廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法

來源: 發(fā)布時間:2022-04-26

蛋白質(zhì)組學(xué)我的介紹:蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)采用高通量和大規(guī)模的研究手段,從整體的角度分析細(xì)胞內(nèi)動態(tài)變化的蛋白質(zhì)組成成份、表達(dá)水平與修飾狀態(tài),了解蛋白質(zhì)之間的相互作用與聯(lián)系,揭示蛋白質(zhì)功能與細(xì)胞生命活動規(guī)律,之后達(dá)到構(gòu)建出細(xì)胞的“功能圖”的目的。蛋白質(zhì)作為生命活動的物質(zhì)承擔(dān)者、生理功能的執(zhí)行者和生命現(xiàn)象的直接體現(xiàn)者,研究蛋白質(zhì)對闡明生命體的變化機制具有重要作用。蛋白質(zhì)組研究不只可以實現(xiàn)與基因組的關(guān)聯(lián),揭示生命活動的發(fā)生規(guī)律。同樣對人類重大疾病的發(fā)生與發(fā)展的病理機制研究也具有重要作用。生命體的生理、病理過程,藥物和環(huán)境因子的作用都依賴于蛋白質(zhì),并引起蛋白質(zhì)的變化。蛋白質(zhì)組學(xué)研究對提高我國生物醫(yī)學(xué)原始創(chuàng)新能力、重大疾病防診治能力和國民健康水平以及新藥研發(fā)能力、生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有重大的戰(zhàn)略意義。蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用呢?廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法

蛋白組學(xué)常見研究模式主要有兩種:1.通過蛋白質(zhì)組學(xué)尋找疾病發(fā)生的發(fā)展的新型標(biāo)志物;2.結(jié)合其它組學(xué)建立疾病或者研究主題的表達(dá)譜和分子機制。蛋白質(zhì)組學(xué)( proteomics) 是指系統(tǒng)研究某一基因組所表達(dá)的所有蛋白質(zhì),包括組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的氨基酸序列,蛋白質(zhì)的豐度,蛋白質(zhì)的修飾以及蛋白質(zhì)之間的相互作用。蛋白質(zhì)組和基因組( genome)在概念上有相關(guān)性,表示某一個蛋白質(zhì)組的蛋白質(zhì)是由基因組所編碼的,然而蛋白質(zhì)組學(xué)和基因組學(xué)在研究對象和研究方法上有很大的區(qū)別。廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法蛋白質(zhì)組學(xué)研究不僅是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。

定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析:特點:(1)不同樣本標(biāo)記之后混樣,統(tǒng)一處理上機,減少了分別上機造成的實驗誤差,并利用同位素標(biāo)簽的豐度來檢測,定量更準(zhǔn)確,重復(fù)性更好;(2)由于需要標(biāo)記試劑標(biāo)記,因此成本相對較高;(3)通量高,在一次實驗中比較多可同時比較8個樣品;(4)利用基于同一個參考樣品的辦法,可以進(jìn)行多于8個樣品的定量比較;(5)iTRAQ的覆蓋度高、靈敏度高。Label-Free定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析:Label-Free定量,即非標(biāo)記的定量蛋白質(zhì)組學(xué),不需要對比較樣本做特定標(biāo)記處理,只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質(zhì)譜響應(yīng)信號便可得到樣品間蛋白表達(dá)量的變化,通常用于分析大規(guī)模蛋白鑒定和定量時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)。

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)療和健康方面有什么應(yīng)用?基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是目前比較主流的高通量蛋白質(zhì)研究手段,當(dāng)前在醫(yī)療健康方面的應(yīng)用主要集中于基礎(chǔ)研究和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)。隨著質(zhì)譜、系統(tǒng)生物學(xué)、生物信息學(xué)等相關(guān)學(xué)科的發(fā)展,我認(rèn)為今后我們會更多地在現(xiàn)實生活中見到蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)的應(yīng)用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變(鐮刀形紅細(xì)胞癥)、糖化血紅蛋白比例測定等。從測試體量估計,應(yīng)該遠(yuǎn)小于1%的ELISA測試量。由于成本和通量等原因,蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)并不如ELISA適合大量的日常分析。但對于一些分析有問題的項目,采用基于質(zhì)譜(或二維膠等手段)的蛋白質(zhì)組學(xué)有獨特的技術(shù)優(yōu)勢。另外,蛋白質(zhì)組學(xué)方法開發(fā)和驗證周期短,在中高級特殊應(yīng)用(如極少使用的特殊蛋白指標(biāo)臨床檢測、未知疾病研究和控制)中也有其獨特優(yōu)勢。蛋白質(zhì)組研究是為了識別及鑒定一個細(xì)胞或組織所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)以及它們的表達(dá)模式。

蛋白質(zhì)組學(xué)在生物學(xué)領(lǐng)域的研究中的應(yīng)用是怎樣的?研究對象涉及到生物體且生物體內(nèi)表達(dá)蛋白,理論上都可以應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)是以研究生物體蛋白組成及其變化規(guī)律為目的的應(yīng)用科學(xué)。主要使用的儀器為液質(zhì)聯(lián)用高分辨率質(zhì)譜儀。詳細(xì)來說,蛋白質(zhì)組學(xué)包含許多分支:非標(biāo)定量蛋白質(zhì)組學(xué)(定性研究生物體的蛋白組成),定量蛋白質(zhì)組學(xué)(對生物體蛋白表達(dá)含量進(jìn)行測定),修飾蛋白質(zhì)組學(xué)(對蛋白質(zhì)翻譯后修飾進(jìn)行檢測)及相互作用蛋白質(zhì)組研究(蛋白質(zhì)直接相互作用機制解析)等。蛋白質(zhì)組學(xué)屬于后基因組時代的科學(xué)研究,針對基因表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行檢測與定量。因此更能反應(yīng)出生物體生理條件下的水平與狀態(tài)。Label free定量蛋白組學(xué)技術(shù)是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行質(zhì)譜分析。廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法

蛋白質(zhì)組學(xué)可以通過系統(tǒng)性地研究蛋白質(zhì)表達(dá)和翻譯后修飾變化對疾病的影響。廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法

蛋白質(zhì)組學(xué)是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。蛋白質(zhì)組學(xué)研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益,是生命科學(xué)進(jìn)入后基因時代的特征。蛋白質(zhì)是生命存在和運動的物質(zhì)基礎(chǔ),是細(xì)胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活動的執(zhí)行者,亦是基因功能活動的執(zhí)行者,是生命現(xiàn)象復(fù)雜性和多變性的直接體現(xiàn)者。蛋白質(zhì)組研究是為了識別及鑒定一個細(xì)胞或組織所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)以及它們的表達(dá)模式,是對基因組研究的重要補充,是對生物體在蛋白質(zhì)水平上定量、動態(tài)、整體性的研究。這類研究有助于了解蛋白的結(jié)構(gòu)、細(xì)胞的功能、生命的本質(zhì)及活動規(guī)律,為疾病的診斷、診療、疫苗及新藥開發(fā)提供科學(xué)依據(jù)。廣州醫(yī)學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法