貴州修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用

來源: 發(fā)布時間:2022-04-30

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用?具體而言,蛋白質(zhì)組學(xué)在此類應(yīng)用中,更多地用于提供高通量蛋白質(zhì)定性定量信息。作為檢測手段的蛋白質(zhì)組學(xué):事實上,在當(dāng)前的生物醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷中,蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)有非常多的應(yīng)用。因為蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的本質(zhì)(從分析化學(xué)角度來看),就是對蛋白質(zhì)的定性定量分析。生物醫(yī)學(xué)和臨床診斷中,需要大量表征一種或多種蛋白質(zhì)的含量、氨基酸序列、翻譯后修飾等信息。蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)目前在一小部分]應(yīng)用中具有獨特優(yōu)勢。有很多蛋白質(zhì)組學(xué)的研究者在工業(yè)界和醫(yī)院進行相關(guān)研究和日常工作。很容易發(fā)現(xiàn),當(dāng)前蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床應(yīng)用更多地集中在第二類。第1類的應(yīng)用更接近于生物醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究,目前還沒有和大部分人的現(xiàn)實生活產(chǎn)生關(guān)系。蛋白質(zhì)組學(xué)研究是生命科學(xué)進入后基因時代的特征。貴州修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用

PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程是怎樣的?要做PRM首先要明確目標(biāo)蛋白(或多肽)是什么,設(shè)計和建立針對這些目標(biāo)蛋白PRM質(zhì)譜采集方法,然后對待測樣品進行PRM數(shù)據(jù)采集,將得到的原始譜圖數(shù)據(jù)導(dǎo)入分析軟件提取子離子信息進行定量。另外,如果配制已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)肽段,用PRM額外做一個標(biāo)準(zhǔn)曲線,即可實現(xiàn)一定的定量。PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)能應(yīng)用到哪些方面?研究工作中涉及到蛋白或多肽定量的都可以通過PRM技術(shù)來實現(xiàn)。具體說來,比如驗證定量蛋白質(zhì)組學(xué)中某些蛋白的變化,多肽的相對和一定的定量,想做蛋白定量卻沒有抗體,針對蛋白修飾位點的定量,想同時定量多個蛋白的情況等,都可以用PRM來做。貴州修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)現(xiàn)已被普遍應(yīng)用于生命科學(xué)研究領(lǐng)域。

PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué):是一種基于Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù),首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力,用Q1選擇目標(biāo)肽段的母離子,隨后在collisioncell中對母離子進行碎裂,然后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì)、目標(biāo)肽段(如發(fā)生翻譯后修飾的肽段)進行選擇性檢測,即可對目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進行相對(一定)定量。從而實現(xiàn)對復(fù)雜樣本中的目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進行準(zhǔn)確地特異性分析。

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法:等電聚焦:等電聚焦(isoelectric focusing,IEF)是一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點不同的蛋白質(zhì)的電泳技術(shù)。等電聚焦凝膠電泳依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點進行分離,等電聚焦中,蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質(zhì)是脂肪族多氨基多羧酸,在電場中形成正極為酸性,負(fù)極為堿性的連續(xù)的pH梯度。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場中移動;當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)遷移至其等電點位置時,其靜電荷數(shù)為零,在電場中不再移動,據(jù)此將蛋白質(zhì)分離。蛋白質(zhì)組研究技術(shù)涉及到各種重要的生物學(xué)現(xiàn)象,如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞分化、蛋白質(zhì)折疊等等。

4D定量蛋白質(zhì)組學(xué) :目前,蛋白質(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析一般是根據(jù)保留時間(retention time)、質(zhì)荷比(m/z)、離子強度(intensity)這三個維度對肽蛋白質(zhì)進行鑒定和定量,即3D蛋白質(zhì)組學(xué)。4D蛋白質(zhì)組學(xué)在3D蛋白質(zhì)組學(xué)的基礎(chǔ)之上增加了第四維度,離子淌度(mobility),主要根據(jù)離子的形狀和截面對離子進行分離,能夠區(qū)分m/z差值非常小的肽段,使低豐度蛋白信號能夠被區(qū)分和識別出來。蛋白質(zhì)組學(xué)分析策略:蛋白質(zhì)組學(xué)分析包括分析蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能、翻譯后修飾情況、蛋白質(zhì)定位、蛋白質(zhì)表達情況以及蛋白質(zhì)間的相互作用等等?;诓煌姆治鰞?nèi)容可以采用不同的蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)和分析策略。蛋白質(zhì)組學(xué)是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細(xì)胞、組織或者生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。貴陽醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)

蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別。貴州修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用

蛋白質(zhì)組學(xué)研究這樣做:蛋白質(zhì)組與基因組相對應(yīng),也是一個整體的概念,隨著基因組學(xué)研究的不斷深入,蛋白質(zhì)組學(xué)已逐漸成為研究熱點,對蛋白組學(xué)的研究可以使我們更容易接近生命的機理本質(zhì),但探究成千上萬的蛋白質(zhì)特性也是一個重大的技術(shù)挑戰(zhàn)。蛋白質(zhì)組(Proteome)指的是某一時刻或某一狀態(tài)基因組表達的所有相應(yīng)的蛋白,即細(xì)胞、組織或機體全部蛋白質(zhì)的存在及活動形式,其是一個動態(tài)概念,它是在組織、細(xì)胞的整體蛋白質(zhì)水平上,探索蛋白質(zhì)作用模式、功能機理、調(diào)節(jié)控制以及蛋白質(zhì)群體內(nèi)的相互關(guān)系、從而獲得生命活動調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的全方面而深入的認(rèn)識,以揭示生命活動的基本規(guī)律。貴州修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用