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根據(jù)不同的作用位點,蛋白質(zhì)乙酰化修飾分為:發(fā)生在蛋白N端的乙?;揎?、發(fā)生在蛋白賴氨酸上的乙?;揎?。前者發(fā)生在90%以上的真核生物新生蛋白上,對于新生蛋白的成熟和細(xì)胞定位非常重要,由N乙酰轉(zhuǎn)移酶(NATs)負(fù)責(zé);而后者是一個可逆的過程,主要由賴氨酸乙?;福↘ATs)和賴氨酸去乙?;福↘DACs),賴氨酸的乙?;揎検俏覀兡壳把芯康闹攸c。蛋白質(zhì)磷酸化修飾應(yīng)用領(lǐng)域:應(yīng)用在食品工業(yè)方面,通過人工翻譯磷酸化修飾的蛋白可以普遍用于各種食用蛋白質(zhì)的改性,以改善蛋白質(zhì)品質(zhì)。如,花生蛋白、大豆蛋白、小麥面筋蛋白等。在人工磷酸化修飾的方法下,也可以研究各種蛋白質(zhì)的功能和相關(guān)代謝途徑的調(diào)控。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,蛋白質(zhì)的磷酸化紊亂,會導(dǎo)致細(xì)胞周期調(diào)控異常,因此,病理的形成與蛋白質(zhì)的磷酸化異常也有很大相關(guān)性。其分子機制問題對于病癥等重大疾病的研究具有相當(dāng)?shù)闹笇?dǎo)意義,這也是指當(dāng)之無愧地成為生物學(xué)研究領(lǐng)域中的熱點。蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)磷酸化修飾具有簡單的特性。湖北蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)主要方式
泛素化修飾PRM定量驗證:原理: 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復(fù)以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細(xì)胞活動。首先對泛素化的蛋白進行胰酶消化,在賴氨酸的修飾位點上會產(chǎn)生兩個甘氨酸的殘基(K-GG),利用對泛素化賴氨酸(K-GG)具有高親和力的基序抗體,特異性富集復(fù)雜樣本中的泛素化肽段,結(jié)合LC-MS/MS蛋白質(zhì)定量方法,實現(xiàn)大規(guī)模泛素化蛋白質(zhì)定性定量分析。廣州泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)自中而下的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)可用于組蛋白修飾的分析。
甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)原理:目前用于甲基化蛋白質(zhì)組分析的甲基化肽段富集抗體分為精氨酸甲基化(Me-R)抗體和賴氨酸甲基化(Me-K)抗體兩大類。根據(jù)氨基酸殘基上所含甲基化修飾基團數(shù)量的不同,精氨酸甲基化(Me-R)抗體又包括:單甲基化精氨酸(MMA)抗體、非對稱二甲基化精氨酸(ADMA)抗體和對稱二甲基化精氨酸(SDMA)抗體;賴氨酸甲基化(Me-K)抗體又包括:賴氨酸單甲基化(K-Me)抗體、賴氨酸二甲基化(K-2Me)抗體和賴氨酸三甲基化(K-3Me)抗體。其中,Me-R的各類抗體需要單獨使用,而Me-K抗體可以混合使用。
定量磷酸化蛋白質(zhì)翻譯修飾組學(xué):蛋白質(zhì)發(fā)生磷酸化是重要的翻譯后修飾,它與信號傳導(dǎo)、細(xì)胞周期、生長發(fā)育機理等諸多生物學(xué)問題有密切關(guān)系。研究蛋白質(zhì)磷酸化對闡明蛋白質(zhì)功能具有重要意義。將磷酸化肽段TiO2富集技術(shù)和iTRAQ/TMT/Lable free技術(shù)相結(jié)合,實現(xiàn)對磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)的定量研究。技術(shù)原理:在磷酸化肽段富集前先進行 iTRAQ/TMT 標(biāo)記,然后通過 TiO2 富集方法獲得高純度的磷酸化肽段,之后結(jié)合高分辨率質(zhì)譜完成對樣品的定量分析。蛋白質(zhì)翻譯后修飾可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì)。
乙?;揎椀鞍捉M學(xué)應(yīng)用方向有什么?1、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標(biāo)志物,疾病機理機制,疾病分型,個性化治理等;2、生物醫(yī)藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發(fā)等;3、微生物領(lǐng)域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;4、海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;5、生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危定風(fēng)險評估研究等;6、食品營養(yǎng):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測等。常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括乙?;:钡鞍踪|(zhì)糖基化修飾組學(xué)主要方式
大多數(shù)翻譯后修飾蛋白以低化學(xué)計量和豐度存在,這限制了在分析全細(xì)胞裂解液時對其的檢測。湖北蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)主要方式
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)的介紹:泛素由76個氨基酸組成,高度保守,普遍存在于真核細(xì)胞內(nèi),故名泛素。泛素化是可逆的,依賴ATP并且通過泛素刺激酶E1,泛素結(jié)合酶E2,泛素連接酶E3一系列催化反應(yīng)所致。這些特殊的酶包括泛素酶,結(jié)合酶、連結(jié)酶和降解酶等。泛素化在蛋白質(zhì)的定位、代謝、功能、調(diào)節(jié)和降解中都起著十分重要的作用。同時,它也參與了細(xì)胞周期、增殖、凋亡、分化、轉(zhuǎn)移、基因表達、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、信號傳遞、損傷修復(fù)、炎癥免疫等幾乎一切生命活動的調(diào)控。泛素化、心血管等疾病的發(fā)病密切相關(guān)。因此,作為近年來生物化學(xué)研究的一個重大成果,它已然成為研究、開發(fā)新藥物的新靶點。湖北蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)主要方式