廣東PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法

非標(biāo)定量法(Label-free)是通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強度，分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化，認(rèn)為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關(guān)，因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度，通過適當(dāng)?shù)臄?shù)學(xué)公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來,從而對蛋白質(zhì)進行定量。按照其原理主要分為兩種，第1種spectrumcounts類的非標(biāo)記方法，發(fā)展比較早，已經(jīng)形成多種定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鑒定結(jié)果為定量基礎(chǔ)，各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正。第二種非標(biāo)記定量的原理是以MS1為基礎(chǔ)，計算每個肽段的信號強度在LC-MS上的積分。Label Free 非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)處理步驟簡單，成本低。廣東PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法

蛋白質(zhì)組學(xué)的分析介紹：蛋白質(zhì)組學(xué)的分析主要指蛋白的生信分析，依賴于數(shù)據(jù)庫的建立?，F(xiàn)在常用的蛋白質(zhì)組學(xué)生信分析有GO功能分析和KEGG通路分析。GO（gene ontology）是基因本體聯(lián)合會（Gene Onotology Consortium）所建立的數(shù)據(jù)庫。根據(jù)基因產(chǎn)物的相關(guān)分子功能、生物學(xué)途徑、細(xì)胞組分而給予定義，無物種相關(guān)性。是系統(tǒng)分析基因功能，它將基因組的信息與基因功能聯(lián)系起來，旨在揭示生命現(xiàn)象的遺傳與化學(xué)藍圖。旨在借助計算機全方面地展示細(xì)胞和生物所包含的生物學(xué)信息；根據(jù)基因組中的信息，用計算機計算或者預(yù)測出比較復(fù)雜的細(xì)胞中的通路或者生物的復(fù)雜行為。武漢定量乙?；鞍踪|(zhì)組學(xué)應(yīng)用在當(dāng)前的生物醫(yī)學(xué)研究和臨床診斷中，蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)技術(shù)有非常多的應(yīng)用。

蛋白質(zhì)組學(xué)在醫(yī)學(xué)的研究應(yīng)用：蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)是研究細(xì)胞、組織或生物體中蛋白質(zhì)組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學(xué)。labelfree-非標(biāo)定量法分析技術(shù)方法：非標(biāo)定量法[Labelfree]是近年來重要的質(zhì)譜定量方法，通過比較質(zhì)譜分析次數(shù)或質(zhì)譜峰強度，分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化。蛋白質(zhì)非標(biāo)記定量技術(shù)（LabelFree）是通過液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對蛋白質(zhì)酶解肽段進行質(zhì)譜分析，無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標(biāo)簽做內(nèi)部標(biāo)準(zhǔn)，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質(zhì)時所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，比較不同樣品中相應(yīng)肽段的信號強度，從而對肽段對應(yīng)的蛋白質(zhì)進行相對定量。

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法介紹：蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)方法：生物質(zhì)譜：生物質(zhì)譜技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中比較重要的鑒定技術(shù)，其基本原理是樣品分子離子化后，根據(jù)不同離子之間的荷質(zhì)比（M/E）的差異來分離并確定分子量。對于經(jīng)過雙向電泳分離的目標(biāo)蛋白質(zhì)用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵）成肽段，對這些肽段用質(zhì)譜進行鑒定與分析。目前常用的質(zhì)譜包括兩種：基質(zhì)輔助激光解吸電離-飛行時間質(zhì)譜（MALDI-TOF-MS）和電噴霧質(zhì)譜（ESI- MS）。蛋白質(zhì)組學(xué)研究策略有什么？

PRM靶向蛋白質(zhì)組學(xué)：是一種基于Orbitrap為表示的高分辨、高精度質(zhì)譜的離子監(jiān)視技術(shù)，首先利用四級桿質(zhì)量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標(biāo)肽段的母離子，隨后在collisioncell中對母離子進行碎裂，然后利用Orbitrap分析器在二級質(zhì)譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣能夠?qū)δ繕?biāo)蛋白質(zhì)、目標(biāo)肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，即可對目標(biāo)蛋白質(zhì)/肽段進行相對(一定)定量。隨著質(zhì)譜、系統(tǒng)生物學(xué)、生物信息學(xué)等相關(guān)學(xué)科的發(fā)展，我認(rèn)為今后我們會更多地在現(xiàn)實生活中見到蛋白質(zhì)組學(xué)相關(guān)的應(yīng)用。如定量胰島素、鑒定血紅蛋白氨基酸突變（鐮刀形紅細(xì)胞癥）、糖化血紅蛋白比例測定等。從測試體量估計，應(yīng)該遠小于1%的ELISA測試量。蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)有生物質(zhì)譜。深圳新型修飾蛋白組學(xué)質(zhì)譜分析

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)的發(fā)展已經(jīng)成為現(xiàn)代的生物技術(shù)快速發(fā)展的重要支撐。廣東PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)：飛行時間質(zhì)譜：MALDI的基本原理是將分析物分散在基質(zhì)分子（尼古丁酸及其同系物）中并形成晶體，當(dāng)用激光（337nm的氮激光）照射晶體時，基質(zhì)分子吸收激光能量，樣品解吸附，基質(zhì)-樣品之間發(fā)生電荷轉(zhuǎn)移使樣品分子電離。它從固相標(biāo)本中產(chǎn)生離子，并在飛行管中測定其分子量，MALDI-TOF-MS一般用于肽質(zhì)量指紋圖譜，非?？焖伲看畏治鲋恍?~5min），靈敏（達到fmol水平），可以精確測量肽段質(zhì)量，但是如果在分析前不修飾肽段，MALDI-TOF-MS不能給出肽片段的序列。廣東PRM定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法