組蛋白(linker histone):H1。組蛋白結(jié)構(gòu)高度保守,尤其是 H4。關(guān)鍵組蛋白由球形部和尾部構(gòu)成,球形部借 Arg 與磷酸二脂骨架間的靜電作用使 DNA 分子纏繞在組蛋白關(guān)鍵上,形成核小體,尾部含有大量 Arg 和 Lys,為轉(zhuǎn)譯后修飾的部位。H1 多樣性,具有屬和組織特異性。蛋白磷酸化修飾過程是通過蛋白激酶催化,將磷酸基團(tuán)從ATP轉(zhuǎn)移到多肽底物的絲氨酸、或酪氨酸殘基上。深圳泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)
常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括乙酰化。貴陽蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)分析
蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點分析時應(yīng)該注意些什么問題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測和鑒定含有修飾基團(tuán)的肽幾率就越大。修飾位點的占有率:被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低,則檢測到修飾肽的機(jī)會會隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識別修飾位點。棕櫚酰化蛋白修飾質(zhì)譜鑒定方法:S-棕櫚?;闹饕δ苁谴龠M(jìn)蛋白質(zhì)與細(xì)胞膜的結(jié)合。蛋白質(zhì)可以由一個棕櫚?;M成,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質(zhì),如豆蔻酰基。由于對S-棕櫚?;鞍追治鋈匀痪哂刑魬?zhàn)性,由于S-棕櫚酰化修飾蛋白亞水平以及疏水性和潛在不穩(wěn)定的硫代質(zhì)鏈的S-脂?;?。貴陽蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學(xué)分析