蛋白質(zhì)組學技術(shù)：等電聚焦：等電聚焦（isoelectricfocusing，IEF）是一種利用有pH梯度的介質(zhì)分離等電點不同的蛋白質(zhì)的電泳技術(shù)。等電聚焦凝膠電泳依據(jù)蛋白質(zhì)分子的靜電荷或等電點進行分離，等電聚焦中，蛋白質(zhì)分子在含有載體兩性電解質(zhì)形成的一個連續(xù)而穩(wěn)定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質(zhì)是脂肪族多氨基多羧酸，在電場中形成正極為酸性，負極為堿性的連續(xù)的pH梯度。蛋白質(zhì)分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷，因此可以在電場中移動；當?shù)鞍踪|(zhì)遷移至其等電點位置時，其靜電荷數(shù)為零，在電場中不再移動，據(jù)此將蛋白質(zhì)分離。蛋白質(zhì)組結(jié)果一般需要做哪些方面的生物信息學分析？湖北TMT／iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學研究
蛋白質(zhì)組學應用領(lǐng)域：1.蛋白質(zhì)鑒定：能夠應用一維電泳和二維電泳并分離相關(guān)的技術(shù)，應用蛋白質(zhì)芯片和抗體芯片及共沉淀等技術(shù)對蛋白質(zhì)停止審定研討。2.修飾：很多mRNA表達產(chǎn)生的蛋白質(zhì)要閱歷后修飾如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。修飾是蛋白質(zhì)調(diào)理功用的重要方式，因而對蛋白質(zhì)后修飾的研討對說明蛋白質(zhì)的功用具有重要作用。3、蛋白質(zhì)功用：如剖析酶活性和酶底物，細胞因子的生物剖析/配基-受體分離剖析。能夠應用基因敲除和反義技術(shù)剖析基因表達產(chǎn)物-蛋白質(zhì)的功用。另外對蛋白質(zhì)表達出來后在細胞內(nèi)的定位研討也在水平上有助于蛋白質(zhì)功用的理解。哈爾濱PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學研究方法蛋白質(zhì)組研究技術(shù)在研究對象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。
蛋白質(zhì)組學植物篇樣品寄樣要求：植物相較于動物，蛋白占比不高，所以送樣在量上面的要求會多一些，推薦送500mg以上的量可以確保實驗能夠提取到充足的蛋白。如果是種仁、豆類等蛋白含量比較高的，200mg足以完成抽提。處理樣本需要用PBS將樣本表面的泥土等雜質(zhì)沖洗干凈，去除掉多余的組織。盡量能夠保證樣本的形態(tài)和純度，不推薦用錫紙包裹，放在EP管中使其形態(tài)完整為比較好。用液氮急速冷凍5min后置于-80℃環(huán)境中保存，送樣時需要添加干冰。
蛋白質(zhì)組學有什么用，能給我實驗帶來什么？可以大規(guī)模鑒定特定組織、細胞等各種樣本的蛋白質(zhì)種類、修飾狀態(tài)以及蛋白質(zhì)之間的相互作用，以及對這些蛋白質(zhì)功能分析、分類；可以對不同條件下某一特定樣本進行大規(guī)模的蛋白質(zhì)(包括翻譯后修飾蛋白)表達量變化分析，篩選潛在biomarker，篩選重要信號通路；依托大樣本量，可以實現(xiàn)疾病的分子分型分析、重要潛在靶標鑒定。質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學和芯片哪個更好出結(jié)果？若有對應物種的全基因組并有預測的全蛋白序列庫，可優(yōu)先選擇全蛋白序列庫；若無全蛋白序列庫，有對應物種對應組織的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果并，可以使用轉(zhuǎn)錄組的測序結(jié)果（mRNA三框翻譯或者預測CDS，并翻譯成氨基酸序列）；若基因組、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫都沒有，優(yōu)先選擇同源性比較接近的物種的全蛋白數(shù)據(jù)庫，若近源物種沒有合適的全蛋白庫，則選擇更大的蛋白全庫（如動物全庫、綠色植物全庫、微生物庫等）。我們通過研究蛋白質(zhì)組，可以為患者提供有用的疾病診斷、預后評估信息。
LabelFree(非標記蛋白質(zhì)組學技術(shù))：在非標記策略的定量模型中，主要涉及兩種不同的算法：其一，以肽段的色譜峰積分面積為基礎(chǔ)，通過比較一對生物樣品中相對應到蛋白質(zhì)酶解多肽的色譜積分面積而得到兩者的相對豐度；其二，以肽段被質(zhì)譜檢測的計數(shù)為基礎(chǔ)，通過歸一化來表征被檢測蛋白質(zhì)的相對豐度。非標記技術(shù)認為肽段在質(zhì)譜中被捕獲檢測的頻率（Counts）與其在混合物中的豐度成正相關(guān)，因此蛋白質(zhì)被質(zhì)譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質(zhì)的豐度，通過適當?shù)臄?shù)學公式可以將質(zhì)譜檢測計數(shù)與蛋白質(zhì)的量聯(lián)系起來，從而對蛋白質(zhì)進行定量。蛋白質(zhì)組的概念與基因組的概念有許多差別。哈爾濱PRM靶向定量蛋白質(zhì)組學研究方法
蛋白質(zhì)組學技術(shù)有生物質(zhì)譜。湖北TMT／iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學研究
蛋白組學常見研究模式主要有兩種：1.通過蛋白質(zhì)組學尋找疾病發(fā)生的發(fā)展的新型標志物；2.結(jié)合其它組學建立疾病或者研究主題的表達譜和分子機制。蛋白質(zhì)組學( proteomics) 是指系統(tǒng)研究某一基因組所表達的所有蛋白質(zhì)，包括組成蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的氨基酸序列，蛋白質(zhì)的豐度，蛋白質(zhì)的修飾以及蛋白質(zhì)之間的相互作用。蛋白質(zhì)組和基因組( genome)在概念上有相關(guān)性，表示某一個蛋白質(zhì)組的蛋白質(zhì)是由基因組所編碼的，然而蛋白質(zhì)組學和基因組學在研究對象和研究方法上有很大的區(qū)別。湖北TMT／iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學研究