貴州修飾蛋白組學項目

來源: 發(fā)布時間:2022-04-20

蛋白質組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質基礎,也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質組比較分析,我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質分子”,它們可成為新藥物設計的分子靶點,或者也會為疾病的早期診斷提供分子標志。確實,那些世界范圍內銷路比較好的藥物本身是蛋白質或其作用靶點為某種蛋白質分子。因此,蛋白質組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作,也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。蛋白質組學的研究是生命科學進入后基因時代的特征。蛋白質組研究是對基因組研究的重要補充。貴州修飾蛋白組學項目

蛋白質組學有什么用,能給我實驗帶來什么?可以大規(guī)模鑒定特定組織、細胞等各種樣本的蛋白質種類、修飾狀態(tài)以及蛋白質之間的相互作用,以及對這些蛋白質功能分析、分類;可以對不同條件下某一特定樣本進行大規(guī)模的蛋白質(包括翻譯后修飾蛋白)表達量變化分析,篩選潛在biomarker,篩選重要信號通路;依托大樣本量,可以實現(xiàn)疾病的分子分型分析、重要潛在靶標鑒定。質譜的蛋白質組學和芯片哪個更好出結果?若有對應物種的全基因組并有預測的全蛋白序列庫,可優(yōu)先選擇全蛋白序列庫;若無全蛋白序列庫,有對應物種對應組織的轉錄組測序結果并,可以使用轉錄組的測序結果(mRNA三框翻譯或者預測CDS,并翻譯成氨基酸序列);若基因組、轉錄組數(shù)據(jù)庫都沒有,優(yōu)先選擇同源性比較接近的物種的全蛋白數(shù)據(jù)庫,若近源物種沒有合適的全蛋白庫,則選擇更大的蛋白全庫(如動物全庫、綠色植物全庫、微生物庫等)。南京蛋白質定量組學質譜分析蛋白質組研究技術涉及到各種重要的生物學現(xiàn)象,如信號轉導、細胞分化、蛋白質折疊等等。

蛋白質組學在生物學領域的研究中的應用是怎樣的?研究對象涉及到生物體且生物體內表達蛋白,理論上都可以應用蛋白質組學。蛋白質組學是以研究生物體蛋白組成及其變化規(guī)律為目的的應用科學。主要使用的儀器為液質聯(lián)用高分辨率質譜儀。詳細來說,蛋白質組學包含許多分支:非標定量蛋白質組學(定性研究生物體的蛋白組成),定量蛋白質組學(對生物體蛋白表達含量進行測定),修飾蛋白質組學(對蛋白質翻譯后修飾進行檢測)及相互作用蛋白質組研究(蛋白質直接相互作用機制解析)等。蛋白質組學屬于后基因組時代的科學研究,針對基因表達產物進行檢測與定量。因此更能反應出生物體生理條件下的水平與狀態(tài)。

PRM靶向蛋白組學:PRM技術是一種根據(jù)已知實測信息或質譜檢測規(guī)律的假定信息對樣品中的蛋白質進行靶向定量的技術。該技術主要應用儀器為QExactive系列質譜儀,首先以四極桿作為質量過濾器,特異性地選擇與預先設定質荷比相同的肽段離子(母離子)通過,隨后在高能碰撞池中碎裂母離子,之后通過Orbitrap分析碎片離子(子離子)得到肽段的二級質譜信息。四極桿的高選擇性離子過濾與Orbitrap高分辨率測量技術的結合使得PRM技術有很高的特異性,并且有效的降低了背景噪音,去除了干擾離子,提高了靈敏度。在確保數(shù)據(jù)質量的前提下,為了在一次分析中檢測更多的蛋白質,可用預置PRM(ScheduledPRM,sPRM)的方法,這種方法需要知道每個肽段的保留時間信息,使得每個肽段只在其洗脫時間窗口內執(zhí)行PRM檢測,很大程度上提高了檢測效率,可同時檢測上百種蛋白質。PRM技術是目前應用較普遍的質譜蛋白質靶向定量技術。蛋白質組學的研究主要促進分子醫(yī)學的發(fā)展。

蛋白質組學技術發(fā)展方面:蛋白質組學的研究方法將出現(xiàn)多種技術并存,各有優(yōu)勢和局限的特點,而難以象基因組研究一樣形成比較一致的方法。除了發(fā)展新方法外,更強調各種方法間的整合和互補,以適應不同蛋白質的不同特征。另外,蛋白質組學與其它學科的交叉也將日益明顯和重要,這種交叉是新技術新方法的活水之源,特別是,蛋白質組學與其它大規(guī)??茖W如基因組學,生物信息學等領域的交叉,構成組學(omics)生物技術研究方法,所呈現(xiàn)出的系統(tǒng)生物學(System Biology)研究模式,將成為未來生命科學比較令人激動的新前沿。蛋白質組的概念指由一個基因組,或一個細胞、組織表達的所有蛋白質。貴州修飾蛋白組學項目

蛋白質組學技術有飛行時間質譜。貴州修飾蛋白組學項目

蛋白質組學與基因組學的差異:蛋白質組和基因組(genome)在概念上有相關性,某一個蛋白質組的蛋白質是由其基因組所編碼的,然而蛋白質組學和基因組學在研究對象和研究方法上有很大的區(qū)別。基因組在所有的細胞中幾乎都是完整的,與之不同,蛋白質組具有很高的細胞和組織特異性,不同的細胞組織表達不同的蛋白質組。蛋白質組的復雜性也遠遠高于基因組,這是因為一個基因≠一個轉錄產物≠一個蛋白質。比如據(jù)估計人的基因組由30000個基因組成,經mRNA剪切和蛋白質翻譯后修飾將產生20萬~200萬個蛋白質。由于不同的轉錄起始和mRNA剪切使同一基因產生了不同的轉錄產物。同樣由于不同的翻譯起始,一個mRNA可以翻譯成不同的蛋白質。貴州修飾蛋白組學項目