蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)：蛋白質(zhì)翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對(duì)翻譯后的蛋白質(zhì)進(jìn)行共價(jià)加工的過程。它通過在一個(gè)或多個(gè)氨基酸殘基加上修飾基團(tuán)，可以改變蛋白質(zhì)的物理、化學(xué)性質(zhì)，進(jìn)而影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象和活性狀態(tài)、亞細(xì)胞定位、折疊及其穩(wěn)定性以及蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的豐度變化在生命活動(dòng)研究中具有重大意義，異常的翻譯后修飾會(huì)導(dǎo)致多種疾病的發(fā)生。質(zhì)譜可以分辨蛋白質(zhì)修飾前和修飾后分子量上的變化，因此只要知道靶蛋白翻譯后修飾前后分子量的變化,就能對(duì)翻譯后修飾方式進(jìn)行鑒定和定量。蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)具有有效性。江蘇蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)
蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學(xué)：血漿蛋白糖基化修飾分析：蛋白質(zhì)糖基化指碳水化合物通過共翻譯或翻譯后修飾的方式附著到蛋白質(zhì)上的過程，是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。分泌的細(xì)胞外蛋白常被糖基化，糖基化蛋白通常是重要的整合膜蛋白。血漿中的蛋白質(zhì)包括維持機(jī)體正常生理狀態(tài)的蛋白質(zhì)和機(jī)體分泌、滲漏、脫落的蛋白質(zhì)，其中不乏存在一些糖基化蛋白質(zhì)。而蛋白質(zhì)糖基化修飾不只影響蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象、生物活性、運(yùn)輸和定位，而且在分子識(shí)別、細(xì)胞通信、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等特定生物過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。因此對(duì)血漿蛋白糖基化進(jìn)行分析，有助于研究血漿蛋白的生理功能等。北京蛋白質(zhì)甲基化修飾組學(xué)研究在細(xì)胞中，乙?；揎椀姆磻?yīng)由乙?；D(zhuǎn)移酶所催化，將乙酰輔酶A的乙酰基轉(zhuǎn)移并添加在蛋白質(zhì)賴氨酸殘基上。
蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學(xué)技術(shù)優(yōu)點(diǎn)：1、全方面性：磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)以整個(gè)細(xì)胞蛋白為研究對(duì)象，研究?jī)?nèi)容包括了細(xì)胞內(nèi)具有生命功能的蛋白，如細(xì)胞增生、細(xì)胞分裂和細(xì)胞分化等相關(guān)蛋白，因而研究更為全方面。2、可靠性：傳統(tǒng)的生物學(xué)研究蛋白質(zhì)磷酸化往往針對(duì)特定條件，以兩個(gè)蛋白或更多蛋白之間的相互作用為出發(fā)點(diǎn)，具有局限性，缺乏整體認(rèn)識(shí)。磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)則可檢測(cè)不同蛋白激酶及磷酸化酶對(duì)同一個(gè)蛋白磷酸化程度的影響，因而結(jié)果具有普遍性和可靠性。3、有效性：磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)反映的是細(xì)胞內(nèi)真實(shí)發(fā)生的事件，在一次試驗(yàn)中考慮了不同變量，克服了生物學(xué)中逐步添加變量的缺陷。4、探索性：磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)以細(xì)胞內(nèi)蛋白為研究對(duì)象，相對(duì)于傳統(tǒng)的生物學(xué)研究以及蛋白質(zhì)芯片，更易發(fā)現(xiàn)未知的新磷酸化位點(diǎn)和磷酸化蛋白質(zhì)。如果可以聯(lián)合生物學(xué)技術(shù)，則可以發(fā)現(xiàn)具有磷酸化或者去磷酸化功能的酶。
蛋白質(zhì)乙?；揎楄b定流程：1. 組織/細(xì)胞破碎，提取、提純目的蛋白質(zhì)。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特異性乙酰化抗體對(duì)乙酰化修飾肽段進(jìn)行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS對(duì)富集的乙?；亩芜M(jìn)行鑒定分析。5. 數(shù)據(jù)分析，并對(duì)鑒定的乙酰化位點(diǎn)的生物學(xué)功能進(jìn)行解釋預(yù)測(cè)。隨著蛋白質(zhì)組研究的發(fā)展，我們?cè)絹碓缴羁痰匾庾R(shí)到，對(duì)于生物體生命活動(dòng)的管理和調(diào)控過程，密切相關(guān)的不只是單個(gè)蛋白質(zhì)層面的修飾狀態(tài)，更重要的是研究蛋白質(zhì)組學(xué)水平研究在翻譯后修飾的動(dòng)態(tài)變化。高質(zhì)、高效的蛋白質(zhì)翻譯后修飾富集技術(shù)和豐富的、準(zhǔn)確的定量手段使得研究蛋白質(zhì)水平的翻譯后修飾組學(xué)成為現(xiàn)實(shí)，借助這些組學(xué)研究手段能夠?qū)崿F(xiàn)不同生理病理狀態(tài)下生物樣本在翻譯后修飾水平上的定量比較，深入地揭示翻譯后修飾水平的波動(dòng)與生物生命活動(dòng)的密切聯(lián)系。在早期的研究中，乙酰化修飾一直被認(rèn)為是真核細(xì)胞所特有的一種翻譯后修飾。
蛋白質(zhì)乙?；揎椊M學(xué)技術(shù)：乙?；揎検求w內(nèi)保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾，對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著重要的作用。此外，還存在的非組蛋白乙酰化修飾參與了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。采用肽段預(yù)分離降低高豐度組蛋白對(duì)蛋白乙酰化鑒定的影響，再結(jié)合免疫共沉淀通過抗體富集乙?；碾亩危瑥亩鴮?shí)現(xiàn)乙?；蔫b定及定量。樣品要求：1、SDS-PAGE條帶：5個(gè)以上可見考染條帶。2、溶液（目標(biāo)蛋白質(zhì)）：目標(biāo)蛋白總量>50μg，目標(biāo)蛋白濃度>80%。3、溶液（大規(guī)?；旌系鞍踪|(zhì)）：蛋白總量>1mg，蛋白濃度>1μg/μl。乙酰化修飾對(duì)細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。廣東琥珀?；揎椀鞍踪|(zhì)組學(xué)質(zhì)譜分析
常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾包括磷酸化。江蘇蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)
蛋白磷酸化檢測(cè)方法：質(zhì)譜檢測(cè)方法優(yōu)勢(shì)：1. 準(zhǔn)確度高，能夠同時(shí)檢測(cè)多個(gè)蛋白的多個(gè)磷酸化位點(diǎn)。2. 適用于大規(guī)模分析蛋白磷酸化水平。3. 不依賴于磷酸化抗體。在實(shí)際應(yīng)用中，Western Blot與質(zhì)譜分析方法各有各的好，誰(shuí)也無法完全被另一種方法所替代。所以在選擇測(cè)定磷酸化修飾的時(shí)候還應(yīng)該根據(jù)具體需要來決定。如果研究的蛋白正好有商業(yè)化的磷酸化抗體，那么lucky you，你可以選擇Western Blot進(jìn)行快速磷酸化測(cè)定研究。但是如果你所研究的蛋白質(zhì)沒有可用的商業(yè)化磷酸抗體，或是抗體價(jià)效過低，亦或是需要大規(guī)模地檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)磷酸化蛋白的水平的話，質(zhì)譜檢測(cè)會(huì)是更好地選擇。江蘇蛋白質(zhì)泛素化修飾組學(xué)
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